Indice de diversité de Shannon : Définition & Exemple

L’ indice de diversité de Shannon (parfois appelé indice de Shannon-Wiener) est un moyen de mesurer la diversité des espèces au sein d’une communauté.

Noté H , cet indice est calculé comme suit :

H = -Σ p _je * ln(p _je )

où:

• Σ : Un symbole grec qui signifie « somme »
• ln : Bûche naturelle
• p _i : La proportion de la communauté entière composée d’espèces i

Plus la valeur de H est élevée, plus la diversité des espèces dans une communauté particulière est élevée. Plus la valeur de H est faible, plus la diversité est faible. Une valeur H = 0 indique une communauté qui ne compte qu’une seule espèce.

L’indice d’équité de Shannon est un moyen de mesurer la régularité des espèces dans une communauté. Le terme « uniformité » fait simplement référence à la similitude des abondances des différentes espèces au sein de la communauté.

Noté E _H , cet indice est calculé comme suit :

E _H = H / ln ( S )

où:

• H : L’indice de diversité de Shannon
• S : Le nombre total d’espèces uniques

Cette valeur va de 0 à 1, où 1 indique une régularité complète.

L’exemple suivant, étape par étape, montre comment calculer l’indice de diversité de Shannon et l’indice d’équité de Shannon pour une communauté donnée.

Étape 1 : Collecter les données

Supposons qu’un biologiste veuille mesurer la diversité des espèces dans une forêt locale. Elle collecte les données suivantes :

Étape 2 : Calculer les proportions

Ensuite, le biologiste peut calculer la proportion de la communauté composée de chaque espèce.

Par exemple, il y a un total de 105 individus et 40 sont classés comme espèce A. Ainsi, l’espèce A représente 40/105 = 0,38 de la communauté totale.

Elle peut effectuer un calcul similaire pour chaque espèce :

Étape 3 : Calculer le log naturel des proportions

Ensuite, elle peut calculer le logarithme naturel de chaque proportion :

Étape 4 : Multipliez les proportions par le log naturel des proportions

Ensuite, elle peut multiplier les proportions par le logarithme naturel des proportions :

Étape 5 : Calculer l’indice de diversité de Shannon

Enfin, elle peut utiliser la formule suivante pour calculer l’indice de diversité de Shannon :

H = -Σ p _je * ln(p _je )

Pour cet exemple, elle peut prendre la somme de la dernière colonne et multiplier par moins un :

L’indice de diversité de Shannon pour cette communauté est de 1,49 .

Elle peut également utiliser la formule suivante pour calculer l’indice d’équité de Shannon :

E _H = H / ln ( S )

Pour cet exemple, il y a S = 5 espèces au total, nous pouvons donc calculer cet indice comme suit :

E _H = 1,49 / ln (5) = 0,92 .

Ressources additionnelles

N’hésitez pas à utiliser ce calculateur d’indice de diversité de Shannon pour calculer automatiquement l’indice de diversité de Shannon pour n’importe quel ensemble de données.