{"id":1559,"date":"2023-07-25T21:38:06","date_gmt":"2023-07-25T21:38:06","guid":{"rendered":"https:\/\/statorials.org\/nl\/log-rank-test-in-r\/"},"modified":"2023-07-25T21:38:06","modified_gmt":"2023-07-25T21:38:06","slug":"log-rank-test-in-r","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/statorials.org\/nl\/log-rank-test-in-r\/","title":{"rendered":"Een log rank-test uitvoeren in r"},"content":{"rendered":"<p><\/p>\n<hr>\n<p><span style=\"color: #000000;\">Een <strong>log-rank-test<\/strong> is de meest gebruikelijke manier om overlevingscurven tussen twee groepen te vergelijken.<\/span><\/p>\n<p> <span style=\"color: #000000;\">Deze test maakt gebruik van de volgende <a href=\"https:\/\/statorials.org\/nl\/hypothesetesten-1\/\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">aannames<\/a> :<\/span><\/p>\n<p> <span style=\"color: #000000;\"><strong>H <sub>0<\/sub> :<\/strong> Er is geen verschil in overleving tussen de twee groepen.<\/span><\/p>\n<p> <span style=\"color: #000000;\"><strong>H <sub>A<\/sub> :<\/strong> <em>Er is<\/em> een verschil in overleving tussen de twee groepen.<\/span><\/p>\n<p> <span style=\"color: #000000;\">Als de <a href=\"https:\/\/statorials.org\/nl\/p-waarden-statistische-significantie\/\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">p-waarde<\/a> van de test onder een bepaald significantieniveau ligt (bijvoorbeeld \u03b1 = 0,05), dan kunnen we de nulhypothese verwerpen en concluderen dat er voldoende bewijs is om te zeggen dat er een verschil in overleving bestaat tussen de twee groepen.<\/span><\/p>\n<p> <span style=\"color: #000000;\">Om een log-rank-test in R uit te voeren, kunnen we de functie <strong>survdiff()<\/strong> uit het <strong>survival-<\/strong> pakket gebruiken, die de volgende syntaxis gebruikt:<\/span><\/p>\n<p> <span style=\"color: #000000;\"><strong>survdiff(Surv(tijd, status) ~ voorspellers, gegevens)<\/strong><\/span><\/p>\n<p> <span style=\"color: #000000;\">Deze functie retourneert een chikwadraattoetsstatistiek en een overeenkomstige p-waarde.<\/span><\/p>\n<p> <span style=\"color: #000000;\">In het volgende voorbeeld ziet u hoe u deze functie kunt gebruiken om een log-rank-test uit te voeren in R.<\/span><\/p>\n<h3> <span style=\"color: #000000;\"><strong>Voorbeeld: lograngtest in R<\/strong><\/span><\/h3>\n<p> <span style=\"color: #000000;\">Voor dit voorbeeld gebruiken we de <strong>ovari\u00eble<\/strong> dataset uit het <strong>overlevingspakket<\/strong> . Deze dataset bevat de volgende informatie over 26 pati\u00ebnten:<\/span><\/p>\n<ul>\n<li> <span style=\"color: #000000;\">Overlevingstijd (in maanden) na de diagnose eierstokkanker<\/span><\/li>\n<li> <span style=\"color: #000000;\">Of de overlevingstijd al dan niet werd gecensureerd<\/span><\/li>\n<li> <span style=\"color: #000000;\">Type behandeling ontvangen (rx = 1 of rx = 2)<\/span><\/li>\n<\/ul>\n<p> <span style=\"color: #000000;\">De volgende code laat zien hoe u de eerste zes rijen van deze gegevensset kunt weergeven:<\/span><\/p>\n<pre style=\"background-color: #ececec; font-size: 15px;\"> <strong><span style=\"color: #993300;\">library<\/span> (survival)\n\n<span style=\"color: #008080;\">#view first six rows of dataset\n<\/span>head(ovarian)\n\n  futime fustat age resid.ds rx ecog.ps\n1 59 1 72.3315 2 1 1\n2 115 1 74.4932 2 1 1\n3 156 1 66.4658 2 1 2\n4 421 0 53.3644 2 2 1\n5,431 1 50.3397 2 1 1\n6 448 0 56.4301 1 1 2<\/strong><\/pre>\n<p> <span style=\"color: #000000;\">De volgende code laat zien hoe u een log-rank-test kunt uitvoeren om te bepalen of er een verschil in overleving is tussen pati\u00ebnten die verschillende behandelingen hebben gekregen:<\/span><\/p>\n<pre style=\"background-color: #ececec; font-size: 15px;\"> <strong><span