{"id":1557,"date":"2023-07-25T21:38:06","date_gmt":"2023-07-25T21:38:06","guid":{"rendered":"https:\/\/statorials.org\/pl\/test-rangi-logu-w-r\/"},"modified":"2023-07-25T21:38:06","modified_gmt":"2023-07-25T21:38:06","slug":"test-rangi-logu-w-r","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/statorials.org\/pl\/test-rangi-logu-w-r\/","title":{"rendered":"Jak wykona\u0107 test log rank w r"},"content":{"rendered":"<p><\/p>\n<hr>\n<p><span style=\"color: #000000;\"><strong>Test log-rank<\/strong> jest najcz\u0119stszym sposobem por\u00f3wnywania krzywych prze\u017cycia mi\u0119dzy dwiema grupami.<\/span><\/p>\n<p> <span style=\"color: #000000;\">W tym te\u015bcie przyj\u0119to nast\u0119puj\u0105ce <a href=\"https:\/\/statorials.org\/pl\/testowanie-hipotez-1\/\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">za\u0142o\u017cenia<\/a> :<\/span><\/p>\n<p> <span style=\"color: #000000;\"><strong>H <sub>0<\/sub> :<\/strong> Nie ma r\u00f3\u017cnicy w prze\u017cyciu pomi\u0119dzy obiema grupami.<\/span><\/p>\n<p> <span style=\"color: #000000;\"><strong>H <sub>A<\/sub> :<\/strong> <em>Istnieje<\/em> r\u00f3\u017cnica w prze\u017cywalno\u015bci pomi\u0119dzy obiema grupami.<\/span><\/p>\n<p> <span style=\"color: #000000;\">Je\u015bli <a href=\"https:\/\/statorials.org\/pl\/p-oznacza-istotnosc-statystyczna\/\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">warto\u015b\u0107 p<\/a> testu jest poni\u017cej pewnego poziomu istotno\u015bci (np. \u03b1 = 0,05), w\u00f3wczas mo\u017cemy odrzuci\u0107 hipotez\u0119 zerow\u0105 i stwierdzi\u0107, \u017ce istniej\u0105 wystarczaj\u0105ce dowody, aby stwierdzi\u0107, \u017ce istnieje r\u00f3\u017cnica w prze\u017cywalno\u015bci pomi\u0119dzy obiema grupami.<\/span><\/p>\n<p> <span style=\"color: #000000;\">Aby wykona\u0107 test log-rank w R, mo\u017cemy u\u017cy\u0107 funkcji <strong>survdiff()<\/strong> z pakietu <strong>survival<\/strong> , kt\u00f3ra wykorzystuje nast\u0119puj\u0105c\u0105 sk\u0142adni\u0119:<\/span><\/p>\n<p> <span style=\"color: #000000;\"><strong>survdiff(Surv(czas, status) ~ predyktory, dane)<\/strong><\/span><\/p>\n<p> <span style=\"color: #000000;\">Ta funkcja zwraca statystyk\u0119 testu chi-kwadrat i odpowiadaj\u0105c\u0105 jej warto\u015b\u0107 p.<\/span><\/p>\n<p> <span style=\"color: #000000;\">Poni\u017cszy przyk\u0142ad pokazuje, jak u\u017cywa\u0107 tej funkcji do wykonywania testu log-rank w j\u0119zyku R.<\/span><\/p>\n<h3> <span style=\"color: #000000;\"><strong>Przyk\u0142ad: Test Log Rank w R<\/strong><\/span><\/h3>\n<p> <span style=\"color: #000000;\">W tym przyk\u0142adzie u\u017cyjemy zestawu danych <strong>dotycz\u0105cych jajnik\u00f3w<\/strong> z pakietu <strong>prze\u017cycia<\/strong> . Ten zbi\u00f3r danych zawiera nast\u0119puj\u0105ce informacje na temat 26 pacjent\u00f3w:<\/span><\/p>\n<ul>\n<li> <span style=\"color: #000000;\">Czas prze\u017cycia (w miesi\u0105cach) po zdiagnozowaniu raka jajnika<\/span><\/li>\n<li> <span style=\"color: #000000;\">Niezale\u017cnie od tego, czy czas przetrwania by\u0142 cenzurowany<\/span><\/li>\n<li> <span style=\"color: #000000;\">Rodzaj otrzymanego leczenia (rx = 1 lub rx = 2)<\/span><\/li>\n<\/ul>\n<p> <span style=\"color: #000000;\">Poni\u017cszy kod pokazuje, jak wy\u015bwietli\u0107 pierwsze sze\u015b\u0107 wierszy tego zbioru danych:<\/span><\/p>\n<pre style=\"background-color: #ececec; font-size: 15px;\"> <strong><span style=\"color: #993300;\">library<\/span> (survival)\n\n<span style=\"color: #008080;\">#view first six rows of dataset\n<\/span>head(ovarian)\n\n  futime fustat age resid.ds rx ecog.ps\n1 59 1 72.3315 2 1 1\n2 115 1 74.4932 2 1 1\n3 156 1 66.4658 2 1 2\n4 421 0 53.3644 2 2 1\n5,431 1 50.3397 2 1 1\n6 448 0 56.4301 1 1 2<\/strong><\/pre>\n<p> <span style=\"color: #000000;\">Poni\u017cszy kod pokazuje, jak przeprowadzi\u0107 test log-rank w celu ustalenia, czy istnieje r\u00f3\u017cnica w prze\u017cyciu mi\u0119dzy pacjentami, kt\u00f3rzy otrzymali r\u00f3\u017cne metody leczenia:<\/span><\/p>\n<pre style=\"background-color: #ececec; font-size: 15px;\"> <strong><span style=\"color: #008080;\">#perform log rank test\n<\/span>survdiff(Surv(futime, fustat) ~ rx, data=ovarian)\n\nCall:\nsurvdiff(formula = Surv(futime, fustat) ~ rx, data = ovarian)\n\n      N Observed Expected (OE)^2\/E (OE)^2\/V\nrx=1 13 7 5.23 0.596 1.06\nrx=2 13 5 6.77 0.461 1.06\n\n Chisq= 1.1 on 1 degrees of freedom, p= 0.3 \n<\/strong><\/pre>\n<p> <span style=\"color: #000000;\">Statystyka testu Chi-kwadrat wynosi <b>1,1<\/b> z 1 stopniem swobody, a odpowiadaj\u0105ca jej warto\u015b\u0107 p wynosi <strong>0,3<\/strong> . Poniewa\u017c ta warto\u015b\u0107 p jest nie mniejsza ni\u017c 0,05, nie mo\u017cemy odrzuci\u0107 hipotezy zerowej.<\/span><\/p>\n<p> <span style=\"color: #000000;\">Innymi s\u0142owy, nie mamy wystarczaj\u0105cych dowod\u00f3w, aby stwierdzi\u0107, \u017ce istnieje statystycznie istotna r\u00f3\u017cnica w prze\u017cyciu pomi\u0119dzy tymi dwoma sposobami leczenia.<\/span><\/p>\n<p> <span style=\"color: #000000;\">Mo\u017cemy r\u00f3wnie\u017c wykre\u015bli\u0107 krzywe prze\u017cycia dla ka\u017cdej grupy, u\u017cywaj\u0105c nast\u0119puj\u0105cej sk\u0142adni:<\/span> <\/p>\n<pre style=\"background-color: #ececec; font-size: 15px;\"> <strong><span style=\"color: #008080;\">#plot survival curves for each treatment group\n<\/span>plot(survfit(Surv(futime, fustat) ~ rx, data = ovarian), \n     xlab = \" <span style=\"color: #008000;\">Time<\/span> \", \n     ylab = \u201c <span style=\"color: #008000;\">Overall survival probability<\/span> \u201d)\n<\/strong><\/pre>\n<p><img decoding=\"async\" loading=\"lazy\" class=\"aligncenter wp-image-15424 \" src=\"https:\/\/statorials.org\/wp-content\/uploads\/2023\/08\/logranktest1.png\" alt=\"Wykres krzywych prze\u017cycia w R\" width=\"428\" height=\"390\" srcset=\"\" sizes=\"auto, \"><\/p>\n<p> <span style=\"color: #000000;\">Widzimy, \u017ce krzywe prze\u017cycia s\u0105 nieco inne, ale test log-rank powiedzia\u0142 nam, \u017ce r\u00f3\u017cnica nie jest istotna statystycznie.