{"id":4493,"date":"2023-07-10T16:35:21","date_gmt":"2023-07-10T16:35:21","guid":{"rendered":"https:\/\/statorials.org\/th\/%e0%b9%81%e0%b8%9c%e0%b8%99%e0%b8%97%e0%b8%b5%e0%b9%88%e0%b8%84%e0%b8%a7%e0%b8%b2%e0%b8%a1%e0%b8%a3%e0%b9%89%e0%b8%ad%e0%b8%99-r\/"},"modified":"2023-07-10T16:35:21","modified_gmt":"2023-07-10T16:35:21","slug":"%e0%b9%81%e0%b8%9c%e0%b8%99%e0%b8%97%e0%b8%b5%e0%b9%88%e0%b8%84%e0%b8%a7%e0%b8%b2%e0%b8%a1%e0%b8%a3%e0%b9%89%e0%b8%ad%e0%b8%99-r","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/statorials.org\/th\/%e0%b9%81%e0%b8%9c%e0%b8%99%e0%b8%97%e0%b8%b5%e0%b9%88%e0%b8%84%e0%b8%a7%e0%b8%b2%e0%b8%a1%e0%b8%a3%e0%b9%89%e0%b8%ad%e0%b8%99-r\/","title":{"rendered":"\u0e27\u0e34\u0e18\u0e35\u0e43\u0e0a\u0e49 pheatmap() \u0e43\u0e19 r \u0e40\u0e1e\u0e37\u0e48\u0e2d\u0e2a\u0e23\u0e49\u0e32\u0e07\u0e41\u0e1c\u0e19\u0e17\u0e35\u0e48\u0e04\u0e27\u0e32\u0e21\u0e23\u0e49\u0e2d\u0e19"},"content":{"rendered":"

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\u0e04\u0e38\u0e13\u0e2a\u0e32\u0e21\u0e32\u0e23\u0e16\u0e43\u0e0a\u0e49\u0e1f\u0e31\u0e07\u0e01\u0e4c\u0e0a\u0e31\u0e19 pheatmap()<\/strong> \u0e02\u0e2d\u0e07\u0e41\u0e1e\u0e47\u0e04\u0e40\u0e01\u0e08 pheatmap<\/strong> \u0e43\u0e19 R \u0e40\u0e1e\u0e37\u0e48\u0e2d\u0e2a\u0e23\u0e49\u0e32\u0e07\u0e41\u0e1c\u0e19\u0e17\u0e35\u0e48\u0e04\u0e27\u0e32\u0e21\u0e23\u0e49\u0e2d\u0e19\u0e17\u0e35\u0e48\u0e1b\u0e23\u0e31\u0e1a\u0e41\u0e15\u0e48\u0e07\u0e44\u0e14\u0e49\u0e2a\u0e39\u0e07<\/span><\/p>\n

\u0e15\u0e31\u0e27\u0e2d\u0e22\u0e48\u0e32\u0e07\u0e15\u0e48\u0e2d\u0e44\u0e1b\u0e19\u0e35\u0e49\u0e41\u0e2a\u0e14\u0e07\u0e27\u0e34\u0e18\u0e35\u0e43\u0e0a\u0e49\u0e1f\u0e31\u0e07\u0e01\u0e4c\u0e0a\u0e31\u0e19\u0e19\u0e35\u0e49\u0e43\u0e19\u0e17\u0e32\u0e07\u0e1b\u0e0f\u0e34\u0e1a\u0e31\u0e15\u0e34\u0e01\u0e31\u0e1a\u0e0a\u0e38\u0e14\u0e02\u0e49\u0e2d\u0e21\u0e39\u0e25\u0e1b\u0e25\u0e2d\u0e21\u0e15\u0e48\u0e2d\u0e44\u0e1b\u0e19\u0e35\u0e49:<\/span><\/p>\n

