{"id":4300,"date":"2023-07-12T04:44:09","date_gmt":"2023-07-12T04:44:09","guid":{"rendered":"https:\/\/statorials.org\/it\/correlazione-dei-panda-con-valore-p\/"},"modified":"2023-07-12T04:44:09","modified_gmt":"2023-07-12T04:44:09","slug":"correlazione-dei-panda-con-valore-p","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/statorials.org\/it\/correlazione-dei-panda-con-valore-p\/","title":{"rendered":"Come trovare il valore p del coefficiente di correlazione nei panda"},"content":{"rendered":"<p><\/p>\n<hr>\n<p><span style=\"color: #000000;\"><a href=\"https:\/\/statorials.org\/it\/coefficiente-di-correlazione-di-pearson-1\/\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">Il coefficiente di correlazione di Pearson<\/a> pu\u00f2 essere utilizzato per misurare l&#8217;associazione lineare tra due variabili.<\/span><\/p>\n<p> <span style=\"color: #000000;\">Questo coefficiente di correlazione assume sempre un valore compreso tra <strong>-1<\/strong> e <strong>1<\/strong> dove:<\/span><\/p>\n<ul>\n<li> <span style=\"color: #000000;\"><strong>-1<\/strong> : correlazione lineare perfettamente negativa tra due variabili.<\/span><\/li>\n<li> <span style=\"color: #000000;\"><strong>0<\/strong> : Nessuna correlazione lineare tra due variabili.<\/span><\/li>\n<li> <span style=\"color: #000000;\"><strong>1:<\/strong> Correlazione lineare perfettamente positiva tra due variabili.<\/span><\/li>\n<\/ul>\n<p> <span style=\"color: #000000;\">Per determinare se un coefficiente di correlazione \u00e8 statisticamente significativo, \u00e8 possibile calcolare il punteggio t e il valore p corrispondenti.<\/span><\/p>\n<p> <span style=\"color: #000000;\">La formula per calcolare il t-score di un coefficiente di correlazione (r) \u00e8:<\/span><\/p>\n<p> <span style=\"color: #000000;\">t = r\u221a <span style=\"border-top: 1px solid black;\">n-2<\/span> \/ \u221a <span style=\"border-top: 1px solid black;\">1-r <sup>2<\/sup><\/span><\/span><\/p>\n<p> <span style=\"color: #000000;\">Il valore p viene calcolato come il corrispondente valore p a due code per la distribuzione t con n-2 gradi di libert\u00e0.<\/span><\/p>\n<p> <span style=\"color: #000000;\">Per calcolare il valore p di un coefficiente di correlazione di Pearson nei panda, puoi utilizzare la funzione <strong>Pearsonr()<\/strong> dalla libreria <strong>SciPy<\/strong> :<\/span><\/p>\n<pre style=\"background-color: #ececec; font-size: 15px;\"> <strong><span style=\"color: #008000;\">from<\/span> scipy. <span style=\"color: #3366ff;\">stats<\/span> <span style=\"color: #008000;\">import<\/span> pearsonr\n\npearsonr(df[' <span style=\"color: #ff0000;\">column1<\/span> '], df[' <span style=\"color: #ff0000;\">column2<\/span> '])\n<\/strong><\/pre>\n<p> <span style=\"color: #000000;\">Questa funzione restituir\u00e0 il coefficiente di correlazione di Pearson tra le colonne <strong>colonna1<\/strong> e <strong>colonna2<\/strong> insieme al corrispondente valore p che ci dice se il coefficiente di correlazione \u00e8 statisticamente significativo o meno.<\/span><\/p>\n<p> <span style=\"color: #000000;\">Se desideri calcolare il valore p per il coefficiente di correlazione Pearson di ogni possibile combinazione di colonne a coppie in un DataFrame, puoi utilizzare la seguente funzione personalizzata per farlo:<\/span><\/p>\n<pre style=\"background-color: #ececec; font-size: 15px;\"> <span style=\"color: #000000;\"><strong><span style=\"color: #008000;\">def<\/span> r_pvalues(df):\n    cols = pd. <span style=\"color: #3366ff;\">DataFrame<\/span> (columns= <span style=\"color: #3366ff;\">df.columns<\/span> )\n    p = cols. <span style=\"color: #3366ff;\">transpose<\/span> (). <span style=\"color: #3366ff;\">join<\/span> (cols, how=' <span style=\"color: #ff0000;\">outer<\/span> ')\n    <span style=\"color: #008000;\">for<\/span> r <span style=\"color: #008000;\">in<\/span> df. <span style=\"color: #3366ff;\">columns<\/span> :\n        <span style=\"color: #008000;\">for<\/span> c <span style=\"color: #008000;\">in<\/span> df. <span style=\"color: #3366ff;\">columns<\/span> :\n            tmp = df[df[r]. <span style=\"color: #3366ff;\">notnull<\/span> () &amp; df[c]. <span style=\"color: #3366ff;\">notnull<\/span> ()]\n            p[r][c] = round(pearsonr(tmp[r], tmp[c])[1], 4)\n    <span style=\"color: #008000;\">return<\/span> p\n<\/strong><\/span><\/pre>\n<p> <span style=\"color: #000000;\">I seguenti esempi mostrano come calcolare i valori p per i coefficienti di correlazione in pratica con i seguenti DataFrame panda:<\/span><\/p>\n<pre style=\"background-color: #ececec; font-size: 15px;\"> <span style=\"color: #000000;\"><strong><span style=\"color: #008000;\">import<\/span> pandas <span style=\"color: #008000;\">as<\/span> pd\n\n<span style=\"color: #008080;\">#createDataFrame\n<\/span>df = pd. <span style=\"color: #3366ff;\">DataFrame<\/span> ({' <span style=\"color: #ff0000;\">x<\/span> ': [4, 5, 5, 7, 8, 10, 12, 13, 14, 15],\n                   ' <span style=\"color: #ff0000;\">y<\/span> ': [10, 12, 14, 18, np.nan, 19, 13, 20, 14, np.nan],\n                   ' <span style=\"color: #ff0000;\">z<\/span> ': [20, 24, 24, 23, 19, 15, 18, 14, 10, 12]})\n\n<span style=\"color: #008080;\">#view DataFrame\n<\/span><span style=\"color: #008000;\">print<\/span> (df)\n\n    X Y Z\n0 4 10.0 20\n1 5 12.0 24\n2 5 14.0 24\n3 7 18.0 23\n4 8 NaN 19\n5 10 19.0 15\n6 12 13.0 18\n7 13 20.0 14\n8 14 14.0 10\n9 15 NaN 12\n<\/strong><\/span><\/pre>\n<h2> <span style=\"color: #000000;\"><strong>Esempio 1: calcolare il valore P per il coefficiente di correlazione tra due colonne in Panda<\/strong><\/span><\/h2>\n<p> <span style=\"color: #000000;\">Il codice seguente mostra come calcolare il coefficiente di correlazione Pearson e il <strong>corrispondente valore p per le colonne xey<\/strong> <strong>del<\/strong> DataFrame:<\/span><\/p>\n<pre style=\"background-color: #ececec; font-size: 15px;\"> <span style=\"color: #000000;\"><strong><span style=\"color: #008000;\">from<\/span> scipy. <span style=\"color: #3366ff;\">stats<\/span> <span style=\"color: #008000;\">import<\/span> pearsonr\n\n<span style=\"color: #008080;\">#drop all rows with NaN values\n<\/span>df_new = df. <span style=\"color: #3366ff;\">dropna<\/span> ()\n\n<span style=\"color: #008080;\">#calculation correlation coefficient and p-value between x and y\n<\/span>pearsonr(df_new[' <span style=\"color: #ff0000;\">x<\/span> '], df_new[' <span style=\"color: #ff0000;\">y<\/span> '])\n\nPearsonRResult(statistic=0.4791621985883838, pvalue=0.22961622926360523)\n<\/strong><\/span><\/pre>\n<p> <span style=\"color: #000000;\">Dal risultato possiamo vedere:<\/span><\/p>\n<ul>\n<li> <span style=\"color: #000000;\">Il coefficiente di correlazione di Pearson \u00e8 <strong>0,4792<\/strong> .<\/span><\/li>\n<li> <span style=\"color: #000000;\">Il valore p corrispondente \u00e8 <strong>0,2296<\/strong> .<\/span><\/li>\n<\/ul>\n<p> <span style=\"color: #000000;\">Poich\u00e9 il coefficiente di correlazione \u00e8 positivo, ci\u00f2 indica che esiste una relazione lineare positiva tra le due variabili.<\/span><\/p>\n<p> <span style=\"color: #000000;\">Tuttavia, poich\u00e9 il valore p del coefficiente di correlazione non \u00e8 inferiore a 0,05, la correlazione non \u00e8 statisticamente significativa.<\/span><\/p>\n<p> <span style=\"color: #000000;\">Si noti che possiamo anche utilizzare la seguente sintassi per estrarre il valore p dal coefficiente di correlazione:<\/span><\/p>\n<pre style=\"background-color: #ececec; font-size: 15px;\"> <span style=\"color: #000000;\"><strong><span style=\"color: #008080;\">#extract p-value of correlation coefficient\n<\/span>pearsonr(df_new[' <span style=\"color: #ff0000;\">x<\/span> '], df_new[' <span style=\"color: #ff0000;\">y<\/span> '])[1]\n\n0.22961622926360523\n<\/strong><\/span><\/pre>\n<p> <span style=\"color: #000000;\">Il valore p per il coefficiente di correlazione \u00e8 <strong>0,2296<\/strong> .<\/span><\/p>\n<p> <span style=\"color: #000000;\">Questo corrisponde al valore p dell&#8217;output precedente.