{"id":2557,"date":"2023-07-21T18:14:57","date_gmt":"2023-07-21T18:14:57","guid":{"rendered":"https:\/\/statorials.org\/nl\/kwantielnormalisatie-in-r\/"},"modified":"2023-07-21T18:14:57","modified_gmt":"2023-07-21T18:14:57","slug":"kwantielnormalisatie-in-r","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/statorials.org\/nl\/kwantielnormalisatie-in-r\/","title":{"rendered":"Hoe kwantielnormalisatie uit te voeren in r"},"content":{"rendered":"<p><\/p>\n<hr>\n<p><span style=\"color: #000000;\">In de statistiek is <a href=\"https:\/\/en.wikipedia.org\/wiki\/Quantile_normalization\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">kwantielnormalisatie<\/a> een methode die twee verdelingen identiek maakt in termen van statistische eigenschappen.<\/span><\/p>\n<p> <span style=\"color: #000000;\">In het volgende voorbeeld ziet u hoe u kwantielnormalisatie uitvoert in R.<\/span><\/p>\n<h3> <span style=\"color: #000000;\"><strong>Voorbeeld: kwantielnormalisatie in R<\/strong><\/span><\/h3>\n<p> <span style=\"color: #000000;\">Stel dat we het volgende dataframe in R maken dat twee kolommen bevat:<\/span><\/p>\n<pre style=\"background-color: #ececec; font-size: 15px;\"> <strong><span style=\"color: #008080;\">#make this example reproducible\n<\/span>set. <span style=\"color: #3366ff;\">seeds<\/span> (0)\n\n<span style=\"color: #008080;\">#create data frame with two columns\n<\/span>df &lt;- data. <span style=\"color: #3366ff;\">frame<\/span> (x=rnorm(1000),\n                 y=rnorm(1000))\n\n<span style=\"color: #008080;\">#view first six rows of data frame\n<\/span>head(df)\n\n           xy\n1 1.2629543 -0.28685156\n2 -0.3262334 1.84110689\n3 1.3297993 -0.15676431\n4 1.2724293 -1.38980264\n5 0.4146414 -1.47310399\n6 -1.5399500 -0.06951893<\/strong><\/pre>\n<p> <span style=\"color: #000000;\">We kunnen de functies <a href=\"https:\/\/statorials.org\/nl\/een-gids-voor-het-aanbrengen-van-lapply-sapply-en-tapply-in-r\/\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">sapply()<\/a> en <a href=\"https:\/\/statorials.org\/nl\/kwantielfunctie-in-r\/\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">quantile()<\/a> gebruiken om de kwantielen voor x en y te berekenen:<\/span><\/p>\n<pre style=\"background-color: #ececec; font-size: 15px;\"> <strong><span style=\"color: #008080;\">#calculate quantiles for x and y\n<\/span>sapply(df, function(x) quantile(x, probs = seq(0, 1, 1\/4)))\n\n               xy\n0% -3.23638573 -3.04536393\n25% -0.70845589 -0.73331907\n50% -0.05887078 -0.03181533\n75% 0.68763873 0.71755969\n100% 3.26641452 3.03903341\n<\/strong><\/pre>\n<p> <span style=\"color: #000000;\">Merk op dat x en y vergelijkbare waarden hebben voor de kwantielen, maar geen identieke waarden.<\/span><\/p>\n<p> <span style=\"color: #000000;\">De 25e percentielwaarde voor x is bijvoorbeeld <strong>-0,708<\/strong> en de 25e percentielwaarde voor y is <strong>-0,7333<\/strong> .<\/span><\/p>\n<p> <span style=\"color: #000000;\">Om kwantielnormalisatie uit te voeren, kunnen we de functie <strong>normalize.quantiles()<\/strong> uit het <a href=\"https:\/\/bioconductor.org\/packages\/release\/bioc\/html\/preprocessCore.html\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">preprocessCore-<\/a> pakket in R gebruiken:<\/span><\/p>\n<pre style=\"background-color: #ececec; font-size: 15px;\"> <strong><span style=\"color: #008000;\">library<\/span> (preprocessCore)\n\n<span style=\"color: #008080;\">#perform quantile normalization\n<\/span>df_norm &lt;- as. <span style=\"color: #3366ff;\">data<\/span> . <span style=\"color: #3366ff;\">frame<\/span> ( <span style=\"color: #3366ff;\">normalize.quantiles<\/span> ( <span style=\"color: #3366ff;\">as.matrix<\/span> (df)))\n\n<span style=\"color: #008080;\">#rename data frame columns\n<\/span>names(df_norm) &lt;- c(' <span