Comment ajouter un intervalle de confiance dans ggplot2 (avec exemple)

Vous pouvez utiliser geom_smooth() pour ajouter des lignes d’intervalle de confiance à un tracé dans ggplot2 :

library(ggplot2)

some_ggplot +
  geom_point() +
  geom_smooth(method=lm)

Les exemples suivants montrent comment utiliser cette syntaxe en pratique avec l’ensemble de données mtcars intégré dans R.

Exemple 1 : Ajouter des lignes d’intervalle de confiance dans ggplot2

Le code suivant montre comment créer un nuage de points dans ggplot2 et ajouter une ligne de meilleur ajustement ainsi que des bandes de confiance à 95 % :

library(ggplot2)

#create scatterplot with confidence bands
ggplot(data=mtcars, aes(x=mpg, y=wt)) +
  geom_point() +
  geom_smooth(method=lm)

La ligne bleue représente la ligne de régression linéaire ajustée et les bandes grises représentent les bandes d’intervalle de confiance à 95 %.

Exemple 2 : Modifier le niveau d’intervalle de confiance

Par défaut, geom_smooth() utilise des bandes de confiance de 95 % mais vous pouvez utiliser l’argument level pour spécifier un niveau de confiance différent.

Par exemple, nous pouvons choisir de créer des bandes de confiance à 90 % :

library(ggplot2)

#create scatterplot with 90% confidence bands
ggplot(data=mtcars, aes(x=mpg, y=wt)) +
  geom_point() +
  geom_smooth(method=lm, level=0.90)

Plus le niveau de confiance que vous utilisez est petit, plus les bandes d’intervalle de confiance seront étroites autour de la ligne de régression.

Exemple 3 : Modifier l’apparence des lignes d’intervalle de confiance

Vous pouvez également utiliser les arguments color et fill pour modifier respectivement la couleur de la ligne de régression et la couleur des bandes d’intervalle de confiance :

library(ggplot2)

#create scatterplot with custom confidence interval lines
ggplot(data=mtcars, aes(x=mpg, y=wt)) +
  geom_point() +
  geom_smooth(method=lm, color='red', fill='lightblue')

La ligne de régression est désormais rouge et les bandes d’intervalle de confiance sont remplies de bleu clair.

Remarque : Vous pouvez trouver la documentation complète de la fonction geom_smooth() ici .

Ressources additionnelles

Les didacticiels suivants expliquent comment effectuer d’autres opérations courantes dans ggplot2 :

Comment changer le titre de la légende dans ggplot2
Comment faire pivoter les étiquettes des axes dans ggplot2
Comment réparer dans R : impossible de trouver la fonction « ggplot »