Как создать диаграмму рассеяния с линией регрессии в r


Часто, когда мы выполняем простую линейную регрессию, мы хотим создать диаграмму рассеяния, чтобы визуализировать различные комбинации значений x и y.

К счастью, R позволяет легко создавать облака точек с помощью функцииplot() . Например:

 #create some fake data
data <- data.frame(x = c(1, 1, 2, 3, 4, 4, 5, 6, 7, 7, 8, 9, 10, 11, 11),
                   y = c(13, 14, 17, 12, 23, 24, 25, 25, 24, 28, 32, 33, 35, 40, 41))

#create scatterplot of data
plot(data$x, data$y)

Диаграмма рассеяния в R

Также легко добавить линию регрессии к диаграмме рассеяния с помощью функции abline() .

Например:

 #fit a simple linear regression model
model <- lm(y ~ x, data = data)

#add the fitted regression line to the scatterplot
abline(model) 

Диаграмма рассеяния с линией регрессии в R

Мы также можем добавить на график линии доверительного интервала, используя функцию предсказывания() :

 #define range of x values
newx = seq(min(data$x),max(data$x),by = 1)

#find 95% confidence interval for the range of x values 
conf_interval <- predict(model, newdata=data.frame(x=newx), interval="confidence",
                         level = 0.95)

#create scatterplot of values with regression line
plot(data$x, data$y)
abline(model)

#add dashed lines (lty=2) for the 95% confidence interval
lines(newx, conf_interval[,2], col="blue", lty=2)
lines(newx, conf_interval[,3], col="blue", lty=2)

Линия регрессии с доверительным интервалом в R

Или вместо этого мы могли бы добавить на график линии интервала прогнозирования, указав тип интервала в функции прогнозирования() :

 #define range of x values
newx = seq(min(data$x),max(data$x),by = 1)

#find 95% prediction interval for the range of x values 
pred_interval <- predict(model, newdata=data.frame(x=newx), interval="prediction" ,
                         level = 0.95)

#create scatterplot of values with regression line
plot(data$x, data$y)
abline(model)

#add dashed lines (lty=2) for the 95% confidence interval
lines(newx, pred_interval[,2], col="red", lty=2)
lines(newx, pred_interval[,3], col="red", lty=2)

Линия регрессии с линиями интервала прогнозирования в R

Наконец, мы можем сделать график более эстетичным, добавив заголовок, изменив названия осей и изменив форму отдельных точек графика.

 plot(data$x, data$y,
     main = "Scatterplot of x vs. y", #add title
     pch=16, #specify points to be filled in
     xlab='x', #change x-axis name
ylab='y') #change y-axis name

abline(model, col='steelblue') #specify color of regression line

Линия регрессии с диаграммой рассеяния в R

Дополнительные ресурсы

В следующих руководствах объясняется, как выполнять другие распространенные задачи в R:

Как пометить точки на диаграмме рассеяния в R
Как использовать функцию Jitter в R для облаков точек

Добавить комментарий

Ваш адрес email не будет опубликован. Обязательные поля помечены *