{"id":2659,"date":"2023-07-21T07:12:29","date_gmt":"2023-07-21T07:12:29","guid":{"rendered":"https:\/\/statorials.org\/de\/bray-curtis-unahnlichkeit-in-r\/"},"modified":"2023-07-21T07:12:29","modified_gmt":"2023-07-21T07:12:29","slug":"bray-curtis-unahnlichkeit-in-r","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/statorials.org\/de\/bray-curtis-unahnlichkeit-in-r\/","title":{"rendered":"So berechnen sie die bray-curtis-un\u00e4hnlichkeit in r"},"content":{"rendered":"<p><\/p>\n<hr>\n<p><span style=\"color: #000000;\"><a href=\"https:\/\/statorials.org\/de\/bray-curtis-unahnlichkeit\/\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">Die Bray-Curtis-Un\u00e4hnlichkeit<\/a> ist eine M\u00f6glichkeit, die Un\u00e4hnlichkeit zwischen zwei verschiedenen Standorten zu messen.<\/span><\/p>\n<p> <span style=\"color: #000000;\">In der \u00d6kologie und Biologie wird es h\u00e4ufig verwendet, um den Unterschied zwischen zwei Standorten hinsichtlich der dort vorkommenden Arten zu quantifizieren.<\/span><\/p>\n<p> <span style=\"color: #000000;\">Es wird wie folgt berechnet:<\/span><\/p>\n<p> <span style=\"color: #000000;\"><strong>BC <sub>ij<\/sub> = 1 \u2013 (2*C <sub>ij<\/sub> ) \/ (S <sub>i<\/sub> + S <sub>j<\/sub> )<\/strong><\/span><\/p>\n<p> <span style=\"color: #000000;\">Gold:<\/span><\/p>\n<ul>\n<li> <span style=\"color: #000000;\"><strong>C <sub>ij<\/sub> :<\/strong> Die Summe der niedrigsten Werte f\u00fcr die an jedem Standort gefundenen Arten.<\/span><\/li>\n<li> <span style=\"color: #000000;\"><strong>S <sub>i<\/sub> :<\/strong> Die Gesamtzahl der am Standort <em>i<\/em> gez\u00e4hlten Exemplare<\/span><\/li>\n<li> <span style=\"color: #000000;\"><strong>S <sub>j<\/sub> :<\/strong> Die Gesamtzahl der am Standort <em>j<\/em> gez\u00e4hlten Exemplare<\/span><\/li>\n<\/ul>\n<p> <span style=\"color: #000000;\">Die Bray-Curtis-Un\u00e4hnlichkeit liegt immer zwischen 0 und 1, wobei:<\/span><\/p>\n<ul>\n<li> <span style=\"color: #000000;\"><strong>0<\/strong> gibt an, dass zwei Standorte keine Un\u00e4hnlichkeit aufweisen. Mit anderen Worten: Sie haben von jeder Artenart genau die gleiche Anzahl.<\/span><\/li>\n<li> <span style=\"color: #000000;\"><strong>1<\/strong> zeigt an, dass zwei Standorte v\u00f6llig unterschiedlich sind. Mit anderen Worten, es gibt keine gemeinsame Art derselben Art.<\/span><\/li>\n<\/ul>\n<p> <span style=\"color: #000000;\">Angenommen, ein Botaniker geht los und z\u00e4hlt die Anzahl von f\u00fcnf verschiedenen Pflanzenarten (A, B, C, D und E) an zwei verschiedenen Standorten.<\/span><\/p>\n<p> <span style=\"color: #000000;\">Die folgende Tabelle fasst die von ihr gesammelten Daten zusammen:<\/span> <\/p>\n<p><img decoding=\"async\" loading=\"lazy\" class=\"aligncenter wp-image-15115 \" src=\"https:\/\/statorials.org\/wp-content\/uploads\/2023\/08\/bray_curtis.png\" alt=\"\" width=\"423\" height=\"121\" srcset=\"\" sizes=\"\"><\/p>\n<p> <span style=\"color: #000000;\">Anhand dieser Daten kann sie die Bray-Curtis-Un\u00e4hnlichkeit wie folgt berechnen:<\/span> <\/p>\n<p><img decoding=\"async\" loading=\"lazy\" class=\"aligncenter wp-image-15116 \" src=\"https:\/\/statorials.org\/wp-content\/uploads\/2023\/08\/bray_curtis2.png\" alt=\"Bray-Curtis-Unterschied\" width=\"419\" height=\"226\" srcset=\"\" sizes=\"\"><\/p>\n<p> <span style=\"color: #000000;\">Durch Integration dieser Zahlen in die