Bray-curtis의 차이점: 정의 및 예

J. Roger Bray 와 John Thomas Curtis 의 이름을 딴 Bray-Curtis 차이점은 서로 다른 두 사이트 간의 차이점을 측정하는 방법입니다.

이는 생태학 및 생물학에서 두 지역에서 발견된 종의 측면에서 두 지역 간의 차이를 정량화하기 위해 자주 사용됩니다.

Bray-Curtis 상이성은 다음과 같이 계산됩니다.

BC _ij = 1 – (2*C _ij ) / (S _i + S _j )

금:

• C _ij : 각 현장에서 발견된 종의 최저값의 합.
• S _i : 사이트 i 에서 계수된 총 검체 수
• S _j : 사이트 j 에서 계수된 총 검체 수

Bray-Curtis 차이점은 항상 0과 1 사이입니다.

• 0은 두 사이트에 차이점이 없음을 나타냅니다. 즉, 그들은 각 유형의 종을 정확히 동일한 수로 공유합니다.
• 1은 두 사이트가 완전히 다르다는 것을 나타냅니다. 즉, 동일한 유형의 어떤 종도 공유하지 않습니다.

다음 예에서는 두 사이트의 Bray-Curtis 차이점을 계산하는 방법을 보여줍니다.

예: Bray-Curtis 차이점 계산

식물학자가 두 곳의 다른 장소에 나가서 다섯 가지 식물 종(A, B, C, D, E)의 수를 세었다고 가정해 보겠습니다.

다음 표에는 그녀가 수집한 데이터가 요약되어 있습니다.

이 데이터를 사용하여 그녀는 Bray-Curtis 상이성을 다음과 같이 계산할 수 있습니다.

이 숫자를 Bray-Curtis 비유사성 공식에 통합하면 다음을 얻을 수 있습니다.

• BC _ij = 1 – (2*C _ij ) / (S _i + S _j )
• BC _ij = 1 – (2*15) / (21 + 24)
• 기원전 _ij = 0.33

이 두 사이트 간의 Bray-Curtis 차이점은 0.33 입니다.

Bray-Curtis 차이점의 주요 가정

Bray-Curtis 차이점은 두 사이트의 크기가 동일하다고 가정합니다.

한 장소가 다른 장소보다 4배 더 크다면, 단순히 다루어야 할 면적이 훨씬 더 많기 때문에 작은 장소보다 큰 장소에 자연적으로 더 많은 종이 있을 것이기 때문에 이것은 중요한 가정입니다.

이를 설명하기 위해 식물학자가 데이터를 수집한 사이트 중 하나가 다른 사이트보다 4배 더 크다고 가정합니다.

사이트 1이 사이트 2보다 훨씬 크기 때문에 우리는 사이트 1에서 종의 빈도가 훨씬 더 높을 것으로 예상합니다.

따라서 Bray-Curtis의 비유사성을 계산해 보면 상당히 클 것입니다. 그러나 두 사이트의 차이점은 구성이 아니라 크기에 있기 때문에 이는 오해의 소지가 있습니다.