style=\"color: #008080;\">#perform log rank test\n<\/span>survdiff(Surv(futime, fustat) ~ rx, data=ovarian)\n\nCall:\nsurvdiff(formula = Surv(futime, fustat) ~ rx, data = ovarian)\n\n      N Observed Expected (OE)^2\/E (OE)^2\/V\nrx=1 13 7 5.23 0.596 1.06\nrx=2 13 5 6.77 0.461 1.06\n\n Chisq= 1.1 on 1 degrees of freedom, p= 0.3 \n<\/strong><\/pre>\n<p> <span style=\"color: #000000;\">De Chi-kwadraattoetswaarde is <b>1,1<\/b> met 1 vrijheidsgraad en de overeenkomstige p-waarde is <strong>0,3<\/strong> . Omdat deze p-waarde niet kleiner is dan 0,05, slagen we er niet in de nulhypothese te verwerpen.<\/span><\/p>\n<p> <span style=\"color: #000000;\">Met andere woorden: we hebben niet voldoende bewijs om te zeggen dat er een statistisch significant verschil in overleving bestaat tussen de twee behandelingen.<\/span><\/p>\n<p> <span style=\"color: #000000;\">We kunnen ook overlevingscurven voor elke groep uitzetten met behulp van de volgende syntaxis:<\/span> <\/p>\n<pre style=\"background-color: #ececec; font-size: 15px;\"> <strong><span style=\"color: #008080;\">#plot survival curves for each treatment group\n<\/span>plot(survfit(Surv(futime, fustat) ~ rx, data = ovarian), \n     xlab = \" <span style=\"color: #008000;\">Time<\/span> \", \n     ylab = \u201c <span style=\"color: #008000;\">Overall survival probability<\/span> \u201d)\n<\/strong><\/pre>\n<p><img decoding=\"async\" loading=\"lazy\" class=\"aligncenter wp-image-15424 \" src=\"https:\/\/statorials.org\/wp-content\/uploads\/2023\/08\/logranktest1.png\" alt=\"Een plot van overlevingscurven in R\" width=\"428\" height=\"390\" srcset=\"\" sizes=\"auto, \"><\/p>\n<p> <span style=\"color: #000000;\">We kunnen zien dat de overlevingscurven enigszins verschillen, maar de log-rank-test vertelde ons dat het verschil niet statistisch significant is.<\/span><\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>Een log-rank-test is de meest gebruikelijke manier om overlevingscurven tussen twee groepen te vergelijken. Deze test maakt gebruik van de volgende aannames : H 0 : Er is geen verschil in overleving tussen de twee groepen. H A : Er is een verschil in overleving tussen de twee groepen. Als de p-waarde van de test [&hellip;]<\/p>\n","protected":false},"author":1,"featured_media":0,"comment_status":"open","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"footnotes":""},"categories":[11],"tags":[],"class_list":["post-1559","post","type-post","status-publish","format-standard","hentry","category-gids"],"yoast_head":"<!-- This site is optimized with the Yoast SEO plugin v21.5 - https:\/\/yoast.com\/wordpress\/plugins\/seo\/ -->\n<title>Hoe u een Log Rank-test uitvoert in R - Statorials<\/title>\n<meta name=\"description\" content=\"In deze tutorial wordt uitgelegd hoe u een log-rank-test in R uitvoert, met een voorbeeld.\" \/>\n<meta name=\"robots\" content=\"index, follow, max-snippet:-1, max-image-preview:large, max-video-preview:-1\" \/>\n<link rel=\"canonical\" href=\"https:\/\/statorials.org\/nl\/log-rank-test-in-r\/\" \/>\n<meta property=\"og:locale\" content=\"de_DE\" \/>\n<meta property=\"og:type\" content=\"article\" \/>\n<meta property=\"og:title\" content=\"Hoe u een Log Rank-test uitvoert in R - Statorials\" \/>\n<meta property=\"og:description\" content=\"In deze tutorial wordt uitgelegd hoe u een log-rank-test in R uitvoert, met een voorbeeld.