{"id":1241,"date":"2023-07-27T04:19:56","date_gmt":"2023-07-27T04:19:56","guid":{"rendered":"https:\/\/statorials.org\/it\/correzione-bonferroni-al-r\/"},"modified":"2023-07-27T04:19:56","modified_gmt":"2023-07-27T04:19:56","slug":"correzione-bonferroni-al-r","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/statorials.org\/it\/correzione-bonferroni-al-r\/","title":{"rendered":"Come eseguire una correzione bonferroni in r"},"content":{"rendered":"<p><\/p>\n<hr>\n<p><span style=\"color: #000000;\"><a href=\"https:\/\/statorials.org\/it\/anova-in-un-modo\/\" target=\"_blank\" rel=\"noopener noreferrer\">Un&#8217;ANOVA unidirezionale<\/a> viene utilizzata per determinare se esiste o meno una differenza statisticamente significativa tra le medie di tre o pi\u00f9 gruppi indipendenti.<\/span><\/p>\n<p> <span style=\"color: #000000;\">Se il valore p complessivo della tabella ANOVA \u00e8 inferiore a un certo livello di significativit\u00e0, allora abbiamo prove sufficienti per affermare che almeno una delle medie del gruppo \u00e8 diversa dalle altre.<\/span><\/p>\n<p> <span style=\"color: #000000;\">Tuttavia, questo non ci dice <em>quali<\/em> gruppi siano diversi gli uni dagli altri. Questo ci dice semplicemente che non tutte le medie dei gruppi sono uguali.<\/span><\/p>\n<p> <span style=\"color: #000000;\">Per sapere esattamente quali gruppi sono diversi l&#8217;uno dall&#8217;altro, dobbiamo eseguire test t a coppie tra ciascun gruppo<\/span> <span style=\"color: #000000;\">controllando il <a href=\"https:\/\/statorials.org\/it\/tasso-di-errore-familiare\/\" target=\"_blank\" rel=\"noopener noreferrer\">tasso di errore familiare<\/a> .<\/span><\/p>\n<p> <span style=\"color: #000000;\">Uno dei modi pi\u00f9 comuni per ottenere ci\u00f2 \u00e8 utilizzare <strong>la correzione Bonferroni<\/strong> quando si calcolano i valori p per ciascuno dei test t a coppie.<\/span><\/p>\n<p> <span style=\"color: #000000;\">Questo tutorial spiega come eseguire la correzione Bonferroni in R.<\/span><\/p>\n<h3> <span style=\"color: #000000;\"><strong>Esempio: correzione Bonferroni in R<\/strong><\/span><\/h3>\n<p> <span style=\"color: #000000;\">Supponiamo che un insegnante voglia sapere se tre diverse tecniche di studio portano o meno a punteggi diversi nei test tra gli studenti.<\/span><\/p>\n<p> <span style=\"color: #000000;\">Per testarlo, assegna in modo casuale 10 studenti a utilizzare ciascuna tecnica di studio.<\/span> <span style=\"color: #000000;\">Dopo una settimana di utilizzo della tecnica di studio assegnata, ogni studente sostiene lo stesso esame.<\/span><\/p>\n<p> <span style=\"color: #000000;\">Possiamo utilizzare i seguenti passaggi in R per adattare un&#8217;ANOVA unidirezionale e utilizzare la correzione Bonferroni per calcolare le differenze a coppie tra i risultati dell&#8217;esame di ciascun gruppo.<\/span><\/p>\n<p> <strong><span style=\"color: #000000;\">Passaggio 1: crea il set di dati.