{"id":1542,"date":"2023-07-25T23:14:40","date_gmt":"2023-07-25T23:14:40","guid":{"rendered":"https:\/\/statorials.org\/nl\/vervagen-altman-plot-r\/"},"modified":"2023-07-25T23:14:40","modified_gmt":"2023-07-25T23:14:40","slug":"vervagen-altman-plot-r","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/statorials.org\/nl\/vervagen-altman-plot-r\/","title":{"rendered":"Een bland-altman-plot maken in r (stap voor stap)"},"content":{"rendered":"

<\/p>\n

\n

Een Bland-Altman-plot<\/a> wordt gebruikt om meetverschillen tussen twee verschillende instrumenten of twee verschillende meettechnieken te visualiseren.<\/span><\/p>\n

Het is nuttig om te bepalen hoe vergelijkbaar twee instrumenten of technieken zijn bij het meten van hetzelfde concept.<\/span><\/p>\n

Deze tutorial biedt een stapsgewijs voorbeeld van hoe u een Bland-Altman-plot maakt in R.<\/span><\/p>\n

Stap 1: Cre\u00eber de gegevens<\/strong><\/span><\/h3>\n

Stel dat een bioloog twee verschillende instrumenten (A en B) gebruikt om het gewicht van dezelfde set van twintig verschillende kikkers te meten, in grammen.<\/span><\/p>\n

We zullen het volgende gegevensframe in R maken dat het gewicht van elke kikker weergeeft, zoals gemeten door elk instrument:<\/span><\/p>\n

