Cara menghitung dffits di r
Dalam statistik, kita sering kali ingin mengetahui pengaruh observasi yang berbeda terhadap model regresi.
Salah satu cara untuk menghitung pengaruh observasi adalah dengan menggunakan metrik yang dikenal sebagai DFFITS , yang merupakan singkatan dari “difference in fit.”
Metrik ini memberi tahu kita seberapa besar perubahan prediksi yang dibuat oleh model regresi ketika kita menghilangkan observasi individual.
Tutorial ini menunjukkan contoh langkah demi langkah cara menghitung dan memvisualisasikan DFFITS untuk setiap observasi dalam model di R.
Langkah 1: Buat model regresi
Pertama, kita akan membuat model regresi linier berganda menggunakan kumpulan data mtcars yang ada di R:
#load the dataset data(mtcars) #fit a regression model model <- lm(mpg~disp+hp, data=mtcars) #view model summary summary(model) Coefficients: Estimate Std. Error t value Pr(>|t|) (Intercept) 30.735904 1.331566 23.083 < 2nd-16 *** available -0.030346 0.007405 -4.098 0.000306 *** hp -0.024840 0.013385 -1.856 0.073679 . --- Significant. codes: 0 '***' 0.001 '**' 0.01 '*' 0.05 '.' 0.1 ' ' 1 Residual standard error: 3.127 on 29 degrees of freedom Multiple R-squared: 0.7482, Adjusted R-squared: 0.7309 F-statistic: 43.09 on 2 and 29 DF, p-value: 2.062e-09
Langkah 2: Hitung DFFITS untuk setiap observasi
Selanjutnya, kita akan menggunakan fungsi dffits() bawaan untuk menghitung nilai DFFITS untuk setiap observasi dalam model:
#calculate DFFITS for each observation in the model dffits <- as . data . frame (dffits(model)) #display DFFITS for each observation challenges dffits(model) Mazda RX4 -0.14633456 Mazda RX4 Wag -0.14633456 Datsun 710 -0.19956440 Hornet 4 Drive 0.11540062 Hornet Sportabout 0.32140303 Valiant -0.26586716 Duster 360 0.06282342 Merc 240D -0.03521572 Merc 230 -0.09780612 Merc 280 -0.22680622 Merc 280C -0.32763355 Merc 450SE -0.09682952 Merc 450SL -0.03841129 Merc 450SLC -0.17618948 Cadillac Fleetwood -0.15860270 Lincoln Continental -0.15567627 Chrysler Imperial 0.39098449 Fiat 128 0.60265798 Honda Civic 0.35544919 Toyota Corolla 0.78230167 Toyota Corona -0.25804885 Dodge Challenger -0.16674639 AMC Javelin -0.20965432 Camaro Z28 -0.08062828 Pontiac Firebird 0.67858692 Fiat X1-9 0.05951528 Porsche 914-2 0.09453310 Lotus Europa 0.55650363 Ford Pantera L 0.31169050 Ferrari Dino -0.29539098 Maserati Bora 0.76464932 Volvo 142E -0.24266054
Biasanya, kita melihat lebih dekat observasi dengan nilai DFFITS di atas ambang batas 2√ p/n dimana:
- p : Jumlah variabel prediktor yang digunakan dalam model
- n : Jumlah observasi yang digunakan dalam model
Dalam contoh ini, ambang batasnya adalah 0.5 :
#find number of predictors in model p <- length (model$coefficients)-1 #find number of observations n <- nrow (mtcars) #calculate DFFITS threshold value thresh <- 2* sqrt (p/n) thresh [1] 0.5
Kita dapat mengurutkan observasi berdasarkan nilai DFFITSnya untuk melihat apakah ada yang melebihi ambang batas:
#sort observations by DFFITS, descending dffits[ order (-dffits[' dffits(model) ']), ] [1] 0.78230167 0.76464932 0.67858692 0.60265798 0.55650363 0.39098449 [7] 0.35544919 0.32140303 0.31169050 0.11540062 0.09453310 0.06282342 [13] 0.05951528 -0.03521572 -0.03841129 -0.08062828 -0.09682952 -0.09780612 [19] -0.14633456 -0.14633456 -0.15567627 -0.15860270 -0.16674639 -0.17618948 [25] -0.19956440 -0.20965432 -0.22680622 -0.24266054 -0.25804885 -0.26586716 [31] -0.29539098 -0.32763355
Kita dapat melihat bahwa lima observasi pertama memiliki nilai DFFITS lebih besar dari 0,5, yang berarti kita mungkin ingin mempelajari observasi ini lebih dekat untuk menentukan apakah observasi tersebut mempunyai pengaruh yang besar terhadap model.
Langkah 3: Visualisasikan DFFITS untuk setiap observasi
Terakhir, kita dapat membuat grafik cepat untuk memvisualisasikan DFFITS untuk setiap observasi:
#plot DFFITS values for each observation plot(dffits(model), type = ' h ') #add horizontal lines at absolute values for threshold abline(h = thresh, lty = 2) abline(h = -thresh, lty = 2)
Sumbu x menampilkan indeks setiap observasi dalam dataset dan nilai y menampilkan nilai DFFITS yang sesuai untuk setiap observasi.
Sumber daya tambahan
Cara melakukan regresi linier sederhana di R
Cara melakukan regresi linier berganda di R
Cara menghitung statistik leverage di R
Cara membuat plot sisa di R