 #make this example reproducible\n<\/span>set. seeds<\/span> (1)\n\n#create matrix with fake data values\n<\/span>data = matrix(rnorm(100), 20, 5)\ndata[1:10, seq(1, 5, 1)] = data[1:10, seq(1, 5, 1)] + 3\ndata [11:20, seq(2, 5, 1)] = data [11:20, seq(2, 5, 1)] + 2\ndata [15:20, seq(2, 5, 1)] = data [15:20, seq(2, 5, 1)] + 4\n\n#add column names and row names\n<\/span>colnames(data) = paste(\" T<\/span> \", 1:5, sep = \"\")\nrownames(data) = paste(\" Gene<\/span> \", 1:20, sep=\"\")\n\n#view matrx\n<\/span>data\n\n                T1 T2 T3 T4 T5\nGene1 2.37354619 3.918977 2.8354764 5.401618 2.431331\nGene2 3.18364332 3.782136 2.7466383 2.960760 2.864821\nGene3 2.16437139 3.074565 3.6969634 3.689739 4.178087\nGene4 4.59528080 1.010648 3.5566632 3.028002 1.476433\nGene5 3.32950777 3.619826 2.3112443 2.256727 3.593946\nGene6 2.17953162 2.943871 2.2925048 3.188792 3.332950\nGene7 3.48742905 2.844204 3.3645820 1.195041 4.063100\nGene8 3.73832471 1.529248 3.7685329 4.465555 2.695816\nGene9 3.57578135 2.521850 2.8876538 3.153253 3.370019\nGene10 2.69461161 3.417942 3.8811077 5.172612 3.267099\nGene11 1.51178117 3.358680 2.3981059 2.475510 1.457480\nGene12 0.38984324 1.897212 1.3879736 1.290054 3.207868\nGene13 -0.62124058 2.387672 2.3411197 2.610726 3.160403\nGene14 -2.21469989 1.946195 0.8706369 1.065902 2.700214\nGene15 1.12493092 4.622940 7.4330237 4.746367 7.586833\nGene16 -0.04493361 5.585005 7.9803999 6.291446 6.558486\nGene17 -0.01619026 5.605710 5.6327785 5.556708 4.723408\nGene18 0.94383621 5.940687 4.9558654 6.001105 5.426735\nGene19 0.82122120 7.100025 6.5697196 6.074341 4.775387\nGene20 0.59390132 6.763176 5.8649454 5.410479 5.526599<\/strong><\/pre>\n
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 \u0e40\u0e23\u0e32\u0e2a\u0e32\u0e21\u0e32\u0e23\u0e16\u0e2a\u0e23\u0e49\u0e32\u0e07\u0e41\u0e1c\u0e19\u0e17\u0e35\u0e48\u0e04\u0e27\u0e32\u0e21\u0e23\u0e49\u0e2d\u0e19\u0e14\u0e49\u0e27\u0e22\u0e01\u0e32\u0e23\u0e15\u0e31\u0e49\u0e07\u0e04\u0e48\u0e32\u0e40\u0e23\u0e34\u0e48\u0e21\u0e15\u0e49\u0e19\u0e43\u0e19 \u0e41\u0e1c\u0e19\u0e17\u0e35\u0e48\u0e04\u0e27\u0e32\u0e21\u0e23\u0e49\u0e2d\u0e19<\/strong> \u0e40\u0e1e\u0e37\u0e48\u0e2d\u0e43\u0e2b\u0e49\u0e40\u0e2b\u0e47\u0e19\u0e20\u0e32\u0e1e\u0e04\u0e48\u0e32\u0e40\u0e21\u0e17\u0e23\u0e34\u0e01\u0e0b\u0e4c\u0e17\u0e31\u0e49\u0e07\u0e2b\u0e21\u0e14:<\/span> <\/p>\n
