Jak obliczyć dffits w r
W statystyce często chcemy wiedzieć, jaki wpływ mają różne obserwacje w modelach regresji.
Jednym ze sposobów obliczenia wpływu obserwacji jest użycie metryki znanej jako DFFITS , która oznacza „różnicę w dopasowaniach”.
Metryka ta mówi nam, jak bardzo zmieniają się przewidywania modelu regresji, gdy pominiemy indywidualną obserwację.
W tym samouczku przedstawiono krok po kroku przykład obliczania i wizualizacji DFFITS dla każdej obserwacji w modelu w języku R.
Krok 1: Utwórz model regresji
Najpierw utworzymy model regresji liniowej wielokrotnej , korzystając ze zbioru danych mtcars wbudowanego w R:
#load the dataset data(mtcars) #fit a regression model model <- lm(mpg~disp+hp, data=mtcars) #view model summary summary(model) Coefficients: Estimate Std. Error t value Pr(>|t|) (Intercept) 30.735904 1.331566 23.083 < 2nd-16 *** available -0.030346 0.007405 -4.098 0.000306 *** hp -0.024840 0.013385 -1.856 0.073679 . --- Significant. codes: 0 '***' 0.001 '**' 0.01 '*' 0.05 '.' 0.1 ' ' 1 Residual standard error: 3.127 on 29 degrees of freedom Multiple R-squared: 0.7482, Adjusted R-squared: 0.7309 F-statistic: 43.09 on 2 and 29 DF, p-value: 2.062e-09
Krok 2: Oblicz DFFITS dla każdej obserwacji
Następnie użyjemy wbudowanej funkcji dffits() do obliczenia wartości DFFITS dla każdej obserwacji w modelu:
#calculate DFFITS for each observation in the model dffits <- as . data . frame (dffits(model)) #display DFFITS for each observation challenges dffits(model) Mazda RX4 -0.14633456 Mazda RX4 Wag -0.14633456 Datsun 710 -0.19956440 Hornet 4 Drive 0.11540062 Hornet Sportabout 0.32140303 Valiant -0.26586716 Duster 360 0.06282342 Merc 240D -0.03521572 Merc 230 -0.09780612 Merc 280 -0.22680622 Merc 280C -0.32763355 Merc 450SE -0.09682952 Merc 450SL -0.03841129 Merc 450SLC -0.17618948 Cadillac Fleetwood -0.15860270 Lincoln Continental -0.15567627 Chrysler Imperial 0.39098449 Fiat 128 0.60265798 Honda Civic 0.35544919 Toyota Corolla 0.78230167 Toyota Corona -0.25804885 Dodge Challenger -0.16674639 AMC Javelin -0.20965432 Camaro Z28 -0.08062828 Pontiac Firebird 0.67858692 Fiat X1-9 0.05951528 Porsche 914-2 0.09453310 Lotus Europa 0.55650363 Ford Pantera L 0.31169050 Ferrari Dino -0.29539098 Maserati Bora 0.76464932 Volvo 142E -0.24266054
Zazwyczaj przyglądamy się bliżej obserwacjom z wartościami DFFITS powyżej progu 2√ p/n gdzie:
- p: Liczba zmiennych predykcyjnych zastosowanych w modelu
- n: Liczba obserwacji wykorzystanych w modelu
W tym przykładzie próg będzie wynosił 0,5 :
#find number of predictors in model p <- length (model$coefficients)-1 #find number of observations n <- nrow (mtcars) #calculate DFFITS threshold value thresh <- 2* sqrt (p/n) thresh [1] 0.5
Możemy posortować obserwacje na podstawie ich wartości DFFITS, aby sprawdzić, czy któraś z nich nie przekracza progu:
#sort observations by DFFITS, descending dffits[ order (-dffits[' dffits(model) ']), ] [1] 0.78230167 0.76464932 0.67858692 0.60265798 0.55650363 0.39098449 [7] 0.35544919 0.32140303 0.31169050 0.11540062 0.09453310 0.06282342 [13] 0.05951528 -0.03521572 -0.03841129 -0.08062828 -0.09682952 -0.09780612 [19] -0.14633456 -0.14633456 -0.15567627 -0.15860270 -0.16674639 -0.17618948 [25] -0.19956440 -0.20965432 -0.22680622 -0.24266054 -0.25804885 -0.26586716 [31] -0.29539098 -0.32763355
Widzimy, że pierwsze pięć obserwacji ma wartość DFFITS większą niż 0,5, co oznacza, że możemy chcieć bliżej przyjrzeć się tym obserwacjom, aby określić, czy mają one duży wpływ na model.
Krok 3: Wizualizuj DFFITS dla każdej obserwacji
Na koniec możemy stworzyć szybki wykres wizualizujący DFFITS dla każdej obserwacji:
#plot DFFITS values for each observation plot(dffits(model), type = ' h ') #add horizontal lines at absolute values for threshold abline(h = thresh, lty = 2) abline(h = -thresh, lty = 2)
Oś x przedstawia indeks każdej obserwacji w zbiorze danych, a wartość y wyświetla odpowiednią wartość DFFITS dla każdej obserwacji.
Dodatkowe zasoby
Jak wykonać prostą regresję liniową w R
Jak wykonać wielokrotną regresję liniową w R
Jak obliczyć statystyki dźwigni w R
Jak utworzyć wykres rezydualny w R