\" \/>\n<meta property=\"og:url\" content=\"https:\/\/statorials.org\/nl\/log-rank-test-in-r\/\" \/>\n<meta property=\"og:site_name\" content=\"Statorials\" \/>\n<meta property=\"article:published_time\" content=\"2023-07-25T21:38:06+00:00\" \/>\n<meta property=\"og:image\" content=\"https:\/\/statorials.org\/wp-content\/uploads\/2023\/08\/logranktest1.png\" \/>\n<meta name=\"author\" content=\"Dr.benjamin anderson\" \/>\n<meta name=\"twitter:card\" content=\"summary_large_image\" \/>\n<meta name=\"twitter:label1\" content=\"Verfasst von\" \/>\n\t<meta name=\"twitter:data1\" content=\"Dr.benjamin anderson\" \/>\n\t<meta name=\"twitter:label2\" content=\"Gesch\u00e4tzte Lesezeit\" \/>\n\t<meta name=\"twitter:data2\" content=\"2\u00a0Minuten\" \/>\n<script type=\"application\/ld+json\" class=\"yoast-schema-graph\">{\"@context\":\"https:\/\/schema.org\",\"@graph\":[{\"@type\":\"WebPage\",\"@id\":\"https:\/\/statorials.org\/nl\/log-rank-test-in-r\/\",\"url\":\"https:\/\/statorials.org\/nl\/log-rank-test-in-r\/\",\"name\":\"Hoe u een Log Rank-test uitvoert in R - Statorials\",\"isPartOf\":{\"@id\":\"https:\/\/statorials.org\/nl\/#website\"},\"datePublished\":\"2023-07-25T21:38:06+00:00\",\"dateModified\":\"2023-07-25T21:38:06+00:00\",\"author\":{\"@id\":\"https:\/\/statorials.org\/nl\/#\/schema\/person\/d4b8842173cca1bb62cdec41860e4219\"},\"description\":\"In deze tutorial wordt uitgelegd hoe u een log-rank-test in R uitvoert, met een voorbeeld.\",\"breadcrumb\":{\"@id\":\"https:\/\/statorials.org\/nl\/log-rank-test-in-r\/#breadcrumb\"},\"inLanguage\":\"de\",\"potentialAction\":[{\"@type\":\"ReadAction\",\"target\":[\"https:\/\/statorials.org\/nl\/log-rank-test-in-r\/\"]}]},{\"@type\":\"BreadcrumbList\",\"@id\":\"https:\/\/statorials.org\/nl\/log-rank-test-in-r\/#breadcrumb\",\"itemListElement\":[{\"@type\":\"ListItem\",\"position\":1,\"name\":\"Thuis\",\"item\":\"https:\/\/statorials.org\/nl\/\"},{\"@type\":\"ListItem\",\"position\":2,\"name\":\"Een log rank-test uitvoeren in r\"}]},{\"@type\":\"WebSite\",\"@id\":\"https:\/\/statorials.org\/nl\/#website\",\"url\":\"https:\/\/statorials.org\/nl\/\",\"name\":\"Statorials\",\"description\":\"Uw gids voor statistische competentie\",\"potentialAction\":[{\"@type\":\"SearchAction\",\"target\":{\"@type\":\"EntryPoint\",\"urlTemplate\":\"https:\/\/statorials.org\/nl\/?s={search_term_string}\"},\"query-input\":\"required name=search_term_string\"}],\"inLanguage\":\"de\"},{\"@type\":\"Person\",\"@id\":\"https:\/\/statorials.org\/nl\/#\/schema\/person\/d4b8842173cca1bb62cdec41860e4219\",\"name\":\"Dr.benjamin anderson\",\"image\":{\"@type\":\"ImageObject\",\"inLanguage\":\"de\",\"@id\":\"https:\/\/statorials.org\/nl\/#\/schema\/person\/image\/\",\"url\":\"http:\/\/statorials.org\/nl\/wp-content\/uploads\/2023\/10\/Dr.-Benjamin-Anderson-96x96.jpg\",\"contentUrl\":\"http:\/\/statorials.org\/nl\/wp-content\/uploads\/2023\/10\/Dr.-Benjamin-Anderson-96x96.jpg\",\"caption\":\"Dr.benjamin anderson\"},\"description\":\"Ik ben Benjamin, een gepensioneerde hoogleraar statistiek die nu een toegewijde Statorials-lesgever is. Ik heb uitgebreide ervaring en expertise op het gebied van statistiek en ik ben vastbesloten om mijn kennis te delen met studenten via Statorials. Lees verder\",\"sameAs\":[\"http:\/\/statorials.org\/nl\"]}]}<\/script>\n<!-- \/ Yoast SEO plugin. -->","yoast_head_json":{"title":"Hoe u een Log Rank-test uitvoert in R - Statorials","description":"In deze tutorial wordt uitgelegd hoe u een log-rank-test in R uitvoert, met een voorbeeld.","robots":{"index":"index","follow":"follow","max-snippet":"max-snippet:-1","max-image-preview":"max-image-preview:large","max-video-preview":"max-video-preview:-1"},"canonical":"https:\/\/statorials.org\/nl\/log-rank-test-in-r\/","og_locale":"de_DE","og_type":"article","og_title":"Hoe u een Log Rank-test uitvoert in R - Statorials","og_description":"In deze tutorial wordt uitgelegd hoe u een log-rank-test in R uitvoert, met een voorbeeld.","og_url":"https:\/\/statorials.org\/nl\/log-rank-test-in-r\/","og_site_name":"Statorials","article_published_time":"2023-07-25T21:38:06+00:00","og_image":[{"url":"https:\/\/statorials.org\/wp-content\/uploads\/2023\/08\/logranktest1.png"}],"author":"Dr.benjamin