 library<\/span> (heatmap)\n\n#create basic heatmap<\/span>\npheatmap(data)<\/span><\/span><\/strong> <\/pre>\n
\"\u0e15\u0e31\u0e27\u0e2d\u0e22\u0e48\u0e32\u0e07<\/p>\n
 \u0e15\u0e31\u0e27\u0e2d\u0e22\u0e48\u0e32\u0e07\u0e17\u0e35\u0e48 2: \u0e2a\u0e23\u0e49\u0e32\u0e07\u0e41\u0e1c\u0e19\u0e17\u0e35\u0e48\u0e04\u0e27\u0e32\u0e21\u0e23\u0e49\u0e2d\u0e19\u0e1e\u0e23\u0e49\u0e2d\u0e21\u0e1b\u0e49\u0e32\u0e22\u0e01\u0e33\u0e01\u0e31\u0e1a\u0e40\u0e0b\u0e25\u0e25\u0e4c<\/strong><\/span><\/h2>\n
 \u0e40\u0e23\u0e32\u0e2a\u0e32\u0e21\u0e32\u0e23\u0e16\u0e2a\u0e23\u0e49\u0e32\u0e07\u0e42\u0e14\u0e22\u0e43\u0e0a\u0e49\u0e2d\u0e32\u0e23\u0e4c\u0e01\u0e34\u0e27\u0e40\u0e21\u0e19\u0e15\u0e4c display_numbers<\/strong> \u0e41\u0e25\u0e30 fontsize_number<\/strong> \u0e40\u0e1e\u0e37\u0e48\u0e2d\u0e41\u0e2a\u0e14\u0e07\u0e04\u0e48\u0e32\u0e15\u0e31\u0e27\u0e40\u0e25\u0e02\u0e43\u0e19\u0e41\u0e15\u0e48\u0e25\u0e30\u0e40\u0e0b\u0e25\u0e25\u0e4c\u0e02\u0e2d\u0e07\u0e41\u0e1c\u0e19\u0e17\u0e35\u0e48\u0e04\u0e27\u0e32\u0e21\u0e23\u0e49\u0e2d\u0e19\u0e14\u0e49\u0e27\u0e22\u0e02\u0e19\u0e32\u0e14\u0e15\u0e31\u0e27\u0e2d\u0e31\u0e01\u0e29\u0e23\u0e40\u0e09\u0e1e\u0e32\u0e30:<\/span> <\/p>\n
 library<\/span> (heatmap)\n\n#create heatmap with numerical labels in cells<\/span>\npheatmap(data, display_numbers= TRUE<\/span> , fontsize_number= 12<\/span> )\n<\/span><\/span><\/strong><\/pre>\n
\"\"<\/p>\n
 \u0e2b\u0e21\u0e32\u0e22\u0e40\u0e2b\u0e15\u0e38<\/strong> : \u0e04\u0e48\u0e32\u0e40\u0e23\u0e34\u0e48\u0e21\u0e15\u0e49\u0e19\u0e2a\u0e33\u0e2b\u0e23\u0e31\u0e1a fontsize_number<\/strong> \u0e04\u0e37\u0e2d 8<\/strong><\/span><\/p>\n
 \u0e15\u0e31\u0e27\u0e2d\u0e22\u0e48\u0e32\u0e07\u0e17\u0e35\u0e48 3: \u0e2a\u0e23\u0e49\u0e32\u0e07\u0e41\u0e1c\u0e19\u0e17\u0e35\u0e48\u0e04\u0e27\u0e32\u0e21\u0e23\u0e49\u0e2d\u0e19\u0e14\u0e49\u0e27\u0e22\u0e2a\u0e35\u0e17\u0e35\u0e48\u0e01\u0e33\u0e2b\u0e19\u0e14\u0e40\u0e2d\u0e07<\/strong><\/span><\/h2>\n