style=\"color: #ff0000;\">x<\/span> ', ' <span style=\"color: #ff0000;\">y<\/span> ')\n\n<span style=\"color: #008080;\">#view first six row of new data frame\n<\/span>head(df_norm)\n\n           xy\n1 1.2632137 -0.28520228\n2 -0.3469744 1.82440519\n3 1.3465807 -0.16471644\n4 1.2692599 -1.34472394\n5 0.4161133 -1.43717759\n6 -1.6269731 -0.07906793\n<\/strong><\/pre>\n<p> <span style=\"color: #000000;\">We kunnen dan de volgende code gebruiken om de kwantielen voor x en y opnieuw te berekenen:<\/span><\/p>\n<pre style=\"background-color: #ececec; font-size: 15px;\"> <strong><span style=\"color: #008080;\">#calculate quantiles for x and y\n<\/span>sapply(df_norm, function(x) quantile(x, probs = seq(0, 1, 1\/4)))\n\n               xy\n0% -3.14087483 -3.14087483\n25% -0.72088748 -0.72088748\n50% -0.04534305 -0.04534305\n75% 0.70259921 0.70259921\n100% 3.15272396 3.15272396\n<\/strong><\/pre>\n<p> <span style=\"color: #000000;\">Merk op dat de kwantielen nu hetzelfde zijn voor x en y.<\/span><\/p>\n<p> <span style=\"color: #000000;\">We zouden zeggen dat x en y kwantielgenormaliseerd zijn. Met andere woorden: de twee verdelingen zijn nu identiek in termen van statistische eigenschappen.<\/span><\/p>\n<h3> <span style=\"color: #000000;\"><strong>Aanvullende bronnen<\/strong><\/span><\/h3>\n<p> <span style=\"color: #000000;\">In de volgende tutorials wordt uitgelegd hoe u andere veelvoorkomende taken in R kunt uitvoeren:<\/span><\/p>\n<p> <a href=\"https:\/\/statorials.org\/nl\/hoe-gegevens-in-r-te-normaliseren\/\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">Hoe gegevens in R te normaliseren<\/a><br \/> <a href=\"https:\/\/statorials.org\/nl\/percentielen-in-r\/\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">Hoe percentielen in R te berekenen<\/a><br \/> <a href=\"https:\/\/statorials.org\/nl\/kwantielfunctie-in-r\/\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">Hoe de quantile()-functie in R te gebruiken<\/a><\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>In de statistiek is kwantielnormalisatie een methode die twee verdelingen identiek maakt in termen van statistische eigenschappen. In het volgende voorbeeld ziet u hoe u kwantielnormalisatie uitvoert in R. Voorbeeld: kwantielnormalisatie in R Stel dat we het volgende dataframe in R maken dat twee kolommen bevat: #make this example reproducible set. seeds (0) #create data [&hellip;]<\/p>\n","protected":false},"author":1,"featured_media":0,"comment_status":"open","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"footnotes":""},"categories":[11],"tags":[],"class_list":["post-2557","post","type-post","status-publish","format-standard","hentry","category-gids"],"yoast_head":"<!-- This site is optimized with the Yoast SEO plugin v21.5 - https:\/\/yoast.com\/wordpress\/plugins\/seo\/ -->\n<title>Hoe kwantielnormalisatie uit te voeren in R - Statorials<\/title>\n<meta name=\"description\" content=\"In deze tutorial wordt uitgelegd hoe u kwantielnormalisatie in R uitvoert, met een compleet voorbeeld.\" \/>\n<meta name=\"robots\" content=\"index, follow, max-snippet:-1, max-image-preview:large, max-video-preview:-1\" \/>\n<link rel=\"canonical\" href=\"https:\/\/statorials.org\/nl\/kwantielnormalisatie-in-r\/\" \/>\n<meta property=\"og:locale\" content=\"de_DE\" \/>\n<meta property=\"og:type\" content=\"article\" \/>\n<meta property=\"og:title\" content=\"Hoe kwantielnormalisatie uit te voeren in R - Statorials\" \/>\n<meta property=\"og:description\" content=\"In deze tutorial wordt uitgelegd hoe u kwantielnormalisatie in R uitvoert, met een compleet voorbeeld.