Rのlm()関数からp値を抽出する方法

次のメソッドを使用して、R のlm() 関数から p 値を抽出できます。

方法 1: 回帰モデルから全体の P 値を抽出する

 #define function to extract overall p-value of model
overall_p <- function (my_model) {
    f <- summary(my_model)$fstatistic
    p <- pf(f[1],f[2],f[3],lower. tail =F)
    attributes(p) <- NULL
    return (p)
}

#extract overall p-value of model
overall_p(model)

方法 2: 回帰係数の個々の P 値を抽出する

 summary(model)$coefficients[,4]

次の例は、これらのメソッドを実際に使用する方法を示しています。

例: Rのlm()からPの値を抽出

次の重線形回帰モデルを R に当てはめるとします。

 #create data frame
df <- data. frame (rating=c(67, 75, 79, 85, 90, 96, 97),
                 points=c(8, 12, 16, 15, 22, 28, 24),
                 assists=c(4, 6, 6, 5, 3, 8, 7),
                 rebounds=c(1, 4, 3, 3, 2, 6, 7))

#fit multiple linear regression model
model <- lm(rating ~ points + assists + rebounds, data=df)

summary()関数を使用すると、回帰モデルの完全な概要を表示できます。

 #view model summary
summary(model)

Call:
lm(formula = rating ~ points + assists + rebounds, data = df)

Residuals:
      1 2 3 4 5 6 7 
-1.5902 -1.7181 0.2413 4.8597 -1.0201 -0.6082 -0.1644 

Coefficients:
            Estimate Std. Error t value Pr(>|t|)   
(Intercept) 66.4355 6.6932 9.926 0.00218 **
points 1.2152 0.2788 4.359 0.02232 * 
assists -2.5968 1.6263 -1.597 0.20860   
rebounds 2.8202 1.6118 1.750 0.17847   
---
Significant. codes: 0 '***' 0.001 '**' 0.01 '*' 0.05 '.' 0.1 ' ' 1

Residual standard error: 3.193 on 3 degrees of freedom
Multiple R-squared: 0.9589, Adjusted R-squared: 0.9179 
F-statistic: 23.35 on 3 and 3 DF, p-value: 0.01396

結果の一番下では、回帰モデル全体の p 値が0.01396であることがわかります。

モデルからこの p 値だけを抽出したい場合は、そのためのカスタム関数を定義できます。

 #define function to extract overall p-value of model
overall_p <- function (my_model) {
    f <- summary(my_model)$fstatistic
    p <- pf(f[1],f[2],f[3],lower. tail =F)
    attributes(p) <- NULL
    return (p)
}

#extract overall p-value of model
overall_p(model)

[1] 0.01395572

この関数は、上記のモデル出力と同じ p 値を返すことに注意してください。

モデルから個々の回帰係数の p 値を抽出するには、次の構文を使用できます。

 #extract p-values for individual regression coefficients in model
summary(model)$coefficients[,4] 

(Intercept) points assists rebounds 
0.002175313 0.022315418 0.208600183 0.178471275

ここで示されている p 値は、上記の回帰出力のPr(> |t|)列の p 値に対応していることに注意してください。

関連: R の lm() 関数から R2 乗を抽出する方法

追加リソース

次のチュートリアルでは、R で他の一般的なタスクを実行する方法について説明します。

R で単純な線形回帰を実行する方法
R で重回帰を実行する方法
R で残差プロットを作成する方法