如何修复：do_one(nmeth) 中的错误：外部函数调用中的 na/nan/inf (arg 1)

在 R 中您可能遇到的错误是：

 Error in do_one(nmeth): NA/NaN/Inf in foreign function call (arg 1)

当您尝试在 R 中执行 k 均值聚类，但您使用的数据框有一个或多个缺失值时，就会出现此错误。

本教程准确解释了如何修复此错误。

如何重现错误

假设 R 中有以下数据框，第二行有缺失值：

 #create data frame
df <- data. frame (var1=c(2, 4, 4, 6, 7, 8, 8, 9, 9, 12),
                 var2=c(12, 14, 14, 8, 8, 15, 16, 9, 9, 11),
                 var3=c(22, NA, 23, 24, 28, 23, 19, 16, 12, 15))

row. names (df) <- LETTERS[1:10]

#view data frame
df

  var1 var2 var3
At 2 12 22
B 4 14 NA
C 4 14 23
D 6 8 24
E 7 8 28
F 8 15 23
G 8 16 19
H 9 9 16
I 9 9 12
D 12 11 15

如果我们尝试使用kmeans()函数对此数据框执行 k-means 聚类，我们将收到错误：

 #attempt to perform k-means clustering with k = 3 clusters
km <- kmeans(df, centers = 3 )

Error in do_one(nmeth): NA/NaN/Inf in foreign function call (arg 1)

如何修复错误

修复此错误的最简单方法是简单地使用na.omit()函数从数据框中删除缺失值的行：

 #remove rows with NA values
df <- na. omitted (df)

#perform k-means clustering with k = 3 clusters
km <- kmeans(df, centers = 3)

#view results
km

K-means clustering with 3 clusters of sizes 4, 3, 2

Cluster means:
  var1 var2 var3
1 5.5 14.250000 21.75000
2 10.0 9.666667 14.33333
3 6.5 8.000000 26.00000

Vector clustering:
ACDEFGHIJ
1 1 3 3 1 1 2 2 2 

Within cluster sum of squares by cluster:
[1] 46.50000 17.33333 8.50000
 (between_SS / total_SS = 79.5%)

Available components:

[1] "cluster" "centers" "totss" "withinss" "tot.withinss"
[6] "betweenss" "size" "iter" "ifault"

请注意，一旦我们从数据框中删除了缺失值的行，k 均值聚类算法就会成功运行。

奖励： R 中 k 均值聚类的完整分步指南

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