\" \/>\n<meta property=\"og:url\" content=\"https:\/\/statorials.org\/nl\/kwantielnormalisatie-in-r\/\" \/>\n<meta property=\"og:site_name\" content=\"Statorials\" \/>\n<meta property=\"article:published_time\" content=\"2023-07-21T18:14:57+00:00\" \/>\n<meta name=\"author\" content=\"Dr.benjamin anderson\" \/>\n<meta name=\"twitter:card\" content=\"summary_large_image\" \/>\n<meta name=\"twitter:label1\" content=\"Verfasst von\" \/>\n\t<meta name=\"twitter:data1\" content=\"Dr.benjamin anderson\" \/>\n\t<meta name=\"twitter:label2\" content=\"Gesch\u00e4tzte Lesezeit\" \/>\n\t<meta name=\"twitter:data2\" content=\"2\u00a0Minuten\" \/>\n<script type=\"application\/ld+json\" class=\"yoast-schema-graph\">{\"@context\":\"https:\/\/schema.org\",\"@graph\":[{\"@type\":\"WebPage\",\"@id\":\"https:\/\/statorials.org\/nl\/kwantielnormalisatie-in-r\/\",\"url\":\"https:\/\/statorials.org\/nl\/kwantielnormalisatie-in-r\/\",\"name\":\"Hoe kwantielnormalisatie uit te voeren in R - Statorials\",\"isPartOf\":{\"@id\":\"https:\/\/statorials.org\/nl\/#website\"},\"datePublished\":\"2023-07-21T18:14:57+00:00\",\"dateModified\":\"2023-07-21T18:14:57+00:00\",\"author\":{\"@id\":\"https:\/\/statorials.org\/nl\/#\/schema\/person\/d4b8842173cca1bb62cdec41860e4219\"},\"description\":\"In deze tutorial wordt uitgelegd hoe u kwantielnormalisatie in R uitvoert, met een compleet voorbeeld.\",\"breadcrumb\":{\"@id\":\"https:\/\/statorials.org\/nl\/kwantielnormalisatie-in-r\/#breadcrumb\"},\"inLanguage\":\"de\",\"potentialAction\":[{\"@type\":\"ReadAction\",\"target\":[\"https:\/\/statorials.org\/nl\/kwantielnormalisatie-in-r\/\"]}]},{\"@type\":\"BreadcrumbList\",\"@id\":\"https:\/\/statorials.org\/nl\/kwantielnormalisatie-in-r\/#breadcrumb\",\"itemListElement\":[{\"@type\":\"ListItem\",\"position\":1,\"name\":\"Thuis\",\"item\":\"https:\/\/statorials.org\/nl\/\"},{\"@type\":\"ListItem\",\"position\":2,\"name\":\"Hoe kwantielnormalisatie uit te voeren in r\"}]},{\"@type\":\"WebSite\",\"@id\":\"https:\/\/statorials.org\/nl\/#website\",\"url\":\"https:\/\/statorials.org\/nl\/\",\"name\":\"Statorials\",\"description\":\"Uw gids voor statistische competentie\",\"potentialAction\":[{\"@type\":\"SearchAction\",\"target\":{\"@type\":\"EntryPoint\",\"urlTemplate\":\"https:\/\/statorials.org\/nl\/?s={search_term_string}\"},\"query-input\":\"required name=search_term_string\"}],\"inLanguage\":\"de\"},{\"@type\":\"Person\",\"@id\":\"https:\/\/statorials.org\/nl\/#\/schema\/person\/d4b8842173cca1bb62cdec41860e4219\",\"name\":\"Dr.benjamin anderson\",\"image\":{\"@type\":\"ImageObject\",\"inLanguage\":\"de\",\"@id\":\"https:\/\/statorials.org\/nl\/#\/schema\/person\/image\/\",\"url\":\"http:\/\/statorials.org\/nl\/wp-content\/uploads\/2023\/10\/Dr.-Benjamin-Anderson-96x96.jpg\",\"contentUrl\":\"http:\/\/statorials.org\/nl\/wp-content\/uploads\/2023\/10\/Dr.-Benjamin-Anderson-96x96.jpg\",\"caption\":\"Dr.benjamin anderson\"},\"description\":\"Ik ben Benjamin, een gepensioneerde hoogleraar statistiek die nu een toegewijde Statorials-lesgever is. Ik heb uitgebreide ervaring en expertise op het gebied van statistiek en ik ben vastbesloten om mijn kennis te delen met studenten via Statorials. Lees verder\",\"sameAs\":[\"http:\/\/statorials.org\/nl\"]}]}<\/script>\n<!-- \/ Yoast SEO plugin. -->","yoast_head_json":{"title":"Hoe kwantielnormalisatie uit te voeren in R - Statorials","description":"In deze tutorial wordt uitgelegd hoe u kwantielnormalisatie in R uitvoert, met een compleet voorbeeld.","robots":{"index":"index","follow":"follow","max-snippet":"max-snippet:-1","max-image-preview":"max-image-preview:large","max-video-preview":"max-video-preview:-1"},"canonical":"https:\/\/statorials.org\/nl\/kwantielnormalisatie-in-r\/","og_locale":"de_DE","og_type":"article","og_title":"Hoe kwantielnormalisatie uit te voeren in R - Statorials","og_description":"In deze tutorial wordt uitgelegd hoe u kwantielnormalisatie in R uitvoert, met een compleet