{"id":1542,"date":"2023-07-25T23:14:40","date_gmt":"2023-07-25T23:14:40","guid":{"rendered":"https:\/\/statorials.org\/it\/dissolvenza-trama-altman-r\/"},"modified":"2023-07-25T23:14:40","modified_gmt":"2023-07-25T23:14:40","slug":"dissolvenza-trama-altman-r","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/statorials.org\/it\/dissolvenza-trama-altman-r\/","title":{"rendered":"Come creare un grafico bland-altman in r (passo dopo passo)"},"content":{"rendered":"

<\/p>\n

\n

Un diagramma di Bland-Altman<\/a> viene utilizzato per visualizzare le differenze di misurazione tra due diversi strumenti o due diverse tecniche di misurazione.<\/span><\/p>\n

\u00c8 utile per determinare quanto siano simili due strumenti o tecniche nel misurare lo stesso concetto.<\/span><\/p>\n

Questo tutorial fornisce un esempio passo passo di come creare un grafico Bland-Altman in R.<\/span><\/p>\n

Passaggio 1: creare i dati<\/strong><\/span><\/h3>\n

Supponiamo che un biologo utilizzi due strumenti diversi (A e B) per misurare il peso in grammi dello stesso set di 20 rane diverse.<\/span><\/p>\n

Creeremo il seguente frame di dati in R che rappresenta il peso di ciascuna rana, misurato da ciascuno strumento:<\/span><\/p>\n

 #create data<\/span>\ndf <- data. frame<\/span> (A=c(5, 5, 5, 6, 6, 7, 7, 7, 8, 8, 9,\n                     10, 11, 13, 14, 14, 15, 18, 22, 25),\n                 B=c(4, 4, 5, 5, 5, 7, 8, 6, 9, 7, 7, 11,\n                     13, 13, 12, 13, 14, 19, 19, 24))\n\n#view first six rows of data\n<\/span>head(df)\n\n  AB\n1 5 4\n2 5 4\n3 5 5\n4 6 5\n5 6 5\n6 7 7<\/strong><\/pre>\n
 Passaggio 2: calcolare la differenza nelle misurazioni<\/strong><\/span><\/h3>\n
 Successivamente, creeremo due nuove colonne nel frame dati contenenti la misurazione media di ciascuna rana e la differenza nelle misurazioni:<\/span><\/p>\n
 #create new column for average measurement<\/span>\ndf$avg <- rowMeans(df) \n<\/span>\n#create new column for difference in measurements\ndf$diff <- df$A - df$B<\/span><\/span>\n\n#view first six rows of data\n<\/span>head(df)\n\n  AB avg diff\n1 5 4 4.5 1\n2 5 4 4.5 1\n3 5 5 5.0 0\n4 6 5 5.5 1\n5 6 5 5.5 1\n6 7 7 7.0 0\n<\/strong><\/pre>\n
 Passaggio 3: calcolare la differenza media e l’intervallo di confidenza<\/strong><\/span><\/h3>\n
 Successivamente, calcoleremo la differenza media nelle misurazioni tra i due strumenti nonch\u00e9 i limiti superiore e inferiore dell’intervallo di confidenza al 95% per la differenza media:<\/span><\/p>\n
 #find average difference<\/span>\nmean_diff <- mean(df$diff)\n\nmean_diff\n\n[1] 0.5\n<\/span>\n#find lower 95% confidence interval limits\nlower <- mean_diff - 1.96*sd(df$diff)<\/span>\n\nlower\n\n[1] -1.921465\n<\/span>\n#find upper 95% confidence interval limits\nupper <- mean_diff + 1.96*sd(df$diff)<\/span>\n\nupper<\/span>\n\n[1] 2.921465\n<\/span><\/span><\/strong><\/pre>\n
 La differenza media risulta essere 0,5<\/strong> e l’intervallo di confidenza al 95% per la differenza media \u00e8 [-1,921, 2,921]<\/strong> .<\/span><\/p>\n
 Passaggio 4: creare il diagramma Bland-Altman<\/strong><\/span><\/h3>\n
 Successivamente, utilizzeremo il codice seguente per creare un grafico Bland-Altman utilizzando il pacchetto di visualizzazione dei dati ggplot2<\/a> :<\/span><\/span> <\/p>\n
 #load ggplot2\n<\/span><\/span>library<\/span> (ggplot2)\n\n#create Bland-Altman plot\n<\/span>ggplot(df, aes<\/span> (x = avg, y = diff)) +\n  geom_point(size=2) +\n  geom_hline(yintercept = mean_diff) +\n  geom_hline(yintercept = lower, color = \" red<\/span> \", linetype=\" dashed<\/span> \") +\n  geom_hline(yintercept = upper, color = \" red<\/span> \", linetype=\" dashed<\/span> \") +\n  ggtitle(\" Bland-Altman Plot<\/span> \") +\n  ylab(\" Difference Between Measurements<\/span> \") +\n  xlab(\" Average Measurement<\/span> \")<\/span><\/strong> <\/pre>\n
\"Trama<\/p>\n
 L’asse x del grafico mostra la misurazione media dei due strumenti e l’asse y mostra la differenza nelle misurazioni tra i due strumenti.<\/span><\/p>\n
 La linea nera rappresenta la differenza media nelle misurazioni tra i due strumenti mentre le due linee tratteggiate rosse rappresentano i limiti dell’intervallo di confidenza al 95% per la differenza media.<\/span><\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"
Un diagramma di Bland-Altman viene utilizzato per visualizzare le differenze di misurazione tra due diversi strumenti o due diverse tecniche di misurazione. \u00c8 utile per determinare quanto siano simili due strumenti o tecniche nel misurare lo stesso concetto. Questo tutorial fornisce un esempio passo passo di come creare un grafico Bland-Altman in R. 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