 \u0e19\u0e2d\u0e01\u0e08\u0e32\u0e01\u0e19\u0e35\u0e49\u0e40\u0e23\u0e32\u0e22\u0e31\u0e07\u0e2a\u0e32\u0e21\u0e32\u0e23\u0e16\u0e43\u0e0a\u0e49\u0e2d\u0e32\u0e23\u0e4c\u0e01\u0e34\u0e27\u0e40\u0e21\u0e19\u0e15\u0e4c colorRampPalette<\/strong> \u0e40\u0e1e\u0e37\u0e48\u0e2d\u0e23\u0e30\u0e1a\u0e38\u0e2a\u0e35\u0e17\u0e35\u0e48\u0e08\u0e30\u0e43\u0e0a\u0e49\u0e2a\u0e33\u0e2b\u0e23\u0e31\u0e1a\u0e04\u0e48\u0e32\u0e15\u0e48\u0e33 \u0e1b\u0e32\u0e19\u0e01\u0e25\u0e32\u0e07 \u0e41\u0e25\u0e30\u0e2a\u0e39\u0e07\u0e43\u0e19\u0e41\u0e1c\u0e19\u0e17\u0e35\u0e48\u0e04\u0e27\u0e32\u0e21\u0e23\u0e49\u0e2d\u0e19:<\/span> <\/p>\n
 library<\/span> (heatmap)\n\n#create heatmap with custom colors<\/span>\npheatmap(data, color=colorRampPalette(c(\" blue<\/span> \", \" white<\/span> \", \" red<\/span> \"))(20))<\/span><\/span><\/strong> <\/pre>\n
\"\"<\/p>\n
 \u0e02\u0e13\u0e30\u0e19\u0e35\u0e49\u0e04\u0e48\u0e32\u0e15\u0e48\u0e33\u0e08\u0e30\u0e41\u0e2a\u0e14\u0e07\u0e40\u0e1b\u0e47\u0e19 \u0e2a\u0e35\u0e19\u0e49\u0e33\u0e40\u0e07\u0e34\u0e19<\/strong> \u0e04\u0e48\u0e32\u0e01\u0e25\u0e32\u0e07\u0e08\u0e30\u0e41\u0e2a\u0e14\u0e07\u0e40\u0e1b\u0e47\u0e19 \u0e2a\u0e35\u0e02\u0e32\u0e27<\/strong> \u0e41\u0e25\u0e30\u0e04\u0e48\u0e32\u0e2a\u0e39\u0e07\u0e08\u0e30\u0e41\u0e2a\u0e14\u0e07\u0e40\u0e1b\u0e47\u0e19 \u0e2a\u0e35\u0e41\u0e14\u0e07<\/strong><\/span><\/p>\n
 \u0e04\u0e38\u0e13\u0e2a\u0e32\u0e21\u0e32\u0e23\u0e16\u0e23\u0e30\u0e1a\u0e38\u0e2a\u0e35\u0e17\u0e35\u0e48\u0e04\u0e38\u0e13\u0e15\u0e49\u0e2d\u0e07\u0e01\u0e32\u0e23\u0e2a\u0e23\u0e49\u0e32\u0e07\u0e23\u0e30\u0e14\u0e31\u0e1a\u0e2a\u0e35\u0e02\u0e2d\u0e07\u0e04\u0e38\u0e13\u0e40\u0e2d\u0e07\u0e2a\u0e33\u0e2b\u0e23\u0e31\u0e1a\u0e41\u0e1c\u0e19\u0e17\u0e35\u0e48\u0e04\u0e27\u0e32\u0e21\u0e23\u0e49\u0e2d\u0e19\u0e02\u0e2d\u0e07\u0e04\u0e38\u0e13\u0e44\u0e14\u0e49<\/span><\/p>\n
 \u0e41\u0e2b\u0e25\u0e48\u0e07\u0e02\u0e49\u0e2d\u0e21\u0e39\u0e25\u0e40\u0e1e\u0e34\u0e48\u0e21\u0e40\u0e15\u0e34\u0e21<\/strong><\/span><\/h2>\n
 \u0e1a\u0e17\u0e0a\u0e48\u0e27\u0e22\u0e2a\u0e2d\u0e19\u0e15\u0e48\u0e2d\u0e44\u0e1b\u0e19\u0e35\u0e49\u0e08\u0e30\u0e2d\u0e18\u0e34\u0e1a\u0e32\u0e22\u0e27\u0e34\u0e18\u0e35\u0e14\u0e33\u0e40\u0e19\u0e34\u0e19\u0e01\u0e32\u0e23\u0e07\u0e32\u0e19\u0e17\u0e31\u0e48\u0e27\u0e44\u0e1b\u0e2d\u0e37\u0e48\u0e19\u0e46 \u0e43\u0e19 R:<\/span><\/p>\n
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