{"id":1578,"date":"2023-07-25T19:20:47","date_gmt":"2023-07-25T19:20:47","guid":{"rendered":"https:\/\/statorials.org\/it\/anova-nella-r-nidificata\/"},"modified":"2023-07-25T19:20:47","modified_gmt":"2023-07-25T19:20:47","slug":"anova-nella-r-nidificata","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/statorials.org\/it\/anova-nella-r-nidificata\/","title":{"rendered":"Come eseguire l&#39;anova nidificata in r (passo dopo passo)"},"content":{"rendered":"<p><\/p>\n<hr>\n<p><span style=\"color: #000000;\"><a href=\"https:\/\/statorials.org\/it\/anova-nidificata\/\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">Un&#8217;ANOVA annidata<\/a> \u00e8 un tipo di ANOVA (\u201canalisi della varianza\u201d) in cui almeno un fattore \u00e8 <em>annidato<\/em> all&#8217;interno di un altro fattore.<\/span><\/p>\n<p> <span style=\"color: #000000;\">Ad esempio, supponiamo che un ricercatore voglia sapere se tre diversi fertilizzanti producono diversi livelli di crescita delle piante.<\/span><\/p>\n<p> <span style=\"color: #000000;\">Per testarlo, tre tecnici diversi cospargono ciascuno il fertilizzante A su quattro piante, altri tre tecnici cospargono ciascuno il fertilizzante B su quattro piante e altri tre tecnici cospargono ciascuno il fertilizzante C su quattro piante.<\/span><\/p>\n<p> <span style=\"color: #000000;\">In questo scenario, la <a href=\"https:\/\/statorials.org\/it\/variabili-risposte-esplicative\/\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">variabile di risposta<\/a> \u00e8 la crescita delle piante e i due fattori sono tecnico e fertilizzante. Si scopre che il tecnico \u00e8 <em>immerso<\/em> nel fertilizzante:<\/span> <\/p>\n<p><img decoding=\"async\" loading=\"lazy\" class=\"aligncenter wp-image-15679 \" src=\"https:\/\/statorials.org\/wp-content\/uploads\/2023\/08\/imbrique1-1.png\" alt=\"Esempio di ANOVA nidificato\" width=\"677\" height=\"167\" srcset=\"\" sizes=\"\"><\/p>\n<p> <span style=\"color: #000000;\">Il seguente esempio passo passo mostra come eseguire questa ANOVA annidata in R.<\/span><\/p>\n<h3> <span style=\"color: #000000;\"><strong>Passaggio 1: creare i dati<\/strong><\/span><\/h3>\n<p> <span style=\"color: #000000;\">Innanzitutto, creiamo un data frame per contenere i nostri dati in R:<\/span><\/p>\n<pre style=\"background-color: #ececec; font-size: 15px;\"> <strong><span style=\"color: #008080;\">#create data\n<\/span>df &lt;- data. <span style=\"color: #3366ff;\">frame<\/span> (growth=c(13, 16, 16, 12, 15, 16, 19, 16, 15, 15, 12, 15,\n                          19, 19, 20, 22, 23, 18, 16, 18, 19, 20, 21, 21,\n                          21, 23, 24, 22, 25, 20, 20, 22, 24, 22, 25, 26),\n                 fertilizer=c(rep(c(' <span style=\"color: #ff0000;\">A<\/span> ', ' <span style=\"color: #ff0000;\">B<\/span> ', ' <span style=\"color: #ff0000;\">C<\/span> '), each= <span style=\"color: #008000;\">12<\/span> )),\n                 tech=c(rep(1:9, each= <span style=\"color: #008000;\">4<\/span> )))\n\n<span style=\"color: #008080;\">#view first six rows of data\n<\/span>head(df)\n\n  growth fertilizer tech\n1 13 A 1\n2 16 A 1\n3 16 A 1\n4 12 A 1\n5 15 A 2\n6 16 A 2<\/strong><\/pre>\n<h3> <span style=\"color: #000000;\"><strong>Passaggio 2: regolare l&#8217;ANOVA nidificato<\/strong><\/span><\/h3>\n<p> <span style=\"color: #000000;\">Possiamo usare la seguente sintassi per adattare un&#8217;ANOVA nidificata in R:<\/span><\/p>\n<p> <span style=\"color: #000000;\"><strong>aov(risposta ~ fattore A \/ fattore B)<\/strong><\/span><\/p>\n<p> <span style=\"color: #000000;\">Oro:<\/span><\/p>\n<ul>\n<li> <span style=\"color: #000000;\"><strong>risposta:<\/strong> la variabile di risposta<\/span><\/li>\n<li> <span style=\"color: #000000;\"><strong>fattore A:<\/strong> il primo fattore<\/span><\/li>\n<li> <span style=\"color: #000000;\"><strong>fattore B:<\/strong> il secondo fattore annidato nel primo fattore<\/span><\/li>\n<\/ul>\n<p> <span style=\"color: #000000;\">Il