Como calcular odds ratio em r (com exemplo)

Nas estatísticas, uma razão de probabilidades diz-nos a razão entre as probabilidades de um evento ocorrer num grupo de tratamento e as probabilidades de um evento ocorrer num grupo de controlo.

Freqüentemente calculamos uma razão de chances ao realizar análises em uma tabela 2 por 2, que assume o seguinte formato:

Para calcular uma razão de chances em R, podemos usar a função oddsratio() do pacote epitools .

O exemplo a seguir mostra como usar essa sintaxe na prática.

Exemplo: Calcule uma razão de chances em R

Digamos que 50 jogadores de basquete estejam usando um novo programa de treinamento e 50 jogadores estejam usando um programa de treinamento antigo. No final do programa, testamos cada jogador para ver se ele passa em determinado teste de habilidade.

A tabela a seguir mostra o número de jogadores que passaram e falharam, com base no programa que utilizaram:

Digamos que queremos calcular uma razão de chances para comparar as chances de um jogador passar no teste de habilidades usando o novo programa versus usando o programa antigo.

Veja como criar esta matriz em R:

 #create matrix
program <- c(' New Program ', ' Old Program ')
outcome <- c(' Pass ', ' Fail ')
data <- matrix(c(34, 16, 39, 11), nrow= 2 , ncol= 2 , byrow= TRUE )
dimnames(data) <- list(' Program '=program, ' Outcome '=outcome)

#view matrix
data

             Outcome
Program Pass Fail
  New Program 34 16
  Old Program 39 11

E aqui está como calcular a razão de chances usando a função oddsratio() do pacote epitools :

 install. packages (' epitools ')

library (epitools)

#calculate odds ratio
oddsratio(data)

$measure
             odds ratio with 95% CI
Program estimate lower upper
  New Program 1.0000000 NA NA
  Old Program 0.6045506 0.2395879 1.480143

$p.value
             two-sided
Program midp.exact fisher.exact chi.square
  New Program NA NA NA
  Old Program 0.271899 0.3678219 0.2600686

$correction
[1] FALSE

attr(,"method")
[1] “median-unbiased estimate & mid-p exact CI”

A razão de chances acabou sendo 0,6045506 .

Interpretamos isso como significando que as chances de um jogador passar no teste usando o novo programa são apenas 0,6045506 vezes as chances de um jogador passar no teste usando o programa antigo.

Ou seja, as chances de um jogador passar no teste são reduzidas em aproximadamente 39,6% com o uso do novo programa.

Também podemos usar os valores nas colunas inferior e superior do resultado para construir o seguinte intervalo de confiança de 95% para a razão de chances:

Intervalo de confiança de 95% para a razão de chances: [0,24, 1,48] .

Temos 95% de certeza de que a verdadeira razão de probabilidade entre o novo e o antigo programa de treinamento está contida neste intervalo.

A coluna midp.exact na saída também exibe o valor p associado à razão de chances.

Esse valor p acaba sendo 0,271899 . Dado que este valor não é inferior a 0,05, concluiríamos que o odds ratio não é estatisticamente significativo.

Por outras palavras, sabemos pela razão de probabilidades que a probabilidade de sucesso de um jogador utilizando o novo programa é menor do que a probabilidade de sucesso utilizando o programa antigo, mas a diferença entre estas probabilidades não é estatisticamente significativa.

Recursos adicionais

Os tutoriais a seguir fornecem informações adicionais sobre odds ratio:

Razão de chances versus risco relativo: qual a diferença?
O guia completo: como relatar taxas de probabilidade
Como calcular um intervalo de confiança para uma razão de chances