Як створити діаграму розсіювання з лінією регресії в r


Часто, коли ми виконуємо просту лінійну регресію, ми хочемо створити діаграму розсіювання, щоб візуалізувати різні комбінації значень x і y.

На щастя, R дозволяє легко створювати хмари точок за допомогою функції plot() . Наприклад:

 #create some fake data
data <- data.frame(x = c(1, 1, 2, 3, 4, 4, 5, 6, 7, 7, 8, 9, 10, 11, 11),
                   y = c(13, 14, 17, 12, 23, 24, 25, 25, 24, 28, 32, 33, 35, 40, 41))

#create scatterplot of data
plot(data$x, data$y)

Діаграма розсіювання в R

Також легко додати лінію регресії до діаграми розсіювання за допомогою функції abline() .

Наприклад:

 #fit a simple linear regression model
model <- lm(y ~ x, data = data)

#add the fitted regression line to the scatterplot
abline(model) 

Діаграма розсіювання з лінією регресії в R

Ми також можемо додати лінії довірчого інтервалу до графіка за допомогою функції predict() :

 #define range of x values
newx = seq(min(data$x),max(data$x),by = 1)

#find 95% confidence interval for the range of x values 
conf_interval <- predict(model, newdata=data.frame(x=newx), interval="confidence",
                         level = 0.95)

#create scatterplot of values with regression line
plot(data$x, data$y)
abline(model)

#add dashed lines (lty=2) for the 95% confidence interval
lines(newx, conf_interval[,2], col="blue", lty=2)
lines(newx, conf_interval[,3], col="blue", lty=2)

Лінія регресії з довірчим інтервалом в R

Або замість цього ми могли б додати лінії інтервалу передбачення на графік, вказавши тип інтервалу у функції predict() :

 #define range of x values
newx = seq(min(data$x),max(data$x),by = 1)

#find 95% prediction interval for the range of x values 
pred_interval <- predict(model, newdata=data.frame(x=newx), interval="prediction" ,
                         level = 0.95)

#create scatterplot of values with regression line
plot(data$x, data$y)
abline(model)

#add dashed lines (lty=2) for the 95% confidence interval
lines(newx, pred_interval[,2], col="red", lty=2)
lines(newx, pred_interval[,3], col="red", lty=2)

Лінія регресії з лініями інтервалу передбачення в R

Нарешті, ми можемо зробити сюжет більш естетично привабливим, додавши назву, змінивши назви осей і змінивши форму окремих точок графіка.

 plot(data$x, data$y,
     main = "Scatterplot of x vs. y", #add title
     pch=16, #specify points to be filled in
     xlab='x', #change x-axis name
ylab='y') #change y-axis name

abline(model, col='steelblue') #specify color of regression line

Лінія регресії з діаграмою розсіювання в R

Додаткові ресурси

У наступних посібниках пояснюється, як виконувати інші типові завдання в R:

Як позначити точки на діаграмі розсіювання в R
Як використовувати функцію джиттера в R для хмар точок

Додати коментар

Ваша e-mail адреса не оприлюднюватиметься. Обов’язкові поля позначені *