{"id":2661,"date":"2023-07-21T07:12:29","date_gmt":"2023-07-21T07:12:29","guid":{"rendered":"https:\/\/statorials.org\/nl\/bray-curtis-ongelijkheid-in-r\/"},"modified":"2023-07-21T07:12:29","modified_gmt":"2023-07-21T07:12:29","slug":"bray-curtis-ongelijkheid-in-r","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/statorials.org\/nl\/bray-curtis-ongelijkheid-in-r\/","title":{"rendered":"Hoe de bray-curtis-ongelijkheid in r te berekenen"},"content":{"rendered":"<p><\/p>\n<hr>\n<p><span style=\"color: #000000;\"><a href=\"https:\/\/statorials.org\/nl\/bray-curtis-ongelijkheid\/\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">De ongelijkheid van Bray-Curtis<\/a> is een manier om de ongelijkheid tussen twee verschillende locaties te meten.<\/span><\/p>\n<p> <span style=\"color: #000000;\">Het wordt vaak gebruikt in de ecologie en biologie om het verschil tussen twee locaties te kwantificeren in termen van de soorten die op die locaties voorkomen.<\/span><\/p>\n<p> <span style=\"color: #000000;\">Het wordt als volgt berekend:<\/span><\/p>\n<p> <span style=\"color: #000000;\"><strong>BC <sub>ij<\/sub> = 1 \u2013 (2*C <sub>ij<\/sub> ) \/ (S <sub>ik<\/sub> + S <sub>j<\/sub> )<\/strong><\/span><\/p>\n<p> <span style=\"color: #000000;\">Goud:<\/span><\/p>\n<ul>\n<li> <span style=\"color: #000000;\"><strong>C <sub>ij<\/sub> :<\/strong> De som van de laagste waarden voor de soorten die op elke locatie voorkomen.<\/span><\/li>\n<li> <span style=\"color: #000000;\"><strong>S <sub>i<\/sub> :<\/strong> Het totale aantal exemplaren geteld op locatie <em>i<\/em><\/span><\/li>\n<li> <span style=\"color: #000000;\"><strong>S <sub>j<\/sub> :<\/strong> Het totale aantal exemplaren geteld op locatie <em>j<\/em><\/span><\/li>\n<\/ul>\n<p> <span style=\"color: #000000;\">De Bray-Curtis-ongelijkheid ligt altijd tussen 0 en 1 waarbij:<\/span><\/p>\n<ul>\n<li> <span style=\"color: #000000;\"><strong>0<\/strong> geeft aan dat twee sites geen verschil vertonen. Met andere woorden, ze delen precies hetzelfde aantal van elk type soort.<\/span><\/li>\n<li> <span style=\"color: #000000;\"><strong>1<\/strong> geeft aan dat twee locaties volledig van elkaar verschillen. Met andere woorden, ze delen geen enkele soort van hetzelfde type.<\/span><\/li>\n<\/ul>\n<p> <span style=\"color: #000000;\">Stel bijvoorbeeld dat een botanicus op pad gaat en het aantal van vijf verschillende plantensoorten (A, B, C, D en E) op twee verschillende locaties telt.<\/span><\/p>\n<p> <span style=\"color: #000000;\">De volgende tabel vat de gegevens samen die ze heeft verzameld:<\/span> <\/p>\n<p><img decoding=\"async\" loading=\"lazy\" class=\"aligncenter wp-image-15115 \" src=\"https:\/\/statorials.org\/wp-content\/uploads\/2023\/08\/bray_curtis.png\" alt=\"\" width=\"423\" height=\"121\" srcset=\"\" sizes=\"auto, \"><\/p>\n<p> <span style=\"color: #000000;\">Met behulp van deze gegevens kan ze de Bray-Curtis-ongelijkheid als volgt berekenen:<\/span> <\/p>\n<p><img decoding=\"async\" loading=\"lazy\" class=\"aligncenter wp-image-15116 \" src=\"https:\/\/statorials.org\/wp-content\/uploads\/2023\/08\/bray_curtis2.png\" alt=\"Bray-Curtis-verschil\" width=\"419\" height=\"226\" srcset=\"\" sizes=\"auto, \"><\/p>\n<p> <span style=\"color: #000000;\">Door deze getallen te integreren in de Bray-Curtis-ongelijkheidsformule verkrijgen we:<\/span><\/p>\n<ul>\n<li> <span style=\"color: #000000;\">BC <sub>ij<\/sub> = 1 \u2013 (2*C <sub>ij<\/sub> ) \/ (S <sub>ik<\/sub> + S <sub>j<\/sub> )<\/span><\/li>\n<li> <span style=\"color: #000000;\">BC <sub>ij<\/sub> = 1 \u2013 (2*15) \/ (21 + 24)<\/span><\/li>\n<li> <span style=\"color: #000000;\"><sub>BCij<\/sub> = 0,33<\/span><\/li>\n<\/ul>\n<p> <span style=\"color: #000000;\">Het Bray-Curtis-verschil tussen deze twee locaties bedraagt <strong>0,33<\/strong> .<\/span><\/p>\n<p> <span style=\"color: #000000;\">Het volgende voorbeeld laat zien hoe u de Bray-Curtis-ongelijkheid in R kunt berekenen.<\/span><\/p>\n<h3> <span style=\"color: #000000;\"><strong>Voorbeeld: berekening van de Bray-Curtis-ongelijkheid in R<\/strong><\/span><\/h3>\n<p> <span style=\"color: #000000;\">Laten we eerst het volgende dataframe in R maken om onze datawaarden vast te houden:<\/span><\/p>\n<pre style=\"background-color: #ececec; font-size: 15px;\"> <strong><span style=\"color: #008080;\">#create data frame\n<\/span>df &lt;- data. <span style=\"color: #3366ff;\">frame<\/span> (A=c(4, 3),\n                 B=c(0, 6),\n                 C=c(2, 0),\n                 D=c(7, 4),\n                 E=c(8, 11))\n\n<span style=\"color: #008080;\">#view data frame\n<\/span>df\n\n  A B C D E\n1 4 0 2 7 8\n2 3 6 0 4 11<\/strong><\/pre>\n<p> <span style=\"color: #000000;\">We kunnen de volgende code gebruiken om de Bray-Curtis-ongelijkheid tussen de twee rijen in het dataframe te berekenen:<\/span><\/p>\n<pre style=\"background-color: #ececec; font-size: 15px;\"> <strong><span style=\"color: #008080;\">#calculate Bray\u2013Curtis dissimilarity\n<\/span>sum( <span style=\"color: #3366ff;\">apply<\/span> (df, 2, <span style=\"color: #3366ff;\">function<\/span> (x) <span style=\"color: #3366ff;\">abs<\/span> ( <span style=\"color: #3366ff;\">max<\/span> (x)- <span style=\"color: #3366ff;\">min<\/span> (x)))) \/ <span style=\"color: #3366ff;\">sum<\/span> ( <span style=\"color: #3366ff;\">rowSums<\/span> (df))\n\n[1] 0.3333333\n<\/strong><\/pre>\n<p> <span style=\"color: #000000;\">De Bray-Curtis blijkt anders <strong>0,33<\/strong> te zijn.<\/span><\/p>\n<p> <span style=\"color: #000000;\">Dit komt overeen met de waarde die we eerder handmatig hebben berekend.<\/span><\/p>\n<p> <span style=\"color: #000000;\"><strong>Opmerking<\/strong> : deze formule werkt alleen als elke rij in het gegevensframe een afzonderlijke site vertegenwoordigt.<\/span><\/p>\n<h3> <span style=\"color: #000000;\"><strong>Aanvullende bronnen<\/strong><\/span><\/h3>\n<p> <span style=\"color: #000000;\">In de volgende tutorials wordt uitgelegd hoe u andere gelijkenisstatistieken in R kunt berekenen:<\/span><\/p>\n<p> <a href=\"https:\/\/statorials.org\/nl\/jaccard-overeenkomst-in-r\/\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">Hoe Jaccard-gelijkenis in R te berekenen<\/a><br \/> <a href=\"https:\/\/statorials.org\/nl\/cosinus-gelijkenis-r\/\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">Hoe cosinusovereenkomst in R te berekenen<\/a><\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>De ongelijkheid van Bray-Curtis is een manier om de