如何使用 ggplot2 绘制 roc 曲线(附示例)
逻辑回归是一种统计方法,当响应变量是二元时,我们用它来拟合回归模型。为了评估逻辑回归模型对数据集的拟合程度,我们可以查看以下两个指标:
- 敏感性:当结果实际上是积极的时,模型预测观察结果为积极的概率。
- 特异性:当结果实际上为负时,模型预测观察结果为负的概率。
可视化这两个指标的一个简单方法是创建ROC 曲线,它是显示逻辑回归模型的敏感性和特异性的图表。
本教程介绍如何使用 ggplot2 可视化包在 R 中创建和解释 ROC 曲线。
示例:使用 ggplot2 的 ROC 曲线
假设我们在 R 中拟合以下逻辑回归模型:
#load Default dataset from ISLR book data <- ISLR::Default #divide dataset into training and test set set.seed(1) sample <- sample(c( TRUE , FALSE ), nrow (data), replace = TRUE , prob =c(0.7,0.3)) train <- data[sample, ] test <- data[!sample, ] #fit logistic regression model to training set model <- glm(default~student+balance+income, family=" binomial ", data=train) #use model to make predictions on test set predicted <- predict(model, test, type=" response ")
为了可视化逻辑回归模型在测试集上的性能,我们可以使用pROC 包中的ggroc()函数创建 ROC 图:
#load necessary packages library (ggplot2) library (pROC) #define object to plot rocobj <- roc(test$default, predicted) #create ROC plot ggroc(rocobj)
y 轴显示模型的敏感性(真阳性率),x 轴显示模型的特异性(真阴性率)。
请注意,我们可以向绘图添加样式,并提供包含绘图 AUC(曲线下面积)的标题:
#load necessary packages library (ggplot2) library (pROC) #define object to plot and calculate AUC rocobj <- roc(test$default, predicted) auc <- round (auc(test$default, predicted), 4 ) #create ROC plot ggroc(rocobj, color = ' steelblue ', size = 2 ) + ggtitle( paste0 (' ROC Curve ', ' (AUC = ', auc, ' ) '))
请注意,您还可以修改情节的主题:
#create ROC plot with minimal theme ggroc(rocobj, color = ' steelblue ', size = 2 ) + ggtitle( paste0 (' ROC Curve ', ' (AUC = ', auc, ' ) ')) + theme_minimal()
请参阅本文以获取最佳 ggplot2 主题指南。