Come eseguire il test esatto di fisher in r

Il test esatto di Fisher viene utilizzato per determinare se esiste o meno un’associazione significativa tra due variabili categoriali.

Viene generalmente utilizzato come alternativa al test di indipendenza chi quadrato quando uno o più conteggi di celle in una tabella 2 × 2 sono inferiori a 5.

Il test esatto di Fisher utilizza le seguenti ipotesi nulle e alternative:

• H ₀ : (ipotesi nulla) Le due variabili sono indipendenti.
• H _A : (ipotesi alternativa) Le due variabili non sono indipendenti.

L’esempio seguente mostra come eseguire il test esatto di Fisher in R.

Esempio: test esatto di Fisher in R

Per eseguire il test esatto di Fisher in R, è semplicemente necessario un set di dati 2 × 2.

Ad esempio, generiamo un set di dati 2×2 da utilizzare come esempio:

 #create 2x2 dataset
data = matrix(c(2,5,9,4), nrow = 2 )

#view dataset
data
#2 9
#5 4

Per eseguire il test esatto di Fisher, utilizziamo semplicemente il seguente codice:

 fisher. test (data)

Ciò produce il seguente risultato:

Nel test esatto di Fisher, l’ipotesi nulla è che le due colonne siano indipendenti (o, equivalentemente, che il rapporto odd sia uguale a 1).

Per determinare se le due colonne sono indipendenti, possiamo guardare il valore p del test.

In questo caso, il valore p è 0,1597 , il che ci dice che non abbiamo prove sufficienti per rifiutare l’ipotesi nulla.

Non possiamo quindi affermare che vi sia una differenza statisticamente significativa tra le due colonne.

Nota che il rapporto odd è 0,1957871. Poiché il valore p del test è 0,1597, ciò ci dice che l’odds ratio non è significativamente diverso da 1.

Il risultato del test ci fornisce anche un intervallo di confidenza del 95% per l’odds ratio, che è:

Intervallo di confidenza al 95% per l’odds ratio: (0,0130943, 1,8397543)

Poiché il numero 1 è in questo rapporto, ciò conferma che il rapporto odd non è significativamente diverso da 1 (assumendo di utilizzare il livello alfa di 0,05).

Risorse addizionali

I seguenti tutorial forniscono ulteriori informazioni sul test esatto di Fisher:

Un’introduzione al test esatto di Fisher
Calcolatore online per il test esatto di Fisher
Come riportare i risultati accurati dei test Fisher