如何计算 r 中 glm 的 r 平方
通常,当我们拟合线性回归模型时,我们使用R 平方来评估模型对数据的拟合程度。
R 平方表示响应变量中可由回归模型中的预测变量解释的方差比例。
该数字范围从 0 到 1,值越高表示模型拟合越好。
然而,一般线性模型(例如逻辑回归模型和泊松回归模型)没有R平方值。
相反,我们可以计算一个称为McFadden’s R-Squared 的指标,其范围从 0 到略低于 1,值越高表示模型拟合越好。
我们使用以下公式来计算 McFadden 的 R 平方:
McFadden 的 R 平方 = 1 –(对数似然模型/零对数似然)
金子:
- 对数似然模型:当前拟合模型的对数似然值
- 零对数似然:零模型的对数似然值(仅具有截距的模型)
在实践中,高于 0.40 的值表明模型非常适合数据。
以下示例演示如何计算 R 中逻辑回归模型的 McFadden R 平方。
示例:计算 R 中的 McFadden R 平方
对于此示例,我们将使用 ISLR 包中的默认数据集。我们可以使用以下代码来加载并显示数据集的摘要:
#install and load ISLR package install. packages (' ISLR ') library (ISLR) #define dataset data <- ISLR::Default #view summary of dataset summary(data) default student balance income No:9667 No:7056 Min. : 0.0 Min. : 772 Yes: 333 Yes:2944 1st Qu.: 481.7 1st Qu.:21340 Median: 823.6 Median: 34553 Mean: 835.4 Mean: 33517 3rd Qu.:1166.3 3rd Qu.:43808 Max. :2654.3 Max. :73554 #find total observations in dataset nrow(data) [1] 10000
该数据集包含 10,000 人的以下信息:
- 违约:表明个人是否违约。
- 学生:表明个人是否是学生。
- 余额:个人持有的平均余额。
- 收入:个人的收入。
我们将使用学生身份、银行余额和收入来构建逻辑回归模型,预测给定个人违约的概率:
#fit logistic regression model model <- glm(default~student+balance+income, family=' binomial ', data=data) #view model summary summary(model) Call: glm(formula = default ~ balance + student + income, family = "binomial", data = data) Deviance Residuals: Min 1Q Median 3Q Max -2.4691 -0.1418 -0.0557 -0.0203 3.7383 Coefficients: Estimate Std. Error z value Pr(>|z|) (Intercept) -1.087e+01 4.923e-01 -22.080 < 2e-16 *** balance 5.737e-03 2.319e-04 24.738 < 2e-16 *** studentYes -6.468e-01 2.363e-01 -2.738 0.00619 ** income 3.033e-06 8.203e-06 0.370 0.71152 --- Significant. codes: 0 '***' 0.001 '**' 0.01 '*' 0.05 '.' 0.1 ' ' 1 (Dispersion parameter for binomial family taken to be 1) Null deviance: 2920.6 on 9999 degrees of freedom Residual deviance: 1571.5 on 9996 degrees of freedom AIC: 1579.5 Number of Fisher Scoring iterations: 8
接下来,我们将使用以下公式计算该模型的 McFadden R 平方值:
#calculate McFadden's R-squared for model with(summary(model), 1 - deviance/null. deviance ) [1] 0.4619194
McFadden 的 R 平方值为0.4619194 。这个值相当高,表明我们的模型与数据拟合得很好,具有很高的预测能力。
另请注意,我们还可以使用pscl包中的pR2()函数来计算模型的 McFadden R 平方值:
#install and load pscl package install. packages (' pscl ') library (pscl) #calculate McFadden's R-squared for model pR2(model)[' McFadden '] McFadden 0.4619194
请注意,该值与之前计算的值相对应。
其他资源
以下教程解释了如何在 R 中执行其他常见任务: