如何计算 r 中的标准化残差
残差是回归模型中观测值与预测值之间的差异。
计算方法如下:
残差 = 观测值 – 预测值
如果我们绘制观测值并叠加拟合回归线,则每个观测值的残差将是观测值与回归线之间的垂直距离:
我们经常用来识别回归模型中的异常值的一种残差称为标准化残差。
计算方法如下:
r i = e i / s(e i ) = e i / RSE√ 1-h ii
金子:
- e i :第 i个残基
- RSE:模型的残差标准误差
- h ii :第 i 个观测值的上升
在实践中,我们经常将绝对值大于 3 的任何标准化残差视为异常值。
本教程提供了如何在 R 中计算标准化残差的分步示例。
第 1 步:输入数据
首先,我们将创建一个在 R 中使用的小数据集:
#create data data <- data.frame(x=c(8, 12, 12, 13, 14, 16, 17, 22, 24, 26, 29, 30), y=c(41, 42, 39, 37, 35, 39, 45, 46, 39, 49, 55, 57)) #viewdata data xy 1 8 41 2 12 42 3 12 39 4 13 37 5 14 35 6 16 39 7 17 45 8 22 46 9 24 39 10 26 49 11 29 55 12 30 57
步骤 2:拟合回归模型
接下来,我们将使用lm()函数来拟合一个简单的线性回归模型:
#fit model model <- lm(y ~ x, data=data) #view model summary summary(model) Call: lm(formula = y ~ x, data = data) Residuals: Min 1Q Median 3Q Max -8.7578 -2.5161 0.0292 3.3457 5.3268 Coefficients: Estimate Std. Error t value Pr(>|t|) (Intercept) 29.6309 3.6189 8.188 9.6e-06 *** x 0.7553 0.1821 4.148 0.00199 ** --- Significant. codes: 0 '***' 0.001 '**' 0.01 '*' 0.05 '.' 0.1 ' ' 1 Residual standard error: 4.442 on 10 degrees of freedom Multiple R-squared: 0.6324, Adjusted R-squared: 0.5956 F-statistic: 17.2 on 1 and 10 DF, p-value: 0.001988
步骤 3:计算标准化残差
接下来,我们将使用内置函数rstandard()来计算模型的标准化残差:
#calculate the standardized residuals standard_res <- rstandard(model) #view the standardized residuals standard_res 1 2 3 4 5 6 1.40517322 0.81017562 0.07491009 -0.59323342 -1.24820530 -0.64248883 7 8 9 10 11 12 0.59610905 -0.05876884 -2.11711982 -0.06655600 0.91057211 1.26973888
如果我们愿意,我们可以将标准化残差添加到原始数据框中:
#column bind standardized residuals back to original data frame final_data <- cbind(data, standard_res) #view data frame xy standard_res 1 8 41 1.40517322 2 12 42 0.81017562 3 12 39 0.07491009 4 13 37 -0.59323342 5 14 35 -1.24820530 6 16 39 -0.64248883 7 17 45 0.59610905 8 22 46 -0.05876884 9 24 39 -2.11711982 10 26 49 -0.06655600 11 29 55 0.91057211 12 30 57 1.26973888
然后,我们可以根据标准化残差对每个观测值从最大到最小进行排序,以了解哪些观测值最接近异常值:
#sort standardized residuals descending
final_data[ order (-standard_res),]
xy standard_res
1 8 41 1.40517322
12 30 57 1.26973888
11 29 55 0.91057211
2 12 42 0.81017562
7 17 45 0.59610905
3 12 39 0.07491009
8 22 46 -0.05876884
10 26 49 -0.06655600
4 13 37 -0.59323342
6 16 39 -0.64248883
5 14 35 -1.24820530
9 24 39 -2.11711982
从结果中我们可以看到,没有一个标准化残差的绝对值超过 3。因此,没有一个观测值看起来是异常值。
步骤 4:可视化标准化残差
最后,我们可以创建一个散点图来可视化预测变量值与标准化残差的关系:
#plot predictor variable vs. standardized residuals
plot(final_data$x, standard_res, ylab=' Standardized Residuals ', xlab=' x ')
#add horizontal line at 0
abline(0, 0)