ongelijkheid tussen twee verschillende locaties te meten. Het wordt vaak gebruikt in de ecologie en biologie om het verschil tussen twee locaties te kwantificeren in termen van de soorten die op die locaties voorkomen. Het wordt als volgt berekend: BC ij = 1 \u2013 (2*C ij [&hellip;]<\/p>\n","protected":false},"author":1,"featured_media":0,"comment_status":"open","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"footnotes":""},"categories":[11],"tags":[],"class_list":["post-2661","post","type-post","status-publish","format-standard","hentry","category-gids"],"yoast_head":"<!-- This site is optimized with the Yoast SEO plugin v21.5 - https:\/\/yoast.com\/wordpress\/plugins\/seo\/ -->\n<title>Hoe de Bray-Curtis-ongelijkheid in R - Statorials te berekenen<\/title>\n<meta name=\"description\" content=\"In deze tutorial wordt aan de hand van een voorbeeld uitgelegd hoe u de Bray-Curtis-ongelijkheid in R kunt berekenen.\" \/>\n<meta name=\"robots\" content=\"index, follow, max-snippet:-1, max-image-preview:large, max-video-preview:-1\" \/>\n<link rel=\"canonical\" href=\"https:\/\/statorials.org\/nl\/bray-curtis-ongelijkheid-in-r\/\" \/>\n<meta property=\"og:locale\" content=\"de_DE\" \/>\n<meta property=\"og:type\" content=\"article\" \/>\n<meta property=\"og:title\" content=\"Hoe de Bray-Curtis-ongelijkheid in R - Statorials te berekenen\" \/>\n<meta property=\"og:description\" content=\"In deze tutorial wordt aan de hand van een voorbeeld uitgelegd hoe u de Bray-Curtis-ongelijkheid in R kunt berekenen.\" \/>\n<meta property=\"og:url\" content=\"https:\/\/statorials.org\/nl\/bray-curtis-ongelijkheid-in-r\/\" \/>\n<meta property=\"og:site_name\" content=\"Statorials\" \/>\n<meta property=\"article:published_time\" content=\"2023-07-21T07:12:29+00:00\" \/>\n<meta property=\"og:image\" content=\"https:\/\/statorials.org\/wp-content\/uploads\/2023\/08\/bray_curtis.png\" \/>\n<meta name=\"author\" content=\"Dr.benjamin anderson\" \/>\n<meta name=\"twitter:card\" content=\"summary_large_image\" \/>\n<meta name=\"twitter:label1\" content=\"Verfasst von\" \/>\n\t<meta name=\"twitter:data1\" content=\"Dr.benjamin anderson\" \/>\n\t<meta name=\"twitter:label2\" content=\"Gesch\u00e4tzte Lesezeit\" \/>\n\t<meta name=\"twitter:data2\" content=\"2\u00a0Minuten\" \/>\n<script type=\"application\/ld+json\" class=\"yoast-schema-graph\">{\"@context\":\"https:\/\/schema.org\",\"@graph\":[{\"@type\":\"WebPage\",\"@id\":\"https:\/\/statorials.org\/nl\/bray-curtis-ongelijkheid-in-r\/\",\"url\":\"https:\/\/statorials.org\/nl\/bray-curtis-ongelijkheid-in-r\/\",\"name\":\"Hoe de Bray-Curtis-ongelijkheid in R - Statorials te berekenen\",\"isPartOf\":{\"@id\":\"https:\/\/statorials.org\/nl\/#website\"},\"datePublished\":\"2023-07-21T07:12:29+00:00\",\"dateModified\":\"2023-07-21T07:12:29+00:00\",\"author\":{\"@id\":\"https:\/\/statorials.org\/nl\/#\/schema\/person\/d4b8842173cca1bb62cdec41860e4219\"},\"description\":\"In deze tutorial wordt aan de hand van een voorbeeld uitgelegd hoe u de Bray-Curtis-ongelijkheid in R kunt berekenen.