 #create data<\/span>\ndf <- data. frame<\/span> (A=c(5, 5, 5, 6, 6, 7, 7, 7, 8, 8, 9,\n                     10, 11, 13, 14, 14, 15, 18, 22, 25),\n                 B=c(4, 4, 5, 5, 5, 7, 8, 6, 9, 7, 7, 11,\n                     13, 13, 12, 13, 14, 19, 19, 24))\n\n#view first six rows of data\n<\/span>head(df)\n\n  AB\n1 5 4\n2 5 4\n3 5 5\n4 6 5\n5 6 5\n6 7 7<\/strong><\/pre>\n
 Stap 2: Bereken het verschil in metingen<\/strong><\/span><\/h3>\n
 Vervolgens zullen we twee nieuwe kolommen in het dataframe maken die de gemiddelde meting van elke kikker bevatten, evenals het verschil in metingen:<\/span><\/p>\n
 #create new column for average measurement<\/span>\ndf$avg <- rowMeans(df) \n<\/span>\n#create new column for difference in measurements\ndf$diff <- df$A - df$B<\/span><\/span>\n\n#view first six rows of data\n<\/span>head(df)\n\n  AB avg diff\n1 5 4 4.5 1\n2 5 4 4.5 1\n3 5 5 5.0 0\n4 6 5 5.5 1\n5 6 5 5.5 1\n6 7 7 7.0 0\n<\/strong><\/pre>\n
 Stap 3: Bereken het gemiddelde verschil en het betrouwbaarheidsinterval<\/strong><\/span><\/h3>\n
 Vervolgens berekenen we het gemiddelde verschil in metingen tussen de twee instrumenten, evenals de boven- en ondergrenzen van het 95% betrouwbaarheidsinterval voor het gemiddelde verschil:<\/span><\/p>\n
 #find average difference<\/span>\nmean_diff <- mean(df$diff)\n\nmean_diff\n\n[1] 0.5\n<\/span>\n#find lower 95% confidence interval limits\nlower <- mean_diff - 1.96*sd(df$diff)<\/span>\n\nlower\n\n[1] -1.921465\n<\/span>\n#find upper 95% confidence interval limits\nupper <- mean_diff + 1.96*sd(df$diff)<\/span>\n\nupper<\/span>\n\n[1] 2.921465\n<\/span><\/span><\/strong><\/pre>\n
 Het gemiddelde verschil blijkt 0,5<\/strong> te zijn en het 95% betrouwbaarheidsinterval voor het gemiddelde verschil is [-1,921, 2,921]<\/strong> .<\/span><\/p>\n
 Stap 4: Cre\u00eber het Bland-Altman-plot<\/strong><\/span><\/h3>\n
 Vervolgens zullen we de volgende code gebruiken om een Bland-Altman-plot te maken met behulp van het ggplot2-<\/a> datavisualisatiepakket:<\/span><\/span> <\/p>\n
 #load ggplot2\n<\/span><\/span>library<\/span> (ggplot2)\n\n#create Bland-Altman plot\n<\/span>ggplot(df, aes<\/span> (x = avg, y = diff)) +\n  geom_point(size=2) +\n  geom_hline(yintercept = mean_diff) +\n  geom_hline(yintercept = lower, color = \" red<\/span> \", linetype=\" dashed<\/span> \") +\n  geom_hline(yintercept = upper, color = \" red<\/span> \", linetype=\" dashed<\/span> \") +\n  ggtitle(\" Bland-Altman Plot<\/span> \") +\n  ylab(\" Difference Between Measurements<\/span> \") +\n  xlab(\" Average Measurement<\/span> \")<\/span><\/strong> <\/pre>\n
\"Bland-Altman-plot<\/p>\n
 De x-as van de grafiek geeft de gemiddelde meting van de twee instrumenten weer en de y-as geeft het verschil in metingen tussen de twee instrumenten weer.<\/span><\/p>\n
 De zwarte lijn geeft het gemiddelde verschil in metingen tussen de twee instrumenten weer, terwijl de twee rode stippellijnen de grenzen van het 95% betrouwbaarheidsinterval voor het gemiddelde verschil weergeven.<\/span><\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"
Een Bland-Altman-plot wordt gebruikt om meetverschillen tussen twee verschillende instrumenten of twee verschillende meettechnieken te visualiseren. Het is nuttig om te bepalen hoe vergelijkbaar twee instrumenten of technieken zijn bij het meten van hetzelfde concept. Deze tutorial biedt een stapsgewijs voorbeeld van hoe u een Bland-Altman-plot maakt in R. Stap 1: Cre\u00eber de gegevens Stel […]<\/p>\n","protected":false},"author":1,"featured_media":0,"comment_status":"open","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"footnotes":""},"categories":[11],"tags":[],"class_list":["post-1542","post","type-post","status-publish","format-standard","hentry","category-gids"],"yoast_head":"\nEen Bland-Altman-plot maken in R (stap voor stap)<\/title>\n<meta name=\"description\" content=\"In deze tutorial wordt uitgelegd hoe u een Bland-Altman-plot in R maakt, inclusief een stapsgewijs voorbeeld.