{"id":2140,"date":"2023-07-23T12:53:51","date_gmt":"2023-07-23T12:53:51","guid":{"rendered":"https:\/\/statorials.org\/it\/r-non-definito-a-causa-delle-singolarita\/"},"modified":"2023-07-23T12:53:51","modified_gmt":"2023-07-23T12:53:51","slug":"r-non-definito-a-causa-delle-singolarita","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/statorials.org\/it\/r-non-definito-a-causa-delle-singolarita\/","title":{"rendered":"Come risolvere in r: indefinito a causa delle singolarit\u00e0"},"content":{"rendered":"<p><\/p>\n<hr>\n<p><span style=\"color: #000000;\">Un messaggio di errore che potresti incontrare in R \u00e8:<\/span><\/p>\n<pre style=\"background-color: #ececec; font-size: 15px;\"> <strong>Coefficients: (1 not defined because of singularities) \n<\/strong><\/pre>\n<p> <span style=\"color: #000000;\">Questo messaggio di errore si verifica quando si adatta un modello utilizzando la funzione <strong>glm()<\/strong> in R e due o pi\u00f9 variabili predittive hanno una relazione lineare esatta tra loro, nota come <a href=\"https:\/\/statorials.org\/it\/multicollinearite-perfetta\/\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">multicollinearit\u00e0 perfetta<\/a> .<\/span><\/p>\n<p> <span style=\"color: #000000;\"><span style=\"color: #000000;\">Per correggere questo errore, puoi utilizzare la funzione <strong>cor()<\/strong> per identificare le variabili nel tuo set di dati che hanno una perfetta correlazione tra loro e rimuovere semplicemente una di queste variabili dal modello di regressione.<\/span><\/span><\/p>\n<p> <span style=\"color: #000000;\">Questo tutorial spiega come gestire in pratica questo messaggio di errore.<\/span><\/p>\n<h3> <strong>Come riprodurre l&#8217;errore<\/strong><\/h3>\n<p> <span style=\"color: #000000;\">Supponiamo di adattare un <a href=\"https:\/\/statorials.org\/it\/regressione-logistica-1\/\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">modello di regressione logistica<\/a> al seguente frame di dati in R:<\/span><\/p>\n<pre style=\"background-color: #ececec; font-size: 15px;\"> <span style=\"color: #000000;\"><strong><span style=\"color: #008080;\">#define data\n<\/span>df &lt;- data. <span style=\"color: #3366ff;\">frame<\/span> (y = c(0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1),\n                 x1 = c(3, 3, 4, 4, 3, 2, 5, 8, 9, 9, 9, 8, 9, 9, 9),\n                 x2 = c(6, 6, 8, 8, 6, 4, 10, 16, 18, 18, 18, 16, 18, 18, 18),\n                 x3 = c(4, 7, 7, 3, 8, 9, 9, 8, 7, 8, 9, 4, 9, 10, 13))\n\n<span style=\"color: #008080;\">#fit logistic regression model\n<\/span>model &lt;- glm(y~x1+x2+x3, data=df, family=binomial)\n\n<span style=\"color: #008080;\">#view model summary\n<\/span>summary(model)\n\nCall:\nglm(formula = y ~ x1 + x2 + x3, family = binomial, data = df)\n\nDeviance Residuals: \n       Min 1Q Median 3Q Max  \n-1.372e-05 -2.110e-08 2.110e-08 2.110e-08 1.575e-05  \n\nCoefficients: (1 not defined because of singularities)\n              Estimate Std. Error z value Pr(&gt;|z|)\n(Intercept) -75.496 176487.031 0.000 1\nx1 14.546 24314.459 0.001 1\nx2 NA NA NA NA\nx3 -2.258 20119.863 0.000 1\n\n(Dispersion parameter for binomial family taken to be 1)\n\n    Null deviance: 2.0728e+01 on 14 degrees of freedom\nResidual deviance: 5.1523e-10 on 12 degrees of freedom\nAIC: 6\n\nNumber of Fisher Scoring iterations: 24\n<\/strong><\/span><\/pre>\n<p> <span style=\"color: #000000;\">Si noti che appena prima dell&#8217;output del coefficiente, riceviamo il messaggio:<\/span><\/p>\n<pre style=\"background-color: #ececec; font-size: 15px;\"> <span style=\"color: #000000;\"><strong>Coefficients: (1 not defined because of singularities)\n<\/strong><\/span><\/pre>\n<p> <span style=\"color: #000000;\">Ci\u00f2 indica che due o pi\u00f9 variabili predittive nel modello hanno una relazione lineare perfetta e pertanto non tutti i coefficienti di regressione nel modello possono essere stimati.<\/span><\/p>\n<p> <span style=\"color: #000000;\">Ad esempio, si noti che non \u00e8 possibile effettuare stime di coefficienti per la variabile predittrice <strong>x <sub>2<\/sub><\/strong> .