\",\"breadcrumb\":{\"@id\":\"https:\/\/statorials.org\/nl\/bray-curtis-ongelijkheid-in-r\/#breadcrumb\"},\"inLanguage\":\"de\",\"potentialAction\":[{\"@type\":\"ReadAction\",\"target\":[\"https:\/\/statorials.org\/nl\/bray-curtis-ongelijkheid-in-r\/\"]}]},{\"@type\":\"BreadcrumbList\",\"@id\":\"https:\/\/statorials.org\/nl\/bray-curtis-ongelijkheid-in-r\/#breadcrumb\",\"itemListElement\":[{\"@type\":\"ListItem\",\"position\":1,\"name\":\"Thuis\",\"item\":\"https:\/\/statorials.org\/nl\/\"},{\"@type\":\"ListItem\",\"position\":2,\"name\":\"Hoe de bray-curtis-ongelijkheid in r te berekenen\"}]},{\"@type\":\"WebSite\",\"@id\":\"https:\/\/statorials.org\/nl\/#website\",\"url\":\"https:\/\/statorials.org\/nl\/\",\"name\":\"Statorials\",\"description\":\"Uw gids voor statistische competentie\",\"potentialAction\":[{\"@type\":\"SearchAction\",\"target\":{\"@type\":\"EntryPoint\",\"urlTemplate\":\"https:\/\/statorials.org\/nl\/?s={search_term_string}\"},\"query-input\":\"required name=search_term_string\"}],\"inLanguage\":\"de\"},{\"@type\":\"Person\",\"@id\":\"https:\/\/statorials.org\/nl\/#\/schema\/person\/d4b8842173cca1bb62cdec41860e4219\",\"name\":\"Dr.benjamin anderson\",\"image\":{\"@type\":\"ImageObject\",\"inLanguage\":\"de\",\"@id\":\"https:\/\/statorials.org\/nl\/#\/schema\/person\/image\/\",\"url\":\"http:\/\/statorials.org\/nl\/wp-content\/uploads\/2023\/10\/Dr.-Benjamin-Anderson-96x96.jpg\",\"contentUrl\":\"http:\/\/statorials.org\/nl\/wp-content\/uploads\/2023\/10\/Dr.-Benjamin-Anderson-96x96.jpg\",\"caption\":\"Dr.benjamin anderson\"},\"description\":\"Ik ben Benjamin, een gepensioneerde hoogleraar statistiek die nu een toegewijde Statorials-lesgever is. Ik heb uitgebreide ervaring en expertise op het gebied van statistiek en ik ben vastbesloten om mijn kennis te delen met studenten via Statorials. Lees verder\",\"sameAs\":[\"http:\/\/statorials.org\/nl\"]}]}<\/script>\n<!-- \/ Yoast SEO plugin. -->","yoast_head_json":{"title":"Hoe de Bray-Curtis-ongelijkheid in R - Statorials te berekenen","description":"In deze tutorial wordt aan de hand van een voorbeeld uitgelegd hoe u de Bray-Curtis-ongelijkheid in R kunt berekenen.","robots":{"index":"index","follow":"follow","max-snippet":"max-snippet:-1","max-image-preview":"max-image-preview:large","max-video-preview":"max-video-preview:-1"},"canonical":"https:\/\/statorials.org\/nl\/bray-curtis-ongelijkheid-in-r\/","og_locale":"de_DE","og_type":"article","og_title":"Hoe de Bray-Curtis-ongelijkheid in R - Statorials te berekenen","og_description":"In deze tutorial wordt aan de hand van een voorbeeld uitgelegd hoe u de Bray-Curtis-ongelijkheid in R kunt berekenen.","og_url":"https:\/\/statorials.org\/nl\/bray-curtis-ongelijkheid-in-r\/","og_site_name":"Statorials","article_published_time":"2023-07-21T07:12:29+00:00","og_image":[{"url":"https:\/\/statorials.org\/wp-content\/uploads\/2023\/08\/bray_curtis.png"}],"author":"Dr.benjamin anderson","twitter_card":"summary_large_image","twitter_misc":{"Verfasst von":"Dr.benjamin anderson","Gesch\u00e4tzte Lesezeit":"2\u00a0Minuten"},"schema":{"@context":"https:\/\/schema.org","@graph":[{"@type":"WebPage","@id":"https:\/\/statorials.org\/nl\/bray-curtis-ongelijkheid-in-r\/","url":"https:\/\/statorials.org\/nl\/bray-curtis-ongelijkheid-in-r\/","name":"Hoe de Bray-Curtis-ongelijkheid in R - Statorials te