\" \/>\n<meta name=\"robots\" content=\"index, follow, max-snippet:-1, max-image-preview:large, max-video-preview:-1\" \/>\n<link rel=\"canonical\" href=\"https:\/\/statorials.org\/nl\/vervagen-altman-plot-r\/\" \/>\n<meta property=\"og:locale\" content=\"de_DE\" \/>\n<meta property=\"og:type\" content=\"article\" \/>\n<meta property=\"og:title\" content=\"Een Bland-Altman-plot maken in R (stap voor stap)\" \/>\n<meta property=\"og:description\" content=\"In deze tutorial wordt uitgelegd hoe u een Bland-Altman-plot in R maakt, inclusief een stapsgewijs voorbeeld.\" \/>\n<meta property=\"og:url\" content=\"https:\/\/statorials.org\/nl\/vervagen-altman-plot-r\/\" \/>\n<meta property=\"og:site_name\" content=\"Statorials\" \/>\n<meta property=\"article:published_time\" content=\"2023-07-25T23:14:40+00:00\" \/>\n<meta property=\"og:image\" content=\"https:\/\/statorials.org\/wp-content\/uploads\/2023\/08\/fader1.png\" \/>\n<meta name=\"author\" content=\"Dr.benjamin anderson\" \/>\n<meta name=\"twitter:card\" content=\"summary_large_image\" \/>\n<meta name=\"twitter:label1\" content=\"Verfasst von\" \/>\n\t<meta name=\"twitter:data1\" content=\"Dr.benjamin anderson\" \/>\n\t<meta name=\"twitter:label2\" content=\"Gesch\u00e4tzte Lesezeit\" \/>\n\t<meta name=\"twitter:data2\" content=\"2\u00a0Minuten\" \/>\n<script type=\"application\/ld+json\" class=\"yoast-schema-graph\">{\"@context\":\"https:\/\/schema.org\",\"@graph\":[{\"@type\":\"WebPage\",\"@id\":\"https:\/\/statorials.org\/nl\/vervagen-altman-plot-r\/\",\"url\":\"https:\/\/statorials.org\/nl\/vervagen-altman-plot-r\/\",\"name\":\"Een Bland-Altman-plot maken in R (stap voor stap)\",\"isPartOf\":{\"@id\":\"https:\/\/statorials.org\/nl\/#website\"},\"datePublished\":\"2023-07-25T23:14:40+00:00\",\"dateModified\":\"2023-07-25T23:14:40+00:00\",\"author\":{\"@id\":\"https:\/\/statorials.org\/nl\/#\/schema\/person\/d4b8842173cca1bb62cdec41860e4219\"},\"description\":\"In deze tutorial wordt uitgelegd hoe u een Bland-Altman-plot in R maakt, inclusief een stapsgewijs voorbeeld.\",\"breadcrumb\":{\"@id\":\"https:\/\/statorials.org\/nl\/vervagen-altman-plot-r\/#breadcrumb\"},\"inLanguage\":\"de\",\"potentialAction\":[{\"@type\":\"ReadAction\",\"target\":[\"https:\/\/statorials.org\/nl\/vervagen-altman-plot-r\/\"]}]},{\"@type\":\"BreadcrumbList\",\"@id\":\"https:\/\/statorials.org\/nl\/vervagen-altman-plot-r\/#breadcrumb\",\"itemListElement\":[{\"@type\":\"ListItem\",\"position\":1,\"name\":\"Thuis\",\"item\":\"https:\/\/statorials.org\/nl\/\"},{\"@type\":\"ListItem\",\"position\":2,\"name\":\"Een bland-altman-plot maken in r (stap voor stap)\"}]},{\"@type\":\"WebSite\",\"@id\":\"https:\/\/statorials.org\/nl\/#website\",\"url\":\"https:\/\/statorials.org\/nl\/\",\"name\":\"Statorials\",\"description\":\"Uw gids voor statistische competentie\",\"potentialAction\":[{\"@type\":\"SearchAction\",\"target\":{\"@type\":\"EntryPoint\",\"urlTemplate\":\"https:\/\/statorials.org\/nl\/?s={search_term_string}\"},\"query-input\":\"required name=search_term_string\"}],\"inLanguage\":\"de\"},{\"@type\":\"Person\",\"@id\":\"https:\/\/statorials.org\/nl\/#\/schema\/person\/d4b8842173cca1bb62cdec41860e4219\",\"name\":\"Dr.benjamin anderson\",\"image\":{\"@type\":\"ImageObject\",\"inLanguage\":\"de\",\"@id\":\"https:\/\/statorials.org\/nl\/#\/schema\/person\/image\/\",\"url\":\"http:\/\/statorials.org\/nl\/wp-content\/uploads\/2023\/10\/Dr.-Benjamin-Anderson-96x96.jpg\",\"contentUrl\":\"http:\/\/statorials.org\/nl\/wp-content\/uploads\/2023\/10\/Dr.-Benjamin-Anderson-96x96.jpg\",\"caption\":\"Dr.benjamin anderson\"},\"description\":\"Ik ben Benjamin, een gepensioneerde hoogleraar statistiek die nu een toegewijde Statorials-lesgever is. Ik heb uitgebreide ervaring en expertise op het gebied van statistiek en ik ben vastbesloten om mijn kennis te delen met studenten via Statorials. Lees verder\",\"sameAs\":[\"http:\/\/statorials.org\/nl\"]}]}<\/script>\n<!