Bray-Curtis-Un\u00e4hnlichkeitsformel erhalten wir:<\/span><\/p>\n<ul>\n<li> <span style=\"color: #000000;\">BC <sub>ij<\/sub> = 1 \u2013 (2*C <sub>ij<\/sub> ) \/ (S <sub>i<\/sub> + S <sub>j<\/sub> )<\/span><\/li>\n<li> <span style=\"color: #000000;\">BC <sub>ij<\/sub> = 1 \u2013 (2*15) \/ (21 + 24)<\/span><\/li>\n<li> <span style=\"color: #000000;\">BC <sub>ij<\/sub> = 0,33<\/span><\/li>\n<\/ul>\n<p> <span style=\"color: #000000;\">Die Bray-Curtis-Un\u00e4hnlichkeit zwischen diesen beiden Standorten betr\u00e4gt <strong>0,33<\/strong> .<\/span><\/p>\n<p> <span style=\"color: #000000;\">Das folgende Beispiel zeigt, wie die Bray-Curtis-Un\u00e4hnlichkeit in R berechnet wird.<\/span><\/p>\n<h3> <span style=\"color: #000000;\"><strong>Beispiel: Berechnung der Bray-Curtis-Un\u00e4hnlichkeit in R<\/strong><\/span><\/h3>\n<p> <span style=\"color: #000000;\">Erstellen wir zun\u00e4chst den folgenden Datenrahmen in R, um unsere Datenwerte zu speichern:<\/span><\/p>\n<pre style=\"background-color: #ececec; font-size: 15px;\"> <strong><span style=\"color: #008080;\">#create data frame\n<\/span>df &lt;- data. <span style=\"color: #3366ff;\">frame<\/span> (A=c(4, 3),\n                 B=c(0, 6),\n                 C=c(2, 0),\n                 D=c(7, 4),\n                 E=c(8, 11))\n\n<span style=\"color: #008080;\">#view data frame\n<\/span>df\n\n  A B C D E\n1 4 0 2 7 8\n2 3 6 0 4 11<\/strong><\/pre>\n<p> <span style=\"color: #000000;\">Mit dem folgenden Code k\u00f6nnen wir die Bray-Curtis-Un\u00e4hnlichkeit zwischen den beiden Zeilen im Datenrahmen berechnen:<\/span><\/p>\n<pre style=\"background-color: #ececec; font-size: 15px;\"> <strong><span style=\"color: #008080;\">#calculate Bray\u2013Curtis dissimilarity\n<\/span>sum( <span style=\"color: #3366ff;\">apply<\/span> (df, 2, <span style=\"color: #3366ff;\">function<\/span> (x) <span style=\"color: #3366ff;\">abs<\/span> ( <span style=\"color: #3366ff;\">max<\/span> (x)- <span style=\"color: #3366ff;\">min<\/span> (x)))) \/ <span style=\"color: #3366ff;\">sum<\/span> ( <span style=\"color: #3366ff;\">rowSums<\/span> (df))\n\n[1] 0.3333333\n<\/strong><\/pre>\n<p> <span style=\"color: #000000;\">Der Bray-Curtis f\u00e4llt anders aus <strong>0,33<\/strong> .<\/span><\/p>\n<p> <span style=\"color: #000000;\">Dies entspricht dem Wert, den wir zuvor manuell berechnet haben.<\/span><\/p>\n<p> <span style=\"color: #000000;\"><strong>Hinweis<\/strong> : Diese Formel funktioniert nur, wenn jede Zeile im Datenrahmen eine separate Site darstellt.<\/span><\/p>\n<h3> <span style=\"color: #000000;\"><strong>Zus\u00e4tzliche Ressourcen<\/strong><\/span><\/h3>\n<p> <span style=\"color: #000000;\">Die folgenden Tutorials erkl\u00e4ren, wie man andere \u00c4hnlichkeitsmetriken in R berechnet:<\/span><\/p>\n<p> <a href=\"https:\/\/statorials.org\/de\/jaccard-ahnlichkeit-in-r\/\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">So berechnen Sie die Jaccard-\u00c4hnlichkeit in R<\/a><br \/> <a href=\"https:\/\/statorials.org\/de\/kosinusahnlichkeit-r\/\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">So berechnen Sie die Kosinus\u00e4hnlichkeit in R<\/a><\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>Die Bray-Curtis-Un\u00e4hnlichkeit ist eine M\u00f6glichkeit, die Un\u00e4hnlichkeit zwischen zwei verschiedenen Standorten zu messen. 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