<\/span><\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>Test log-rank jest najcz\u0119stszym sposobem por\u00f3wnywania krzywych prze\u017cycia mi\u0119dzy dwiema grupami. W tym te\u015bcie przyj\u0119to nast\u0119puj\u0105ce za\u0142o\u017cenia : H 0 : Nie ma r\u00f3\u017cnicy w prze\u017cyciu pomi\u0119dzy obiema grupami. H A : Istnieje r\u00f3\u017cnica w prze\u017cywalno\u015bci pomi\u0119dzy obiema grupami. Je\u015bli warto\u015b\u0107 p testu jest poni\u017cej pewnego poziomu istotno\u015bci (np. \u03b1 = 0,05), w\u00f3wczas mo\u017cemy odrzuci\u0107 [&hellip;]<\/p>\n","protected":false},"author":1,"featured_media":0,"comment_status":"open","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"footnotes":""},"categories":[3],"tags":[],"class_list":["post-1557","post","type-post","status-publish","format-standard","hentry","category-przewodnik"],"yoast_head":"<!-- This site is optimized with the Yoast SEO plugin v21.5 - https:\/\/yoast.com\/wordpress\/plugins\/seo\/ -->\n<title>Jak wykona\u0107 test Log Rank w R - Statology<\/title>\n<meta name=\"description\" content=\"W tym samouczku wyja\u015bniono, na przyk\u0142adzie, jak przeprowadzi\u0107 test log-rank w j\u0119zyku R.\" \/>\n<meta name=\"robots\" content=\"index, follow, max-snippet:-1, max-image-preview:large, max-video-preview:-1\" \/>\n<link rel=\"canonical\" href=\"https:\/\/statorials.org\/pl\/test-rangi-logu-w-r\/\" \/>\n<meta property=\"og:locale\" content=\"pl_PL\" \/>\n<meta property=\"og:type\" content=\"article\" \/>\n<meta property=\"og:title\" content=\"Jak wykona\u0107 test Log Rank w R - Statology\" \/>\n<meta property=\"og:description\" content=\"W tym samouczku wyja\u015bniono, na przyk\u0142adzie, jak przeprowadzi\u0107 test log-rank w j\u0119zyku R.\" \/>\n<meta property=\"og:url\" content=\"https:\/\/statorials.org\/pl\/test-rangi-logu-w-r\/\" \/>\n<meta property=\"og:site_name\" content=\"Statorials\" \/>\n<meta property=\"article:published_time\" content=\"2023-07-25T21:38:06+00:00\" \/>\n<meta property=\"og:image\" content=\"https:\/\/statorials.org\/wp-content\/uploads\/2023\/08\/logranktest1.png\" \/>\n<meta name=\"author\" content=\"Benjamin Anderson\" \/>\n<meta name=\"twitter:card\" content=\"summary_large_image\" \/>\n<meta name=\"twitter:label1\" content=\"Napisane przez\" \/>\n\t<meta name=\"twitter:data1\" content=\"Benjamin Anderson\" \/>\n\t<meta name=\"twitter:label2\" content=\"Szacowany czas czytania\" \/>\n\t<meta name=\"twitter:data2\" content=\"2 minuty\" \/>\n<script type=\"application\/ld+json\" class=\"yoast-schema-graph\">{\"@context\":\"https:\/\/schema.org\",\"@graph\":[{\"@type\":\"WebPage\",\"@id\":\"https:\/\/statorials.org\/pl\/test-rangi-logu-w-r\/\",\"url\":\"https:\/\/statorials.org\/pl\/test-rangi-logu-w-r\/\",\"name\":\"Jak wykona\u0107 test Log Rank w R - Statology\",\"isPartOf\":{\"@id\":\"https:\/\/statorials.org\/pl\/#website\"},\"datePublished\":\"2023-07-25T21:38:06+00:00\",\"dateModified\":\"2023-07-25T21:38:06+00:00\",\"author\":{\"@id\":\"https:\/\/statorials.org\/pl\/#\/schema\/person\/6484727a4612df3e69f016c3129c6965\"},\"description\":\"W tym samouczku wyja\u015bniono, na przyk\u0142adzie, jak przeprowadzi\u0107 test log-rank w j\u0119zyku R.