<\/span><\/p>\n<h2> <span style=\"color: #000000;\"><strong>Esempio 2: calcolare il valore P per il coefficiente di correlazione tra tutte le colonne in Pandas<\/strong><\/span><\/h2>\n<p> <span style=\"color: #000000;\">Il codice seguente mostra come calcolare il coefficiente di correlazione di Pearson e il corrispondente valore p per ciascuna combinazione di colonne a coppie nel DataFrame panda:<\/span><\/p>\n<pre style=\"background-color: #ececec; font-size: 15px;\"> <span style=\"color: #000000;\"><strong><span style=\"color: #008000;\"><span style=\"color: #008080;\">#create function to calculate p-values for each pairwise correlation coefficient<\/span>\ndef<\/span> r_pvalues(df):\n    cols = pd. <span style=\"color: #3366ff;\">DataFrame<\/span> (columns= <span style=\"color: #3366ff;\">df.columns<\/span> )\n    p = cols. <span style=\"color: #3366ff;\">transpose<\/span> (). <span style=\"color: #3366ff;\">join<\/span> (cols, how=' <span style=\"color: #ff0000;\">outer<\/span> ')\n    <span style=\"color: #008000;\">for<\/span> r <span style=\"color: #008000;\">in<\/span> df. <span style=\"color: #3366ff;\">columns<\/span> :\n        <span style=\"color: #008000;\">for<\/span> c <span style=\"color: #008000;\">in<\/span> df. <span style=\"color: #3366ff;\">columns<\/span> :\n            tmp = df[df[r]. <span style=\"color: #3366ff;\">notnull<\/span> () &amp; df[c]. <span style=\"color: #3366ff;\">notnull<\/span> ()]\n            p[r][c] = round(pearsonr(tmp[r], tmp[c])[1], 4)\n    <span style=\"color: #008000;\">return<\/span> p\n\n<span style=\"color: #008080;\">#use custom function to calculate p-values\n<\/span>r_pvalues(df)\n\n             X Y Z\nx 0.0 0.2296 0.0005\ny 0.2296 0.0 0.4238\nz 0.0005 0.4238 0.0<\/strong><\/span><\/pre>\n<p> <span style=\"color: #000000;\">Dal risultato possiamo vedere:<\/span><\/p>\n<ul>\n<li> <span style=\"color: #000000;\">Il valore p per il coefficiente di correlazione tra xey \u00e8 <strong>0,2296<\/strong> .<\/span><\/li>\n<li> <span style=\"color: #000000;\">Il valore p per il coefficiente di correlazione tra xez \u00e8 <strong>0,0005<\/strong> .<\/span><\/li>\n<li> <span style=\"color: #000000;\">Il valore p per il coefficiente di correlazione tra yez \u00e8 <strong>0,4238<\/strong> .<\/span><\/li>\n<\/ul>\n<p> <span style=\"color: #000000;\">Tieni presente che abbiamo arrotondato i valori p a quattro cifre decimali nella nostra funzione personalizzata.<\/span><\/p>\n<p> <span style=\"color: #000000;\">Sentiti libero di sostituire il <strong>4<\/strong> nell&#8217;ultima riga della funzione con un numero diverso da arrotondare a un numero diverso di cifre decimali.<\/span><\/p>\n<p> <span style=\"color: #000000;\"><strong>Nota<\/strong> : puoi trovare la documentazione completa per la funzione SciPy <strong>Pearsonr()<\/strong> <a href=\"https:\/\/docs.scipy.org\/doc\/scipy\/reference\/generated\/scipy.stats.pearsonr.html\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">qui<\/a> .<\/span><\/p>\n<h2> <span style=\"color: #000000;\"><strong>Risorse addizionali<\/strong><\/span><\/h2>\n<p> <span style=\"color: #000000;\">I seguenti tutorial spiegano come eseguire altre attivit\u00e0 comuni dei panda:<\/span><\/p>\n<p> <a href=\"https:\/\/statorials.org\/it\/gruppo-di-panda-per-correlazione\/\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">Come calcolare la correlazione per gruppo in Pandas<\/a><br \/> <a href=\"https:\/\/statorials.org\/it\/cuscinetto-di-correlazione-dei-panda\/\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">Come calcolare la correlazione mobile nei panda<\/a><br \/><a href=\"https:\/\/statorials.org\/it\/pitone-lanciere-di-correlazione\/\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">Come calcolare la correlazione del rango di Spearman nei panda<\/a><\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>Il coefficiente di correlazione di Pearson pu\u00f2 essere utilizzato per misurare l&#8217;associazione lineare tra due variabili. 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