anderson","twitter_card":"summary_large_image","twitter_misc":{"Verfasst von":"Dr.benjamin anderson","Gesch\u00e4tzte Lesezeit":"2\u00a0Minuten"},"schema":{"@context":"https:\/\/schema.org","@graph":[{"@type":"WebPage","@id":"https:\/\/statorials.org\/nl\/log-rank-test-in-r\/","url":"https:\/\/statorials.org\/nl\/log-rank-test-in-r\/","name":"Hoe u een Log Rank-test uitvoert in R - Statorials","isPartOf":{"@id":"https:\/\/statorials.org\/nl\/#website"},"datePublished":"2023-07-25T21:38:06+00:00","dateModified":"2023-07-25T21:38:06+00:00","author":{"@id":"https:\/\/statorials.org\/nl\/#\/schema\/person\/d4b8842173cca1bb62cdec41860e4219"},"description":"In deze tutorial wordt uitgelegd hoe u een log-rank-test in R uitvoert, met een voorbeeld.","breadcrumb":{"@id":"https:\/\/statorials.org\/nl\/log-rank-test-in-r\/#breadcrumb"},"inLanguage":"de","potentialAction":[{"@type":"ReadAction","target":["https:\/\/statorials.org\/nl\/log-rank-test-in-r\/"]}]},{"@type":"BreadcrumbList","@id":"https:\/\/statorials.org\/nl\/log-rank-test-in-r\/#breadcrumb","itemListElement":[{"@type":"ListItem","position":1,"name":"Thuis","item":"https:\/\/statorials.org\/nl\/"},{"@type":"ListItem","position":2,"name":"Een log rank-test uitvoeren in r"}]},{"@type":"WebSite","@id":"https:\/\/statorials.org\/nl\/#website","url":"https:\/\/statorials.org\/nl\/","name":"Statorials","description":"Uw gids voor statistische competentie","potentialAction":[{"@type":"SearchAction","target":{"@type":"EntryPoint","urlTemplate":"https:\/\/statorials.org\/nl\/?s={search_term_string}"},"query-input":"required name=search_term_string"}],"inLanguage":"de"},{"@type":"Person","@id":"https:\/\/statorials.org\/nl\/#\/schema\/person\/d4b8842173cca1bb62cdec41860e4219","name":"Dr.benjamin anderson","image":{"@type":"ImageObject","inLanguage":"de","@id":"https:\/\/statorials.org\/nl\/#\/schema\/person\/image\/","url":"http:\/\/statorials.org\/nl\/wp-content\/uploads\/2023\/10\/Dr.-Benjamin-Anderson-96x96.jpg","contentUrl":"http:\/\/statorials.org\/nl\/wp-content\/uploads\/2023\/10\/Dr.-Benjamin-Anderson-96x96.jpg","caption":"Dr.benjamin anderson"},"description":"Ik ben Benjamin, een gepensioneerde hoogleraar statistiek die nu een toegewijde Statorials-lesgever is. Ik heb uitgebreide ervaring en expertise op het gebied van statistiek en ik ben vastbesloten om mijn kennis te delen met studenten via Statorials. Lees verder","sameAs":["http:\/\/statorials.org\/nl"]}]}},"yoast_meta":{"yoast_wpseo_title":"","yoast_wpseo_metadesc":"","yoast_wpseo_canonical":""},"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/statorials.org\/nl\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/1559","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/statorials.org\/nl\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/statorials.org\/nl\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/statorials.org\/nl\/wp-json\/wp\/v2\/users\/1"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/statorials.org\/nl\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=1559"}],"version-history":[{"count":0,"href":"https:\/\/statorials.org\/nl\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/1559\/revisions"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/statorials.org\/nl\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=1559"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/statorials.org\/nl\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=1559"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/statorials.org\/nl\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=1559"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}