\",\"breadcrumb\":{\"@id\":\"https:\/\/statorials.org\/pl\/test-rangi-logu-w-r\/#breadcrumb\"},\"inLanguage\":\"pl-PL\",\"potentialAction\":[{\"@type\":\"ReadAction\",\"target\":[\"https:\/\/statorials.org\/pl\/test-rangi-logu-w-r\/\"]}]},{\"@type\":\"BreadcrumbList\",\"@id\":\"https:\/\/statorials.org\/pl\/test-rangi-logu-w-r\/#breadcrumb\",\"itemListElement\":[{\"@type\":\"ListItem\",\"position\":1,\"name\":\"Dom\",\"item\":\"https:\/\/statorials.org\/pl\/\"},{\"@type\":\"ListItem\",\"position\":2,\"name\":\"Jak wykona\u0107 test log rank w r\"}]},{\"@type\":\"WebSite\",\"@id\":\"https:\/\/statorials.org\/pl\/#website\",\"url\":\"https:\/\/statorials.org\/pl\/\",\"name\":\"Statorials\",\"description\":\"Tw\u00f3j przewodnik po kompetencjach statystycznych!\",\"potentialAction\":[{\"@type\":\"SearchAction\",\"target\":{\"@type\":\"EntryPoint\",\"urlTemplate\":\"https:\/\/statorials.org\/pl\/?s={search_term_string}\"},\"query-input\":\"required name=search_term_string\"}],\"inLanguage\":\"pl-PL\"},{\"@type\":\"Person\",\"@id\":\"https:\/\/statorials.org\/pl\/#\/schema\/person\/6484727a4612df3e69f016c3129c6965\",\"name\":\"Benjamin Anderson\",\"image\":{\"@type\":\"ImageObject\",\"inLanguage\":\"pl-PL\",\"@id\":\"https:\/\/statorials.org\/pl\/#\/schema\/person\/image\/\",\"url\":\"https:\/\/statorials.org\/pl\/wp-content\/uploads\/2023\/11\/Benjamin-Anderson-96x96.jpg\",\"contentUrl\":\"https:\/\/statorials.org\/pl\/wp-content\/uploads\/2023\/11\/Benjamin-Anderson-96x96.jpg\",\"caption\":\"Benjamin Anderson\"},\"description\":\"Cze\u015b\u0107, jestem Benjamin i jestem emerytowanym profesorem statystyki, kt\u00f3ry zosta\u0142 oddanym nauczycielem Statorials. Dzi\u0119ki bogatemu do\u015bwiadczeniu i wiedzy specjalistycznej w dziedzinie statystyki ch\u0119tnie dziel\u0119 si\u0119 swoj\u0105 wiedz\u0105, aby wzmocni\u0107 pozycj\u0119 uczni\u00f3w za po\u015brednictwem Statorials. Wiedzie\u0107 wi\u0119cej\",\"sameAs\":[\"https:\/\/statorials.org\/pl\"]}]}<\/script>\n<!-- \/ Yoast SEO plugin. -->","yoast_head_json":{"title":"Jak wykona\u0107 test Log Rank w R - Statology","description":"W tym samouczku wyja\u015bniono, na przyk\u0142adzie, jak przeprowadzi\u0107 test log-rank w j\u0119zyku R.","robots":{"index":"index","follow":"follow","max-snippet":"max-snippet:-1","max-image-preview":"max-image-preview:large","max-video-preview":"max-video-preview:-1"},"canonical":"https:\/\/statorials.org\/pl\/test-rangi-logu-w-r\/","og_locale":"pl_PL","og_type":"article","og_title":"Jak wykona\u0107 test Log Rank w R - Statology","og_description":"W tym samouczku wyja\u015bniono, na przyk\u0142adzie, jak przeprowadzi\u0107 test log-rank w j\u0119zyku R.","og_url":"https:\/\/statorials.org\/pl\/test-rangi-logu-w-r\/","og_site_name":"Statorials","article_published_time":"2023-07-25T21:38:06+00:00","og_image":[{"url":"https:\/\/statorials.org\/wp-content\/uploads\/2023\/08\/logranktest1.png"}],"author":"Benjamin Anderson","twitter_card":"summary_large_image","twitter_misc":{"Napisane przez":"Benjamin Anderson","Szacowany czas czytania":"2 minuty"},"schema":{"@context":"https:\/\/schema.org","@graph":[{"@type":"WebPage","@id":"https:\/\/statorials.org\/pl\/test-rangi-logu-w-r\/","url":"https:\/\/statorials.org\/pl\/test-rangi-logu-w-r\/","name":"Jak wykona\u0107 test Log Rank w R - Statology","isPartOf":{"@id":"https:\/\/statorials.org\/pl\/#website"},"datePublished":"2023-07-25T21:38:06+00:00","dateModified":"2023-07-25T21:38:06+00:00","author":{"@id":"https:\/\/statorials.org\/pl\/#\/schema\/person\/6484727a4612df3e69f016c3129c6965"},"description":"W