voorbeeld.","og_url":"https:\/\/statorials.org\/nl\/kwantielnormalisatie-in-r\/","og_site_name":"Statorials","article_published_time":"2023-07-21T18:14:57+00:00","author":"Dr.benjamin anderson","twitter_card":"summary_large_image","twitter_misc":{"Verfasst von":"Dr.benjamin anderson","Gesch\u00e4tzte Lesezeit":"2\u00a0Minuten"},"schema":{"@context":"https:\/\/schema.org","@graph":[{"@type":"WebPage","@id":"https:\/\/statorials.org\/nl\/kwantielnormalisatie-in-r\/","url":"https:\/\/statorials.org\/nl\/kwantielnormalisatie-in-r\/","name":"Hoe kwantielnormalisatie uit te voeren in R - Statorials","isPartOf":{"@id":"https:\/\/statorials.org\/nl\/#website"},"datePublished":"2023-07-21T18:14:57+00:00","dateModified":"2023-07-21T18:14:57+00:00","author":{"@id":"https:\/\/statorials.org\/nl\/#\/schema\/person\/d4b8842173cca1bb62cdec41860e4219"},"description":"In deze tutorial wordt uitgelegd hoe u kwantielnormalisatie in R uitvoert, met een compleet voorbeeld.","breadcrumb":{"@id":"https:\/\/statorials.org\/nl\/kwantielnormalisatie-in-r\/#breadcrumb"},"inLanguage":"de","potentialAction":[{"@type":"ReadAction","target":["https:\/\/statorials.org\/nl\/kwantielnormalisatie-in-r\/"]}]},{"@type":"BreadcrumbList","@id":"https:\/\/statorials.org\/nl\/kwantielnormalisatie-in-r\/#breadcrumb","itemListElement":[{"@type":"ListItem","position":1,"name":"Thuis","item":"https:\/\/statorials.org\/nl\/"},{"@type":"ListItem","position":2,"name":"Hoe kwantielnormalisatie uit te voeren in r"}]},{"@type":"WebSite","@id":"https:\/\/statorials.org\/nl\/#website","url":"https:\/\/statorials.org\/nl\/","name":"Statorials","description":"Uw gids voor statistische competentie","potentialAction":[{"@type":"SearchAction","target":{"@type":"EntryPoint","urlTemplate":"https:\/\/statorials.org\/nl\/?s={search_term_string}"},"query-input":"required name=search_term_string"}],"inLanguage":"de"},{"@type":"Person","@id":"https:\/\/statorials.org\/nl\/#\/schema\/person\/d4b8842173cca1bb62cdec41860e4219","name":"Dr.benjamin anderson","image":{"@type":"ImageObject","inLanguage":"de","@id":"https:\/\/statorials.org\/nl\/#\/schema\/person\/image\/","url":"http:\/\/statorials.org\/nl\/wp-content\/uploads\/2023\/10\/Dr.-Benjamin-Anderson-96x96.jpg","contentUrl":"http:\/\/statorials.org\/nl\/wp-content\/uploads\/2023\/10\/Dr.-Benjamin-Anderson-96x96.jpg","caption":"Dr.benjamin anderson"},"description":"Ik ben Benjamin, een gepensioneerde hoogleraar statistiek die nu een toegewijde Statorials-lesgever is. Ik heb uitgebreide ervaring en expertise op het gebied van statistiek en ik ben vastbesloten om mijn kennis te delen met studenten via Statorials. Lees verder","sameAs":["http:\/\/statorials.org\/nl"]}]}},"yoast_meta":{"yoast_wpseo_title":"","yoast_wpseo_metadesc":"","yoast_wpseo_canonical":""},"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/statorials.org\/nl\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/2557","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/statorials.org\/nl\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/statorials.org\/nl\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/statorials.org\/nl\/wp-json\/wp\/v2\/users\/1"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/statorials.org\/nl\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=2557"}],"version-history":[{"count":0,"href":"https:\/\/statorials.org\/nl\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/2557\/revisions"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/statorials.org\/nl\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=2557"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/statorials.org\/nl\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=2557"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/statorials.org\/nl\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=2557"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}