berekenen","isPartOf":{"@id":"https:\/\/statorials.org\/nl\/#website"},"datePublished":"2023-07-21T07:12:29+00:00","dateModified":"2023-07-21T07:12:29+00:00","author":{"@id":"https:\/\/statorials.org\/nl\/#\/schema\/person\/d4b8842173cca1bb62cdec41860e4219"},"description":"In deze tutorial wordt aan de hand van een voorbeeld uitgelegd hoe u de Bray-Curtis-ongelijkheid in R kunt berekenen.","breadcrumb":{"@id":"https:\/\/statorials.org\/nl\/bray-curtis-ongelijkheid-in-r\/#breadcrumb"},"inLanguage":"de","potentialAction":[{"@type":"ReadAction","target":["https:\/\/statorials.org\/nl\/bray-curtis-ongelijkheid-in-r\/"]}]},{"@type":"BreadcrumbList","@id":"https:\/\/statorials.org\/nl\/bray-curtis-ongelijkheid-in-r\/#breadcrumb","itemListElement":[{"@type":"ListItem","position":1,"name":"Thuis","item":"https:\/\/statorials.org\/nl\/"},{"@type":"ListItem","position":2,"name":"Hoe de bray-curtis-ongelijkheid in r te berekenen"}]},{"@type":"WebSite","@id":"https:\/\/statorials.org\/nl\/#website","url":"https:\/\/statorials.org\/nl\/","name":"Statorials","description":"Uw gids voor statistische competentie","potentialAction":[{"@type":"SearchAction","target":{"@type":"EntryPoint","urlTemplate":"https:\/\/statorials.org\/nl\/?s={search_term_string}"},"query-input":"required name=search_term_string"}],"inLanguage":"de"},{"@type":"Person","@id":"https:\/\/statorials.org\/nl\/#\/schema\/person\/d4b8842173cca1bb62cdec41860e4219","name":"Dr.benjamin anderson","image":{"@type":"ImageObject","inLanguage":"de","@id":"https:\/\/statorials.org\/nl\/#\/schema\/person\/image\/","url":"http:\/\/statorials.org\/nl\/wp-content\/uploads\/2023\/10\/Dr.-Benjamin-Anderson-96x96.jpg","contentUrl":"http:\/\/statorials.org\/nl\/wp-content\/uploads\/2023\/10\/Dr.-Benjamin-Anderson-96x96.jpg","caption":"Dr.benjamin anderson"},"description":"Ik ben Benjamin, een gepensioneerde hoogleraar statistiek die nu een toegewijde Statorials-lesgever is. Ik heb uitgebreide ervaring en expertise op het gebied van statistiek en ik ben vastbesloten om mijn kennis te delen met studenten via Statorials. Lees verder","sameAs":["http:\/\/statorials.org\/nl"]}]}},"yoast_meta":{"yoast_wpseo_title":"","yoast_wpseo_metadesc":"","yoast_wpseo_canonical":""},"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/statorials.org\/nl\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/2661","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/statorials.org\/nl\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/statorials.org\/nl\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/statorials.org\/nl\/wp-json\/wp\/v2\/users\/1"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/statorials.org\/nl\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=2661"}],"version-history":[{"count":0,"href":"https:\/\/statorials.org\/nl\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/2661\/revisions"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/statorials.org\/nl\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=2661"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/statorials.org\/nl\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=2661"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/statorials.org\/nl\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=2661"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}