tym samouczku wyja\u015bniono, na przyk\u0142adzie, jak przeprowadzi\u0107 test log-rank w j\u0119zyku R.","breadcrumb":{"@id":"https:\/\/statorials.org\/pl\/test-rangi-logu-w-r\/#breadcrumb"},"inLanguage":"pl-PL","potentialAction":[{"@type":"ReadAction","target":["https:\/\/statorials.org\/pl\/test-rangi-logu-w-r\/"]}]},{"@type":"BreadcrumbList","@id":"https:\/\/statorials.org\/pl\/test-rangi-logu-w-r\/#breadcrumb","itemListElement":[{"@type":"ListItem","position":1,"name":"Dom","item":"https:\/\/statorials.org\/pl\/"},{"@type":"ListItem","position":2,"name":"Jak wykona\u0107 test log rank w r"}]},{"@type":"WebSite","@id":"https:\/\/statorials.org\/pl\/#website","url":"https:\/\/statorials.org\/pl\/","name":"Statorials","description":"Tw\u00f3j przewodnik po kompetencjach statystycznych!","potentialAction":[{"@type":"SearchAction","target":{"@type":"EntryPoint","urlTemplate":"https:\/\/statorials.org\/pl\/?s={search_term_string}"},"query-input":"required name=search_term_string"}],"inLanguage":"pl-PL"},{"@type":"Person","@id":"https:\/\/statorials.org\/pl\/#\/schema\/person\/6484727a4612df3e69f016c3129c6965","name":"Benjamin Anderson","image":{"@type":"ImageObject","inLanguage":"pl-PL","@id":"https:\/\/statorials.org\/pl\/#\/schema\/person\/image\/","url":"https:\/\/statorials.org\/pl\/wp-content\/uploads\/2023\/11\/Benjamin-Anderson-96x96.jpg","contentUrl":"https:\/\/statorials.org\/pl\/wp-content\/uploads\/2023\/11\/Benjamin-Anderson-96x96.jpg","caption":"Benjamin Anderson"},"description":"Cze\u015b\u0107, jestem Benjamin i jestem emerytowanym profesorem statystyki, kt\u00f3ry zosta\u0142 oddanym nauczycielem Statorials. Dzi\u0119ki bogatemu do\u015bwiadczeniu i wiedzy specjalistycznej w dziedzinie statystyki ch\u0119tnie dziel\u0119 si\u0119 swoj\u0105 wiedz\u0105, aby wzmocni\u0107 pozycj\u0119 uczni\u00f3w za po\u015brednictwem Statorials. Wiedzie\u0107 wi\u0119cej","sameAs":["https:\/\/statorials.org\/pl"]}]}},"yoast_meta":{"yoast_wpseo_title":"","yoast_wpseo_metadesc":"","yoast_wpseo_canonical":""},"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/statorials.org\/pl\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/1557","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/statorials.org\/pl\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/statorials.org\/pl\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/statorials.org\/pl\/wp-json\/wp\/v2\/users\/1"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/statorials.org\/pl\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=1557"}],"version-history":[{"count":0,"href":"https:\/\/statorials.org\/pl\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/1557\/revisions"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/statorials.org\/pl\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=1557"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/statorials.org\/pl\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=1557"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/statorials.org\/pl\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=1557"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}