Як створити графік залишків у ggplot2 (з прикладом)
Графіки залишків використовуються для оцінки того, чи нормально розподілені залишки регресійної моделі та чи є вони гетероскедастичними .
Щоб створити діаграму залишків у ggplot2, ви можете використовувати наступний базовий синтаксис:
library (ggplot2) ggplot(model, aes(x = .fitted, y = .resid)) + geom_point() + geom_hline(yintercept = 0 )
У наступному прикладі показано, як використовувати цей синтаксис на практиці.
Приклад: створення залишкового графіка в ggplot2
Для цього прикладу ми використаємо набір даних mtcars , вбудований у R:
#view first six rows of mtcars dataset
head(mtcars)
mpg cyl disp hp drat wt qsec vs am gear carb
Mazda RX4 21.0 6 160 110 3.90 2.620 16.46 0 1 4 4
Mazda RX4 Wag 21.0 6 160 110 3.90 2.875 17.02 0 1 4 4
Datsun 710 22.8 4 108 93 3.85 2.320 18.61 1 1 4 1
Hornet 4 Drive 21.4 6 258 110 3.08 3.215 19.44 1 0 3 1
Hornet Sportabout 18.7 8 360 175 3.15 3.440 17.02 0 0 3 2
Valiant 18.1 6 225 105 2.76 3,460 20.22 1 0 3 1
Спочатку ми підберемо регресійну модель, використовуючи mpg як змінну відповіді та qsec як змінну предиктора:
#fit regression model
model <- lm(mpg ~ qsec, data=mtcars)
Далі ми використаємо наступний синтаксис для створення залишкового графіка в ggplot2:
library (ggplot2) #create residual plot ggplot(model, aes(x = .fitted, y = .resid)) + geom_point() + geom_hline(yintercept = 0 )
На осі абсцис відображаються підібрані значення, а на осі у – залишки.
Залишки, здається, випадково розкидані навколо нуля без чіткої моделі, що вказує на те, що припущення гомоскедастичності виконано.
Іншими словами, коефіцієнти регресійної моделі мають бути надійними, і нам не потрібно виконувати будь-які перетворення даних.
Також зауважте, що ми можемо використовувати функцію labs() , щоб додати заголовок і мітки осі до залишкового графіка:
library (ggplot2) #create residual plot with title and axis labels ggplot(model, aes(x = .fitted, y = .resid)) + geom_point() + geom_hline(yintercept = 0 ) + labs(title=' Residual vs. Fitted Values Plot ', x=' Fitted Values ', y=' Residuals ')
Додаткові ресурси
У наступних посібниках пояснюється, як виконувати інші типові завдання в R:
Як обчислити стандартизовані залишки в R
Як обчислити студентські залишки в R
Як створити гістограму залишків у R