Bray-curtis farklılığı: tanım ve örnekler
Adını J. Roger Bray ve John Thomas Curtis’ten alan Bray-Curtis farklılığı , iki farklı bölge arasındaki farklılığı ölçmenin bir yoludur.
Ekoloji ve biyolojide genellikle iki alan arasındaki farkı, bu alanlarda bulunan türler açısından ölçmek için kullanılır.
Bray-Curtis farklılığı şu şekilde hesaplanır:
BC ij = 1 – (2*C ij ) / (S i + S j )
Altın:
- C ij : Her bir alanda bulunan türlere ait en düşük değerlerin toplamı.
- S i : i sahasında sayılan toplam örnek sayısı
- S j : j noktasında sayılan toplam örnek sayısı
Bray-Curtis farklılığı her zaman 0 ile 1 arasındadır; burada:
- 0 , iki sitenin hiçbir farklılığının olmadığını gösterir. Başka bir deyişle, her türden tam olarak aynı sayıda türü paylaşıyorlar.
- 1, iki sitenin tamamen farklı olduğunu gösterir. Yani aynı türden hiçbir türü paylaşmazlar.
Aşağıdaki örnek, iki konum için Bray-Curtis farklılığının nasıl hesaplanacağını gösterir.
Örnek: Bray-Curtis farklılığının hesaplanması
Bir botanikçinin dışarı çıkıp iki farklı bölgedeki beş farklı bitki türünün (A, B, C, D ve E) sayısını saydığını varsayalım.
Aşağıdaki tablo topladığı verileri özetlemektedir:
Bu verileri kullanarak Bray-Curtis farklılığını şu şekilde hesaplayabilir:
Bu sayıları Bray-Curtis farklılık formülüne entegre ederek şunu elde ederiz:
- BC ij = 1 – (2*C ij ) / (S i + S j )
- BC ij = 1 – (2*15) / (21 + 24)
- BC ij = 0,33
Bu iki bölge arasındaki Bray-Curtis farklılığı 0,33’tür .
Bray-Curtis farklılığının temel varsayımı
Bray-Curtis farklılığı iki bölgenin boyutlarının eşit olduğunu varsayar.
Bu çok önemli bir varsayımdır, çünkü eğer bir alan diğerinden dört kat daha büyükse, doğal olarak geniş alanda küçük alana göre daha fazla türe sahip olacağız, çünkü kaplanacak alan çok daha fazla.
Bunu açıklamak için, botanikçinin veri topladığı alanlardan birinin diğerinden dört kat daha büyük olduğunu varsayalım:
Alan 1’deki türlerin çok daha yüksek sıklıkta olmasını bekleriz çünkü burası alan 2’den çok daha büyüktür.
Yani Bray-Curtis farklılığını hesapladığımızda oldukça büyük olacaktır. Ancak bu yanıltıcı olabilir çünkü iki site arasındaki fark, bileşimlerinde değil, boyutlarındadır.