<\/span><\/strong><\/p>\n<p> <span style=\"color: #000000;\">Il codice seguente mostra come creare un set di dati contenente i risultati degli esami di tutti i 30 studenti:<\/span><\/p>\n<pre style=\"background-color: #ececec; font-size: 15px;\"> <strong><span style=\"color: #008080;\">#create data frame<\/span>\ndata &lt;- data.frame(technique = <span style=\"color: #3366ff;\">rep<\/span> (c(\"tech1\", \"tech2\", \"tech3\"), <span style=\"color: #3366ff;\">each<\/span> = <span style=\"color: #008000;\">10<\/span> ),\n                   score = c(76, 77, 77, 81, 82, 82, 83, 84, 85, 89,\n                             81, 82, 83, 83, 83, 84, 87, 90, 92, 93,\n                             77, 78, 79, 88, 89, 90, 91, 95, 95, 98))\n\n<span style=\"color: #008080;\">#view first six rows of data frame<\/span>\nhead(data)\n\n  technical score\n1 tech1 76\n2 tech1 77\n3 tech1 77\n4 tech1 81\n5 tech1 82\n6 tech1 82\n<\/strong><\/pre>\n<p> <strong><span style=\"color: #000000;\">Passaggio 2: visualizza i risultati dell&#8217;esame per ciascun gruppo.<\/span><\/strong><\/p>\n<p> <span style=\"color: #000000;\">Il codice seguente mostra come produrre boxplot per visualizzare la distribuzione dei risultati degli esami per ciascun gruppo:<\/span> <\/p>\n<pre style=\"background-color: #ececec; font-size: 15px;\"> <strong>boxplot(score ~ technique,\n        data = data,\n        main = \"Exam Scores by Studying Technique\",\n        xlab = \"Studying Technique\",\n        ylab = \"Exam Scores\",\n        col = \"steelblue\",\n        border = \"black\")\n<\/strong><\/pre>\n<p><img decoding=\"async\" loading=\"lazy\" class=\"aligncenter wp-image-12294\" src=\"https:\/\/statorials.org\/wp-content\/uploads\/2023\/08\/bonf1.png\" alt=\"Correzione Bonferroni in R\" width=\"411\" height=\"410\" srcset=\"\" sizes=\"\"><\/p>\n<p> <strong><span style=\"color: #000000;\">Passaggio 3: eseguire un&#8217;ANOVA unidirezionale.<\/span><\/strong><\/p>\n<p> <span style=\"color: #000000;\">Il codice seguente mostra come eseguire un&#8217;ANOVA unidirezionale per verificare le differenze tra i punteggi medi degli esami in ciascun gruppo:<\/span><\/p>\n<pre style=\"background-color: #ececec; font-size: 15px;\"> <strong><span style=\"color: #008080;\">#fit the one-way ANOVA model<\/span>\nmodel &lt;- aov(score ~ technique, data = data)\n\n<span style=\"color: #008080;\">#view model output\n<\/span>summary(model)\n\n            Df Sum Sq Mean Sq F value Pr(&gt;F)  \ntechnical 2 211.5 105.73 3.415 0.0476 *\nResiduals 27 836.0 30.96                 \n---\nSignificant. codes: 0 '***' 0.001 '**' 0.01 '*' 0.05 '.' 0.1 ' ' 1<\/strong><\/pre>\n<p> <span style=\"color: #000000;\">Poich\u00e9 il valore p complessivo ( <strong>0,0476<\/strong> ) \u00e8 inferiore a 0,05, ci\u00f2 indica che ciascun gruppo non ha lo stesso punteggio medio dell&#8217;esame.<\/span><\/p>\n<p> <span style=\"color: #000000;\">Successivamente, eseguiremo t-test a coppie utilizzando la correzione Bonferroni per i valori p per calcolare le differenze a coppie tra i risultati degli esami di ciascun gruppo.<\/span><\/p>\n<p> <span style=\"color: #000000;\"><strong>Passaggio 4: eseguire test t a coppie.