-- \/ Yoast SEO plugin. -->","yoast_head_json":{"title":"Een Bland-Altman-plot maken in R (stap voor stap)","description":"In deze tutorial wordt uitgelegd hoe u een Bland-Altman-plot in R maakt, inclusief een stapsgewijs voorbeeld.","robots":{"index":"index","follow":"follow","max-snippet":"max-snippet:-1","max-image-preview":"max-image-preview:large","max-video-preview":"max-video-preview:-1"},"canonical":"https:\/\/statorials.org\/nl\/vervagen-altman-plot-r\/","og_locale":"de_DE","og_type":"article","og_title":"Een Bland-Altman-plot maken in R (stap voor stap)","og_description":"In deze tutorial wordt uitgelegd hoe u een Bland-Altman-plot in R maakt, inclusief een stapsgewijs voorbeeld.","og_url":"https:\/\/statorials.org\/nl\/vervagen-altman-plot-r\/","og_site_name":"Statorials","article_published_time":"2023-07-25T23:14:40+00:00","og_image":[{"url":"https:\/\/statorials.org\/wp-content\/uploads\/2023\/08\/fader1.png"}],"author":"Dr.benjamin anderson","twitter_card":"summary_large_image","twitter_misc":{"Verfasst von":"Dr.benjamin anderson","Gesch\u00e4tzte Lesezeit":"2\u00a0Minuten"},"schema":{"@context":"https:\/\/schema.org","@graph":[{"@type":"WebPage","@id":"https:\/\/statorials.org\/nl\/vervagen-altman-plot-r\/","url":"https:\/\/statorials.org\/nl\/vervagen-altman-plot-r\/","name":"Een Bland-Altman-plot maken in R (stap voor stap)","isPartOf":{"@id":"https:\/\/statorials.org\/nl\/#website"},"datePublished":"2023-07-25T23:14:40+00:00","dateModified":"2023-07-25T23:14:40+00:00","author":{"@id":"https:\/\/statorials.org\/nl\/#\/schema\/person\/d4b8842173cca1bb62cdec41860e4219"},"description":"In deze tutorial wordt uitgelegd hoe u een Bland-Altman-plot in R maakt, inclusief een stapsgewijs voorbeeld.","breadcrumb":{"@id":"https:\/\/statorials.org\/nl\/vervagen-altman-plot-r\/#breadcrumb"},"inLanguage":"de","potentialAction":[{"@type":"ReadAction","target":["https:\/\/statorials.org\/nl\/vervagen-altman-plot-r\/"]}]},{"@type":"BreadcrumbList","@id":"https:\/\/statorials.org\/nl\/vervagen-altman-plot-r\/#breadcrumb","itemListElement":[{"@type":"ListItem","position":1,"name":"Thuis","item":"https:\/\/statorials.org\/nl\/"},{"@type":"ListItem","position":2,"name":"Een bland-altman-plot maken in r (stap voor stap)"}]},{"@type":"WebSite","@id":"https:\/\/statorials.org\/nl\/#website","url":"https:\/\/statorials.org\/nl\/","name":"Statorials","description":"Uw gids voor statistische competentie","potentialAction":[{"@type":"SearchAction","target":{"@type":"EntryPoint","urlTemplate":"https:\/\/statorials.org\/nl\/?s={search_term_string}"},"query-input":"required name=search_term_string"}],"inLanguage":"de"},{"@type":"Person","@id":"https:\/\/statorials.org\/nl\/#\/schema\/person\/d4b8842173cca1bb62cdec41860e4219","name":"Dr.benjamin anderson","image":{"@type":"ImageObject","inLanguage":"de","@id":"https:\/\/statorials.org\/nl\/#\/schema\/person\/image\/","url":"http:\/\/statorials.org\/nl\/wp-content\/uploads\/2023\/10\/Dr.-Benjamin-Anderson-96x96.jpg","contentUrl":"http:\/\/statorials.org\/nl\/wp-content\/uploads\/2023\/10\/Dr.-Benjamin-Anderson-96x96.jpg","caption":"Dr.benjamin anderson"},"description":"Ik ben Benjamin, een gepensioneerde hoogleraar statistiek die nu een toegewijde Statorials-lesgever is. Ik heb uitgebreide ervaring en expertise op het gebied van statistiek en ik ben vastbesloten om mijn kennis te delen met studenten via Statorials. Lees verder","sameAs":["http:\/\/statorials.org\/nl"]}]}},"yoast_meta":{"yoast_wpseo_title":"","yoast_wpseo_metadesc":"","yoast_wpseo_canonical":""},"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/statorials.org\/nl\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/1542","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/statorials.org\/nl\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/statorials.org\/nl\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/statorials.org\/nl\/wp-json\/wp\/v2\/users\/1"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/statorials.org\/nl\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=1542"}],"version-history":[{"count":0,"href":"https:\/\/statorials.org\/nl\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/1542\/revisions"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/statorials.org\/nl\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=1542"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/statorials.org\/nl\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=1542"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/statorials.org\/nl\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=1542"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}