Come risolvere: errore in colmeans(x, na.rm = true): 'x' deve essere numerico

Un messaggio di errore che potresti riscontrare quando usi R è:

 Error in colMeans(x, na.rm = TRUE): 'x' must be numeric

Questo errore si verifica in genere quando si tenta di utilizzare la funzione prcomp() per eseguire l’analisi dei componenti principali in R , quando una o più colonne nel frame di dati in uso non sono numeriche.

Esistono due modi per aggirare questo errore:

Metodo 1: convertire colonne non numeriche in colonne numeriche

Metodo 2: rimuovere le colonne non numeriche dal frame di dati

Gli esempi seguenti mostrano come utilizzare ciascun metodo nella pratica.

Come riprodurre l’errore

Supponiamo di provare a eseguire l’analisi delle componenti principali sul seguente frame di dati che contiene una colonna di caratteri:

 #create data frame
df <- data. frame (team=c('A', 'A', 'C', 'B', 'C', 'B', 'B', 'C', 'A'),
                 points=c(12, 8, 26, 25, 38, 30, 24, 24, 15),
                 rebounds=c(10, 4, 5, 5, 4, 3, 8, 18, 22))

#view data frame
df

  team points rebounds
1 to 12 10
2 to 8 4
3 C 26 5
4 B 25 5
5 C 38 4
6 B 30 3
7 B 24 8
8 C 24 18
9 to 15 22

#attempt to calculate principal components
prcomp(df)

Error in colMeans(x, na.rm = TRUE): 'x' must be numeric

La colonna del team è una colonna di caratteri, che causa un errore quando si tenta di utilizzare la funzione prcomp() .

Metodo 1: convertire colonne non numeriche in colonne numeriche

Un modo per evitare questo errore è convertire la colonna del team in una colonna numerica prima di utilizzare la funzione prcomp() :

 #convert character column to numeric
df$team <- as. numeric (as. factor (df$team))

#view updated data frame
df

  team points rebounds
1 1 12 10
2 1 8 4
3 3 26 5
4 2 25 5
5 3 38 4
6 2 30 3
7 2 24 8
8 3 24 18
9 1 15 22

#calculate main components
prcomp(df)

Standard deviations (1, .., p=3):
[1] 9.8252704 6.0990235 0.4880538

Rotation (nxk) = (3 x 3):
                 PC1 PC2 PC3
team -0.06810285 0.04199272 0.99679417
points -0.91850806 0.38741460 -0.07907512
rebounds 0.38949319 0.92094872 -0.01218661

Questa volta non riceviamo alcun errore perché ogni colonna nel frame di dati è numerica.

Metodo 2: rimuovere le colonne non numeriche dal frame di dati

Un altro modo per evitare l’errore è semplicemente rimuovere tutte le colonne non numeriche dal frame di dati prima di utilizzare la funzione prcomp() :

 #remove non-numeric columns from data frame
df_new <- df[ , unlist(lapply(df, is. numeric ))]

#view new data frame
df_new

  rebound points
1 12 10
2 8 4
3 26 5
4 25 5
5 38 4
6 30 3
7 24 8
8 24 18
9 15 22

#calculate main components
prcomp(df_new)

Standard deviations (1, .., p=2):
[1] 9.802541 6.093638

Rotation (nxk) = (2 x 2):
                PC1 PC2
points 0.9199431 0.3920519
rebounds -0.3920519 0.9199431

Ancora una volta, non riceviamo alcun errore perché ogni colonna nel frame di dati è numerica.

Nota : nella maggior parte dei casi, il primo metodo è la soluzione preferita perché utilizza tutti i dati anziché rimuovere determinate colonne.

Risorse addizionali

I seguenti tutorial spiegano come correggere altri errori comuni in R:

Come risolvere in R: gli argomenti coinvolgono un numero diverso di righe
Come risolvere in R: errore nella selezione di argomenti inutilizzati
Come riparare in R: la sostituzione ha lunghezza zero