<\/strong><\/span><\/p>\n<p> <span style=\"color: #000000;\">Per eseguire t-test a coppie con correzione Bonferroni in R, possiamo utilizzare la <a href=\"https:\/\/www.rdocumentation.org\/packages\/stats\/versions\/3.6.2\/topics\/pairwise.t.test\" target=\"_blank\" rel=\"noopener noreferrer\">funzionepairwise.t.test()<\/a> , che utilizza la seguente sintassi:<\/span><\/p>\n<p> <span style=\"color: #000000;\"><strong>pairwise.t.test(x, g, p.adjust.method=&#8221;bonferroni&#8221;)<\/strong><\/span><\/p>\n<p> <span style=\"color: #000000;\">Oro:<\/span><\/p>\n<ul>\n<li> <span style=\"color: #000000;\"><strong>x:<\/strong> un vettore numerico di valori di risposta<\/span><\/li>\n<li> <span style=\"color: #000000;\"><strong>g:<\/strong> Un vettore che specifica i nomi dei gruppi (es. tecnica di studio)<\/span><\/li>\n<\/ul>\n<p> <span style=\"color: #000000;\">Il codice seguente mostra come utilizzare questa funzione per il nostro esempio:<\/span><\/p>\n<pre style=\"background-color: #ececec; font-size: 15px;\"> <strong><span style=\"color: #008080;\">#perform pairwise t-tests with Bonferroni's correction<\/span>\npairwise.t.test(data$score, data$technique, p.adjust.method=\" <span style=\"color: #008000;\">bonferroni<\/span> \")\n\n\tPairwise comparisons using t tests with pooled SD \n\ndata: data$score and data$technique \n\n      tech1 tech2\ntech2 0.309 -    \ntech3 0.048 1.000\n\nP value adjustment method: bonferroni<\/strong><\/pre>\n<p> <span style=\"color: #000000;\">Il modo di interpretare il risultato \u00e8 il seguente:<\/span><\/p>\n<ul>\n<li> <span style=\"color: #000000;\">Il valore p aggiustato per la differenza media nei punteggi degli esami tra la Tecnica 1 e la Tecnica 2 \u00e8 <strong>0,309<\/strong> .<\/span><\/li>\n<li> <span style=\"color: #000000;\">Il valore p aggiustato per la differenza media nei punteggi degli esami tra la Tecnica 1 e la Tecnica 3 \u00e8 <strong>0,048<\/strong> .<\/span><\/li>\n<li> <span style=\"color: #000000;\">Il valore p aggiustato per la differenza media nei punteggi degli esami tra la Tecnica 2 e la Tecnica 3 \u00e8 <strong>1000<\/strong> .<\/span><\/li>\n<\/ul>\n<p> <span style=\"color: #000000;\">Sulla base dei risultati, possiamo vedere che l\u2019unica differenza significativa \u00e8 tra la tecnica 1 e la tecnica 3.<\/span><\/p>\n<h3> <span style=\"color: #000000;\"><strong>Risorse addizionali<\/strong><\/span><\/h3>\n<p> <a href=\"https:\/\/statorials.org\/it\/anova-in-un-modo\/\" target=\"_blank\" rel=\"noopener noreferrer\">Un&#8217;introduzione all&#8217;ANOVA unidirezionale<\/a><br \/> <a href=\"https:\/\/statorials.org\/it\/solo-andata-anova-r\/\" target=\"_blank\" rel=\"noopener noreferrer\">Come eseguire l&#8217;ANOVA unidirezionale in R<\/a><br \/> <a href=\"https:\/\/statorials.org\/it\/prova-di-tacchino-r\/\" target=\"_blank\" rel=\"noopener noreferrer\">Come eseguire il test di Tukey in R<\/a><br \/> <a href=\"https:\/\/statorials.org\/it\/test-di-dunnett-r\/\" target=\"_blank\" rel=\"noopener noreferrer\">Come eseguire il test di Dunnett in R<\/a><\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>Un&#8217;ANOVA unidirezionale viene utilizzata per determinare se esiste o meno una differenza statisticamente significativa tra le medie di tre o pi\u00f9 gruppi indipendenti. 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