codice seguente mostra come adattare l&#8217;ANOVA nidificata per il nostro set di dati:<\/span><\/p>\n<pre style=\"background-color: #ececec; font-size: 15px;\"> <strong><span style=\"color: #008080;\">#fit nested ANOVA\n<\/span>nest &lt;- aov(df$growth ~ df$fertilizer \/ factor(df$tech))\n\n<span style=\"color: #008080;\">#view summary of nested ANOVA\n<\/span>summary(nest)\n\n                              Df Sum Sq Mean Sq F value Pr(&gt;F)    \ndf$fertilizer 2 372.7 186.33 53.238 4.27e-10 ***\ndf$fertilizer:factor(df$tech) 6 31.8 5.31 1.516 0.211    \nResiduals 27 94.5 3.50                     \n---\nSignificant. codes: 0 '***' 0.001 '**' 0.01 '*' 0.05 '.' 0.1 ' ' 1<\/strong><\/pre>\n<h3> <span style=\"color: #000000;\"><strong>Passaggio 3: interpretare il risultato<\/strong><\/span><\/h3>\n<p> <span style=\"color: #000000;\">Possiamo osservare la colonna del valore p per determinare se ciascun fattore ha o meno un effetto statisticamente significativo sulla crescita delle piante.<\/span><\/p>\n<p> <span style=\"color: #000000;\">Dalla tabella sopra, possiamo vedere che il fertilizzante ha un effetto statisticamente significativo sulla crescita delle piante (valore p &lt; 0,05), ma il tecnico no (valore p = 0,211).<\/span><\/p>\n<p> <span style=\"color: #000000;\">Questo ci dice che se vogliamo aumentare la crescita delle piante, dobbiamo concentrarci sul fertilizzante utilizzato piuttosto che sul singolo tecnico che applica il fertilizzante.<\/span><\/p>\n<h3> <span style=\"color: #000000;\"><strong>Passaggio 4: visualizzare i risultati<\/strong><\/span><\/h3>\n<p> <span style=\"color: #000000;\">Infine, possiamo utilizzare i boxplot per visualizzare la distribuzione della crescita delle piante per fertilizzante e per tecnico:<\/span> <\/p>\n<pre style=\"background-color: #ececec; font-size: 15px;\"> <strong><span style=\"color: #008080;\">#load ggplot2 data visualization package\n<\/span><span style=\"color: #993300;\">library<\/span> (ggplot2)\n\n<span style=\"color: #008080;\">#create boxplots to visualize plant growth\n<\/span>ggplot(df, <span style=\"color: #3366ff;\">aes<\/span> (x=factor(tech), y=growth, fill=fertilizer)) +\n  geom_boxplot()\n<\/strong><\/pre>\n<p><img decoding=\"async\" loading=\"lazy\" class=\"aligncenter wp-image-15690 \" src=\"https:\/\/statorials.org\/wp-content\/uploads\/2023\/08\/imbriquer1.png\" alt=\"\" width=\"429\" height=\"427\" srcset=\"\" sizes=\"\"><\/p>\n<p> <span style=\"color: #000000;\">Il grafico mostra che esiste una variazione significativa nella crescita tra i tre diversi fertilizzanti, ma non cos\u00ec tanta variazione tra i tecnici all&#8217;interno di ciascun gruppo di fertilizzanti.<\/span><\/p>\n<p> <span style=\"color: #000000;\">Ci\u00f2 sembra corrispondere ai risultati dell\u2019ANOVA nidificata e conferma che i fertilizzanti hanno un effetto significativo sulla crescita delle piante, ma i singoli tecnici no.<\/span><\/p>\n<h3> <span style=\"color: #000000;\"><strong>Risorse addizionali<\/strong><\/span><\/h3>\n<p> <a href=\"https:\/\/statorials.org\/it\/solo-andata-anova-r\/\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">Come eseguire l&#8217;ANOVA unidirezionale in R<\/a><br \/> <a href=\"https:\/\/statorials.org\/it\/anova-ra-a-due-vie\/\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">Come eseguire l&#8217;ANOVA bidirezionale in R<\/a><br \/><a href=\"https:\/\/statorials.org\/it\/misurazioni-ripetute-anova-in-r\/\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">Come eseguire l&#8217;ANOVA a misure ripetute in R<\/a><\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>Un&#8217;ANOVA annidata \u00e8 un tipo di ANOVA (\u201canalisi della varianza\u201d) in cui almeno un fattore \u00e8 annidato all&#8217;interno di un altro fattore. Ad esempio, supponiamo che un ricercatore voglia sapere se tre diversi fertilizzanti producono diversi livelli di crescita delle piante. 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