<\/span><\/p>\n<h3> <span style=\"color: #000000;\"><strong>Come gestire l&#8217;errore<\/strong><\/span><\/h3>\n<p> <span style=\"color: #000000;\">Per identificare quali variabili predittive causano questo errore, possiamo utilizzare la funzione <strong>cor()<\/strong> per produrre una <a href=\"https:\/\/statorials.org\/it\/come-leggere-una-matrice-di-correlazione\/\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">matrice di correlazione<\/a> ed esaminare quali variabili hanno una correlazione esattamente pari a <strong>1<\/strong> tra loro:<\/span><\/p>\n<pre style=\"background-color: #ececec; font-size: 15px;\"> <span style=\"color: #000000;\"><strong><span style=\"color: #008080;\">#create correlation matrix<\/span>\ncor(df)\n\n           y x1 x2 x3\ny 1.0000000 0.9675325 0.9675325 0.3610320\nx1 0.9675325 1.0000000 1.0000000 0.3872889\nx2 0.9675325 1.0000000 1.0000000 0.3872889\nx3 0.3610320 0.3872889 0.3872889 1.0000000\n<\/strong><\/span><\/pre>\n<p> <span style=\"color: #000000;\">Dalla matrice di correlazione possiamo vedere che le variabili <strong>x <sub>1<\/sub><\/strong> e <strong>x <sub>2<\/sub><\/strong> sono perfettamente correlate.<\/span><\/p>\n<p> <span style=\"color: #000000;\">Per risolvere questo errore, possiamo semplicemente rimuovere una di queste due variabili dal modello, poich\u00e9 in realt\u00e0 non forniscono informazioni univoche o indipendenti nel modello di regressione.<\/span><\/p>\n<p> <span style=\"color: #000000;\">Ad esempio, supponiamo di rimuovere <strong>x <sub>2<\/sub><\/strong> e di adattare il seguente modello di regressione logistica:<\/span><\/p>\n<pre style=\"background-color: #ececec; font-size: 15px;\"> <span style=\"color: #000000;\"><strong><span style=\"color: #008080;\">#fit logistic regression model\n<\/span>model &lt;- glm(y~x1+x3, data=df, family=binomial)\n\n<span style=\"color: #008080;\">#view model summary\n<\/span>summary(model)\n\nCall:\nglm(formula = y ~ x1 + x3, family = binomial, data = df)\n\nDeviance Residuals: \n       Min 1Q Median 3Q Max  \n-1.372e-05 -2.110e-08 2.110e-08 2.110e-08 1.575e-05  \n\nCoefficients:\n              Estimate Std. Error z value Pr(&gt;|z|)\n(Intercept) -75.496 176487.031 0.000 1\nx1 14.546 24314.459 0.001 1\nx3 -2.258 20119.863 0.000 1\n\n(Dispersion parameter for binomial family taken to be 1)\n\n    Null deviance: 2.0728e+01 on 14 degrees of freedom\nResidual deviance: 5.1523e-10 on 12 degrees of freedom\nAIC: 6\n\nNumber of Fisher Scoring iterations: 24<\/strong><\/span><\/pre>\n<p> <span style=\"color: #000000;\">Tieni presente che questa volta non riceviamo un messaggio di errore &#8220;indefinito a causa di singolarit\u00e0&#8221;.<\/span><\/p>\n<p> <span style=\"color: #000000;\"><strong>Nota<\/strong> : non importa se rimuoviamo x <sub>1<\/sub> o x <sub>2<\/sub> . Il modello finale conterr\u00e0 la stessa stima del coefficiente per la variabile che decidi di mantenere e la bont\u00e0 di adattamento complessiva del modello sar\u00e0 la stessa.<\/span><\/p>\n<h3> <span style=\"color: #000000;\"><strong>Risorse addizionali<\/strong><\/span><\/h3>\n<p> <span style=\"color: #000000;\">I seguenti tutorial spiegano come gestire altri errori in R:<\/span><\/p>\n<p> Come risolvere il problema in R: formula modello non valida in ExtractVars<br \/> <a href=\"https:\/\/statorials.org\/it\/largomento-r-non-e-numerico-o-logico\/\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">Come risolvere in R: l&#8217;argomento non \u00e8 n\u00e9 numerico n\u00e9 logico: return na<\/a><br \/> <a href=\"https:\/\/statorials.org\/it\/randomforest-na-nan-inf-nella-chiamata-di-funzione-esterna\/\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">Come risolvere: randomForest.default(m, y, \u2026): Na\/NaN\/Inf nella chiamata di funzione esterna<\/a><\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>Un messaggio di errore che potresti incontrare in R \u00e8: Coefficients: (1 not defined because of singularities) Questo messaggio di errore si verifica quando si adatta un modello utilizzando la funzione glm() in R e due o pi\u00f9 variabili predittive hanno una relazione lineare esatta tra loro, nota come multicollinearit\u00e0 perfetta . 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